System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 美洲黑杨lncRNA分段基因组及其分段方法和应用技术_技高网

美洲黑杨lncRNA分段基因组及其分段方法和应用技术

技术编号:40194492 阅读:5 留言:0更新日期:2024-01-26 23:57
本发明专利技术公开了美洲黑杨lncRNA分段基因组及其分段方法和应用,属于植物基因工程技术领域。本发明专利技术对美洲黑杨lncRNA‑MSL分段,包括MSL‑1序列、MSL‑2序列和MSL‑3序列,其核苷酸序列分别对应SEQ ID NO.1‑3。与野生型的四强雄蕊相比,MSL‑1的转基因植株有7‑8个多分枝雄蕊或具有多个花药的雄蕊;MSL‑2和MSL‑3的转基因植株与MSL‑1中异常雄蕊的表型类似。因此,转基因研究表明,MSL‑1、MSL‑2和MSL‑3分段序列可以促进雄蕊的发育。转基因植株中MSL序列的相对表达水平:MSL‑3>MSL‑2>MSL‑1。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于植物基因工程,更具体地说,涉及美洲黑杨lncrna分段基因组及其分段方法和应用。


技术介绍

1、lncrna(long non-coding rna),即长链非编码rna,是一类长度大于200个核苷酸,但不编码蛋白质的rna。lncrna序列保守性较低,具有明显的时空表达特异性,lncrna可以调控植物的生长发育,如,生物量的提高,促进根系的发育,影响植物对生长素的响应,植物的开花时间、花粉发育等,除此之外,lncrna在控制植物各种非生物应激中起着至关重要的作用,包括干旱,热,冷效应以及重金属毒性;同样,在动物中,也已经报道了与酵母和动物繁殖相关的一系列过程中的lncrna功能,包括性别测定,细胞减数分裂,精子发生等。

2、msl是存在于美洲黑杨y染色体上特异的基因,是美洲黑杨性别决定基因。msl只在雄花芽中表达,在雌花芽中不表达,且表达量极低。rna-seq测序结果表明,msl不编码蛋白基因,而在lncrna-seq的测序结果中,msl在转录本中有表达,因此msl主要通过产生lncrna发挥作用,拟南芥转基因结果表明msl能够促进雄蕊发育,而不影响雌蕊发育。lncrnas在多个调控水平具有作用,可以直接或者间接与dna、rna和蛋白质相互作用。从一定程度来说,基于功能解析lncrna的调控机制,是lncrna研究的热点与难点。因此,研究msl-lncrnas的功能域有助于进一步了解msl在性别决定中的作用,为其分子机制的研究奠定基础。


技术实现思路

1、针对现有技术存在的上述问题,本专利技术所要解决的技术问题在于提供美洲黑杨lncrna分段基因组,用于构建转基因植株;本专利技术所要解决的另一技术问题在于提供美洲黑杨lncrna分段基因组的分段方法,用于构建美洲黑杨lncrna分段基因;本专利技术还所要解决的技术问题在于提供美洲黑杨lncrna分段基因组的应用,用于获得雄蕊发育的新种质。

2、为了解决上述技术问题,本专利技术所采用的技术方案如下:

3、美洲黑杨msl-lncrnas分段基因组,包括msl-1序列、msl-2序列和msl-3序列,其核苷酸序列分别对应seq id no.1-3。

4、美洲黑杨msl-lncrna分段基因组的分段方法,使用seqhunter软件将msl序列在美洲黑杨基因组上进行比对分析,e值设置为10-5,结果输出为txt格式;使用rstudio软件将比对结果进行可视化,根据同源序列的丰度,将其分为三段,即msl-1序列、msl-2序列和msl-3序列。

5、美洲黑杨lncrna分段基因组在促进植物雄蕊发育形成多分枝雄蕊或多花药雄蕊中的应用。

6、所述植物为拟南芥。

7、具体步骤包括:

8、1)分别构建美洲黑杨lncrna分段基因组的载体;

9、2)将所构建的美洲黑杨lncrna分段基因组的载体分别转化到拟南芥花序中;

