一种山羊C3H1orf226基因插入或缺失(InDel)标记的检测方法及其应用技术

本发明专利技术公开一种山羊C3H1orf226基因插入或缺失(InDel)标记的繁殖性状早期选择的应用。以待测山羊全基因组DNA为模板，通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳，鉴定山羊C3H1orf226基因NC_030810.1:g.112753708‑112753709位插入或缺失(InDel)多态性位点的基因型。本发明专利技术能够简单、快速、低成本、精确地检测所述插入或缺失多态性位点的基因型，检测的插入或缺失(InDel)多态性位点能够作为山羊产羔数的分子标记位点，从而加快建立产羔数性状优良的山羊种群，提高良种选育速度。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物技术与家畜育种领域，涉及c3h1orf226基因nc_030810.1:g.112753708-112753709位15-bp插入或缺失(indel)多态性的检测及利用相应的分子标记进行山羊早期繁殖性状选择。

技术介绍

1、动物育种技术主要包括以表型和表型值为基础的常规育种技术以及以dna多态为基础的分子育种技术。作为分子育种技术体系的重要组成部分，标记辅助选择(marker-assisted selection，mas)育种技术根据与遗传性状显著相关的dna标记进行性状选择，通过在dna水平上分析个体的遗传组成，实现对基因型的直接选择，提高育种目标的定向性。该方法在早期选择、无损害性状评价和选择及提高回交育种效率等方面具有优越性。寻找重要功能基因、筛查重要基因遗传变异位点，并分析重要功能基因遗传变异位点与生长性状的相关性，是标记辅助选择技术应用的前提和关键。

2、插入或缺失多态性(insertion/deletion,indel)是指dna序列上核苷酸片段的插入或缺失而引起的dna序列的改变，插入或缺失片段的长度在1-50b本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种山羊C3H1orf226基因插入或缺失(InDel)多态性的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述一种山羊C3H1orf226基因插入或缺失(InDel)多态性的检测方法，其特征在于：所述PCR采用的扩增引物对为：

3.根据权利要求1所述一种山羊C3H1orf226基因插入或缺失(InDel)多态性的检测方法，其特征在于：所述PCR采用的反应程序为：95℃预变性5min；94℃变性30s，68℃退火30s，72℃延伸20s，18个循环，每循环后退火温度减1℃；50℃退火30s，72℃延伸20s，30个循环；72℃延伸10min。...

【技术特征摘要】

1.一种山羊c3h1orf226基因插入或缺失(indel)多态性的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述一种山羊c3h1orf226基因插入或缺失(indel)多态性的检测方法，其特征在于：所述pcr采用的扩增引物对为：

3.根据权利要求1所述一种山羊c3h1orf226基因插入或缺失(indel)多态性的检测方法，其特征在于：所述pcr采用的反应程序为：95℃预变性5min；94℃变性30s，68℃退火30s，72℃延伸20s，18个循环，每循环后退火温度减1℃；50℃退火30s，72℃延伸20s，30个循环；72℃延伸10min。

4.根据权利要求1所述一种山羊c3h1orf226基因插入或缺失(indel)多态性的检测方法，其特征在于：所述琼脂糖凝胶电泳采用质量浓度为3.5％的琼脂糖凝胶。

5.根据权利要求1所述一种山羊c3h1orf226基因插入或缺失(indel)多态性的检测方法，其特征在于：根据琼脂糖凝胶电泳结果，所述c3h1orf226基因插入或缺失多态性位点的插入/插入基因型表现为277b...

【专利技术属性】
技术研发人员：蓝贤勇，白洋洋，潘传英，薄迪迪，潘晔君，李嘉鑫，王喜宏，朱海鲸，屈雷，杜书增，
申请(专利权)人：西北农林科技大学，
类型：发明
国别省市：