【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术一般性地涉及纳米孔的用途,特别是通过纳米孔捕获对分子(例如生物分子,如rna或蛋白质)进行结构分析。
技术介绍
1、rna的功能多样性部分源于它能折叠成复杂的三级结构的能力,这种三级结构可以与配体特异性结合以调节细胞活动1,2。已发现了rna的许多新生物学作用3,4,使得对测定rna三级结构的需求日益增长。包括x射线晶体学5和nmr波谱6,7在内的经典结构生物学技术对rna三级结构测定做出了最大贡献,尤其是那些具有小rna结构的8。作为补充,冷冻电镜(cryoem)在揭示较大(>50kda)rna分子的结构方面发挥着越来越重要的作用9,10。诸如单分子共振能量转移(smfret)11和单分子力谱12等新兴技术也已应用于在分子水平上探测rna结构和相互作用动力学。然而,需要高端设备并进行费力的样品制备,并且还存在干扰rna结构内非共价相互作用的风险。因此,直接探究原生态rna的三级结构仍然是一项挑战。
2、rna结构可以通过固态纳米孔进行探测13-17,并且临床应用,例如定量检测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2
...【技术保护点】
1.在纳米孔系统中表征分析物的方法,其中所述纳米孔系统包含设置在将第一导电液体介质与第二导电液体介质隔开的膜中的蛋白质纳米孔,其中所述蛋白质纳米孔是MspA、MspA同源物或其变体,其中所述分析物具有构象,并且具有所述构象的分析物可以容纳在所述MspA、所述MspA同源物或其变体的前庭中,但不能移位通过所述MspA、所述MspA同源物或其变体,所述方法包含:
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述分析物选自由以下组成的组:核酸,蛋白质,多糖,聚合物,酶,以及核酸、蛋白质、肽、多糖、聚合物、酶和能够与它们相互作用的试剂的复合物。
3.根据权利要求
...【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.在纳米孔系统中表征分析物的方法,其中所述纳米孔系统包含设置在将第一导电液体介质与第二导电液体介质隔开的膜中的蛋白质纳米孔,其中所述蛋白质纳米孔是mspa、mspa同源物或其变体,其中所述分析物具有构象,并且具有所述构象的分析物可以容纳在所述mspa、所述mspa同源物或其变体的前庭中,但不能移位通过所述mspa、所述mspa同源物或其变体,所述方法包含:
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述分析物选自由以下组成的组:核酸,蛋白质,多糖,聚合物,酶,以及核酸、蛋白质、肽、多糖、聚合物、酶和能够与它们相互作用的试剂的复合物。
3.根据权利要求2所述的方法,其中所述核酸选自由以下组成的组:lmw rna,核酸双链体,适体,核酶或具有吻环、三向接合、假结、扭结转角或g-四链体结构的核酸。
4.根据权利要求3所述的方法,其中所述lmw rna包含具有突出端或平端的sirna、trna、mirna和/或rrna。
5.根据权利要求3所述的方法,其中所述核酸双链体具有突出端或平端。
6.根据权利要求3所述的方法,其中所述核酸双链体由mirna和核酸探针组成,并且所述核酸探针是rna、dna或核酸类似物。
7.根据权利要求2所述的方法,其中所述蛋白质分析物选自由以下组成的组:带正电荷的、中性的或带负电荷的。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的方法,其中所述分析物包含两种或更多种不同的分析物,并且这些分析物的表征在一次测量中完成。
9.根据权利要求1-8中任一项所述的方法,其中步骤iii)包含将所述测试电流模式与选自由以下组成的组的至少一种特征相关联:存在或不存在所述分析物、所述分析物的身份、所述分析物的序列、所述分析物中的突变、所述分析物的构象、所述分析物的局部结构、所述分析物的含量、所述分析物的总体尺寸、所述分析物的电荷和极性。
10.根据权利要求1所述的方法,其中所述分析物是通过靶分子和辅助分子的组合形成的复合物。
11.根据权利要求10所述的方法,其中步骤iii)包含将所述测试电流模式与所述靶分子的至少一种特征相关联。
12.用于在纳米孔系统中表征分析物和试剂之间相互作用的方法,其中所述纳米孔系统包含设置在将第一导电液体介质与第二导电液体介质隔开的膜中的蛋白质纳米孔,其中所述蛋白质纳米孔是mspa、mspa同源物或其变体,其中所述分析物具有构象,并且具有所述构象的分析物可以容纳在所述mspa、所述mspa同源物或其变体的前庭中,但不能移位通过所述mspa、所述mspa同源物或其变体,所述方法包含:
13.用于在纳米孔系统中表征能够与分析物相互作用的试剂的方法,其中所述纳...
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