10、3)培育筛选得到雄蕊显著发育的拟南芥植株。

11、所述的载体为植物表达载体。

12、所述的植物表达载体为p2301-35s-msl-1、p2301-35s-msl-2、p2301-35s-msl-3。

13、美洲黑杨lncrna分段基因msl-1序列在促进植物雄蕊发育形成多分枝雄蕊或多花药雄蕊中的应用。

14、美洲黑杨lncrna分段基因msl-2在促进植物雄蕊发育形成多分枝雄蕊或多花药雄蕊中的应用。

15、美洲黑杨lncrna分段基因msl-3在促进植物雄蕊发育形成多分枝雄蕊或多花药雄蕊中的应用。

16、相比于现有技术,本专利技术的有益效果为:

17、本专利技术使用seqhunter软件将msl序列在美洲黑杨基因组上进行比对分析,e值设置为10-5,结果输出为txt格式;使用rstudio软件将比对结果进行可视化,根据同源序列的丰度,将其分为三段,即msl-1序列、msl-2序列和msl-3序列。在此基础上构建载体p2301-35s-msl-1、p2301-35s-msl-2、p2301-35s-msl-3,转入拟南芥中,得到抗性转基因植株。与野生型的四强雄蕊相比,msl-1的转基因植株有7-8个多分枝雄蕊或具有多个花药的雄蕊;msl-2和msl-3的转基因植株与msl-1中异常雄蕊的表型类似。因此,转基因研究表明,msl-1、msl-2和msl-3分段序列可以促进雄蕊的发育。转基因植株中msl序列的相对表达水平:msl-3>msl-2>msl-1。

本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.美洲黑杨lncRNA分段基因组,包括MSL-1序列、MSL-2序列和MSL-3序列,其核苷酸序列分别对应SEQ ID NO.1-3。

2.权利要求1所述的美洲黑杨lncRNA分段基因组的分段方法,其特征在于,使用SeqHunter软件将MSL序列在美洲黑杨基因组上进行比对分析,E值设置为10-5,结果输出为txt格式;使用RStudio软件将比对结果进行可视化,根据同源序列的丰度,将其分为三段,即MSL-1序列、MSL-2序列和MSL-3序列。

3.权利要求1所述的美洲黑杨lncRNA分段基因组在促进植物雄蕊发育形成多分枝雄蕊或多花药雄蕊中的应用。

4.根据权利要求3所述的美洲黑杨lncRNA分段基因组在促进雄蕊的发育中的应用,其特征在于,所述植物为拟南芥。

5.根据权利要求3所述的美洲黑杨lncRNA分段基因组在促进雄蕊的发育中的应用,其特征在于,具体步骤包括:

6.根据权利要求5所述的美洲黑杨lncRNA分段基因组在促进雄蕊的发育中的应用,其特征在于,所述的载体为植物表达载体。

7.根据权利要求6所述的美洲黑杨lncRNA分段基因组在促进雄蕊的发育中的应用,其特征在于,所述的植物表达载体为p2301-35S-MSL-1、p2301-35S-MSL-2、p2301-35S-MSL-3。

8.权利要求1所述的美洲黑杨lncRNA分段基因MSL-1序列在促进植物雄蕊发育形成多分枝雄蕊或多花药雄蕊中的应用。

9.权利要求1所述的美洲黑杨lncRNA分段基因MSL-2在促进植物雄蕊发育形成多分枝雄蕊或多花药雄蕊中的应用。

10.权利要求1所述的美洲黑杨lncRNA分段基因MSL-3在促进植物雄蕊发育形成多分枝雄蕊或多花药雄蕊中的应用。

...

【技术特征摘要】

1.美洲黑杨lncrna分段基因组,包括msl-1序列、msl-2序列和msl-3序列,其核苷酸序列分别对应seq id no.1-3。

2.权利要求1所述的美洲黑杨lncrna分段基因组的分段方法,其特征在于,使用seqhunter软件将msl序列在美洲黑杨基因组上进行比对分析,e值设置为10-5,结果输出为txt格式;使用rstudio软件将比对结果进行可视化,根据同源序列的丰度,将其分为三段,即msl-1序列、msl-2序列和msl-3序列。

3.权利要求1所述的美洲黑杨lncrna分段基因组在促进植物雄蕊发育形成多分枝雄蕊或多花药雄蕊中的应用。

4.根据权利要求3所述的美洲黑杨lncrna分段基因组在促进雄蕊的发育中的应用,其特征在于,所述植物为拟南芥。

5.根据权利要求3所述的美洲黑杨lncrna分段基因组在促进雄...

【专利技术属性】
技术研发人员:毛金燕李淑娴
申请(专利权)人:南京林业大学
类型:发明
国别省市:

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1