用于多部分分子碎片确定和评分的系统和方法技术方案

技术编号:40115215 阅读:35 留言:0更新日期:2024-01-23 19:47
在一个方面中,用于确定大分子的预期分解产物的计算机实现的方法包括将大分子的至少一个残基定义为具有核和至少一个连接基,其中所述至少一个连接基被定义为经由一个或多个化学键彼此偶联的两个或更多个结构单元的序列。在大分子例如响应于对其施加的能量而经历分解时,如果有所述至少一个连接基的结构单元之间以及相邻残基之间的一个或多个预期键分解的话,可以利用数字数据处理器来确定该一个或多个预期键分解以便预测大分子的预期分解产物。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本教导一般地涉及用于确定各种分子(诸如寡核苷酸、肽等之类)的预期分解产物的方法和系统。


技术介绍

1、质谱(ms)是一种用于确定测试化学物质的结构的分析技术,具有定性应用和定量应用两者。ms可以用于识别未知化合物、识别分子中的原子元素、通过观察化合物的碎片来确定化合物的结构,以及对混合样品中特定化学化合物的量进行定量。质谱仪检测作为离子的化学实体,使得在采样过程期间必须发生分析物到带电离子的转化。

2、ms谱正越来越多地用于确定肽和寡核苷酸的结构。例如,合成寡核苷酸在治疗应用和研究应用中的使用正在迅速推进。对这样的合成寡核苷酸的残基序列的确认对于确保这些应用中采用的寡核苷酸事实上的确具有预期的残基序列是关键的。


技术实现思路

1、在一个方面中,公开了一种用于确定具有彼此键合的多个残基的大分子的预期分解产物的计算机实现的方法,该方法包括将那些残基中的至少一个残基定义为具有核和至少一个连接基,其中所述至少一个连接基被定义为经由一个或多个化学键彼此偶联的两个或更多个结构单元的组装。大分子可以被表示为残基本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于确定具有彼此键合的多个残基的至少一种大分子的预期分解产物的计算机实现的方法,包括:

2.根据权利要求1所述的计算机实现的方法,其中所述大分子响应于向其施加能量而经历分解。

3.根据权利要求2所述的计算机实现的方法,其中所述能量是经由化学反应、粒子碰撞和由辐射源生成的辐射中的任一者生成的。

4.根据权利要求1所述的计算机实现的方法,其中所述连接基结构单元中的至少一个连接基结构单元包括经由一个或多个化学键彼此键合的多个原子。

5.根据权利要求4所述的计算机实现的方法,其中所述数字数据处理器被配置为确定在所述结构单元中的所述至少一个结...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种用于确定具有彼此键合的多个残基的至少一种大分子的预期分解产物的计算机实现的方法,包括:

2.根据权利要求1所述的计算机实现的方法,其中所述大分子响应于向其施加能量而经历分解。

3.根据权利要求2所述的计算机实现的方法,其中所述能量是经由化学反应、粒子碰撞和由辐射源生成的辐射中的任一者生成的。

4.根据权利要求1所述的计算机实现的方法,其中所述连接基结构单元中的至少一个连接基结构单元包括经由一个或多个化学键彼此键合的多个原子。

5.根据权利要求4所述的计算机实现的方法,其中所述数字数据处理器被配置为确定在所述结构单元中的所述至少一个结构单元的所述多个原子之间形成的所述化学键的单独地或组合地预期键分解,以用于确定所述预期分解产物。

6.根据前述权利要求中任一项所述的计算机实现的方法,其中所述残基中的所述至少一个残基的所述核被表示为彼此形成化学键的至少两个结构单元的序列。

7.根据权利要求6所述的计算机实现的方法,其中如果有所述核结构单元之间的化学键的一个或多个预期分解的话,所述数字数据处理器还被配置为确定所述核结构单元之间的化学键的一个或多个预期分解,以及使用所述预期核分解,以及如果有所述预期连接基键分解的话,还使用所述预期连接基键分解,以确定所述大分子的所述预期分解产物。

8.根据前述权利要求中任一项所述的计算机实现的方法,其中所述大分子包括寡核苷酸。

9.根据前述权利要求中任一项所述的计算机实现的方法,其中所述核结构单元包括碱基和糖。

10.根据权利要求9所述的计算机实现的方法,其中所述碱基包括非标准碱基。

11.根据前述权利要求中任一项所述的计算机实现的方法,其中所述连接基结构单元包括含...

【专利技术属性】
技术研发人员:L·伯顿C·卡尔克纳E·杜乔斯拉夫
申请(专利权)人:DH科技发展私人贸易有限公司
类型:发明
国别省市:

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