【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及医学领域，尤其涉及一种hiv序列质控方法、设备及存储介质。
技术介绍
1、由于hiv（感染艾滋病病毒）基因组的高度变异性和复杂性，序列分析过程中经常会出现序列质量问题，影响序列数据的准确性和可靠性。利用序列质控工具对hiv序列数据进行质量检查和修复，能够提高数据质量和准确性，为后续分析提供更可靠的基础数据。
2、目前常用的hiv序列的质控内容主要包括输出待质控hiv序列的长度、混合碱基比例、超突变情况、终止密码子突变情况、移码突变情况、非常规突变（即突变频率非常低的突变）。但是，常规突变筛选+注释软件（mummer和annovar）并不能处理带有混合碱基的序列，不适用于hiv序列的分析，无法实现对移码突变、终止密码子突变、非常规突变的质控。
3、本专利技术旨在提供一种可替代的hiv序列质控方案，实现对密码子突变情况、移码突变情况、非常规突变的计算。
技术实现思路
1、本专利技术实施例提供一种hiv序列质控方法、设备及存储介质，用以至少实现对密码子突变情...
【技术保护点】
1.一种HIV序列质控方法，其特征在于，所述HIV序列质控方法包括：
2.根据权利要求1所述的HIV序列质控方法，其特征在于，所述根据每行中两个序列的碱基或空位对应的位置序号及两个序列的碱基和空位的组合关系，对待质控HIV序列进行质量质控，包括：对于任一行的两个序列：
3.根据权利要求2所述的HIV序列质控方法，其特征在于，所述对待质控HIV序列进行质量质控包括：
4.根据权利要求1所述的HIV序列质控方法，其特征在于，所述根据每行中两个序列的碱基或空位对应的位置序号及两个序列的碱基和空位的组合关系，对待质控HIV序列进行质量质控，...
【技术特征摘要】
1.一种hiv序列质控方法，其特征在于，所述hiv序列质控方法包括：
2.根据权利要求1所述的hiv序列质控方法，其特征在于，所述根据每行中两个序列的碱基或空位对应的位置序号及两个序列的碱基和空位的组合关系，对待质控hiv序列进行质量质控，包括：对于任一行的两个序列：
3.根据权利要求2所述的hiv序列质控方法，其特征在于，所述对待质控hiv序列进行质量质控包括：
4.根据权利要求1所述的hiv序列质控方法，其特征在于，所述根据每行中两个序列的碱基或空位对应的位置序号及两个序列的碱基和空位的组合关系，对待质控hiv序列进行质量质控，包括：对于任一行的两个序列：
5.根据权利要求1所述的hiv序列质控方法，其特征在于，所述根据每行中两个序列的碱基或空位对应的位置序号及两个序列的碱基和空位的组合关系，对待质控hiv序列进行质量质控，包括：对于任一行的两个序列：
6.根据权利要求5所述的hiv序列质控方法，其特征在于，所述输出与当前行碱基属于同一个...
【专利技术属性】
技术研发人员：吴林寰，曹丕，范国梅，卢键，张荐辕，
申请(专利权)人：中国科学院微生物研究所，
类型：发明
国别省市：
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