【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物，具体涉及一种与茄子光半敏型性状紧密连锁的indel分子标记及其应用。
技术介绍
1、花青素是自然界中天然存在的一种水溶性色素，因具有抗氧化活性不仅可作为植物抵抗生物和非生物胁迫的一种保护剂，还可在人体抗糖尿病、抗癌、抗炎、抗菌、抗肥胖以及预防心血管疾病方面发挥一定的药用和保健价值。植物中的花青素含量越多，其栽培和经济价值就越高。
2、花青素是茄子果实的主要呈色物质之一，其合成受光诱导(araguirang andrichter2022)。设施栽培、露地越冬栽培、密植栽培等弱光环境常导致茄子果皮着色不良，严重影响果实品质，是茄子生产中亟待解决的问题。根据茄子果皮着色对光照的依赖性，可将紫色茄子分为“光敏”型、“光半敏”型和“非光敏”型；“光敏”型茄子果皮中花青素合成极易受到光照条件的影响，弱光条件下果皮着色不良或不能着色；“光半敏”型茄子果皮中花青素合成较易受到光照条件的影响，光照不足时果皮易着色不均，形成“阴阳面”；“非光敏”型茄子果皮中花青素合成受光照条件的影响不大，弱光条件下果实仍能正常着色(he etal.2022)。尽管目前已有大量的研究表明smmyb113是茄子果实中花青素合成调控的关键基因(yang et al.2022a,you et al.2022,li et al.2023)，但现有的研究结果仍不能解释黑暗条件下“光半敏”型和“非光敏”型茄子下仍能合成花青素的原因。目前为止，在茄子中对于smmyb113基因的优良等位变异筛选及其分子标记几乎没有报道，这极大阻碍了smmyb113在
技术实现思路
1、为解决上述现有技术存在的问题，本专利技术的目的是提供一种与茄子光半敏型性状紧密连锁的分子标记及其应用，检测smmyb113基因优异等位变异在茄子的苗期快速、高效筛选和鉴定茄子光半敏型性状，加速茄子选育进程。本专利技术开发的与茄子光半敏型性状紧密连锁的分子标记，对于提高茄子果实外观品质，揭示弱光条件下茄子花青素的积累和代谢分子机制具有十分重要的意义。
2、本专利技术第一方面，提供了一种与茄子“半光敏”性状紧密连锁的smmyb113-indel分子标记，所述smmyb113-indel分子标记位于茄子smmyb113启动子区域-200bp处，其核酸序列如seq id no:5所示；
3、所述“半光敏”性状的判定标准为在黑暗或者弱光条件以及果萼下部不见光部位，果皮中能合成少量花青素，且与正常光照条件下果皮颜色差异明显；
4、所述smmyb113-indel分子标记包含10个碱基的插入和5个snp变异。
5、本专利技术第二方面，提供了上述smmyb113-indel分子标记在如下(1)或(2)至少一项中的应用：
6、(1)鉴定茄子果皮花青素合成对光敏感性中的应用；
7、(2)筛选“光半敏”型茄子中的应用。
8、本专利技术第三方面，提供了用于扩增上述smmyb113-indel分子标记的引物对，所述引物对的核酸序列如seq id no.6-seq id no.7所示。
9、本专利技术第四方面，提供了上述引物对在如下(1)-(3)任一项中的应用：
10、(1)鉴定茄子果皮花青素合成对光敏感性；
11、(2)筛选“光半敏”型茄子；
12、(3)制备检测“光半敏”型茄子的试剂盒。
13、本专利技术第五方面，提供了一种检测“光半敏”型茄子的试剂盒，所述试剂盒含有上述引物对。
14、上述试剂盒在筛选“光半敏”型茄子中的应用也属于本专利技术的保护范围。
15、本专利技术第六方面，提供了一种“光半敏”型茄子的分子标记辅助选育方法，所述方法使用上述试剂盒对目标茄子进行分子标记。
16、所述分子标记辅助选育方法，包括如下步骤：
17、(1)利用试剂盒中smmyb113-indel分子标记引物对对待测材料的基因组dna进行pcr扩增，得到pcr扩增产物；
18、(2)page凝胶电泳检测pcr扩增产物的多态性，根据电泳检测结果判断待测材料中茄子光敏类型。
19、所述电泳检测结果判定标准为：当扩增产物片段为66bp单一片段时，则待检测植株为纯合的“光敏”或“非光敏”型茄子；当扩增产物片段为66bp和76bp两条片段时，则待检测植株为杂合的“光半敏”型茄子；当扩增产物片段为76bp单一片段时，则待检测植株为纯合的“光半敏”型茄子。
20、本专利技术的有益效果：
21、1.本专利技术提供的indel区域，位于茄子smmyb113启动子区域-200bp处，且多态性为
22、是否包含10个碱基的插入和5个snp变异，当包含时，为“光半敏”型茄子。利用本专利技术所述的indel区域，能将“光半敏”型茄子与“光敏”和“非光敏”型茄子分开。
23、2.本专利技术采用smmyb113-indel分子标记引物对检测茄子中与花青素合成相关的smmyb113基因的等位变异，只需通过简单的dna提取、pcr特异性扩增、page凝胶电泳或琼脂糖凝胶电泳即可完成对样品的鉴别，便于检测和筛选“光半敏”型茄子品种或品系，可大大加快茄子高品质品种的选育进程。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种与茄子“半光敏”性状紧密连锁的SmMYB113-Indel分子标记，其特征在于，所述SmMYB113-Indel分子标记位于茄子SmMYB113启动子区域-200bp处，其核酸序列如SEQ IDNO:5所示。
2.权利要求1所述的SmMYB113-Indel分子标记在如下(1)或(2)至少一项中的应用：
3.用于扩增权利要求1所述的SmMYB113-Indel分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对的核酸序列如SEQ ID NO.6-SEQ ID NO.7所示。
4.权利要求3所述的引物对在如下(1)-(3)任一项中的应用：
5.一种检测“光半敏”型茄子的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒含有权利要求3所述的引物对。
6.权利要求5所述的试剂盒在筛选“光半敏”型茄子中的应用。
7.一种“光半敏”型茄子的分子标记辅助选育方法，其特征在于，所述方法使用权利要求5所述的试剂盒对目标茄子进行分子标记。
8.根据权利要求6所述的分子标记辅助选育方法，其特征在于，包括如下步骤：
9.根据权利要
...【技术特征摘要】
1.一种与茄子“半光敏”性状紧密连锁的smmyb113-indel分子标记，其特征在于，所述smmyb113-indel分子标记位于茄子smmyb113启动子区域-200bp处，其核酸序列如seq idno:5所示。
2.权利要求1所述的smmyb113-indel分子标记在如下(1)或(2)至少一项中的应用：
3.用于扩增权利要求1所述的smmyb113-indel分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对的核酸序列如seq id no.6-seq id no.7所示。
4.权利要求3所述的引物对在如下(1)-(3)任一项中的应用：
5.一种检测“光半敏”型茄子的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒含有权...
【专利技术属性】
技术研发人员：李静，杨凤娟，孙如意，辛宇，谷端银，邱正坤，
申请(专利权)人：山东农业大学，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。