一种易于铜死亡的肝内胆管癌患者的精准诊断模型的构建方法及其应用技术

技术编号:40043315 阅读:27 留言:0更新日期:2024-01-16 20:04
本发明专利技术提供了一种易于铜死亡的肝内胆管癌患者的精准诊断模型的构建方法及其应用,本发明专利技术先收集多中心肝内胆管癌患者的组织mRNA测序数据,以及泛程序性死亡(泛PCD)通路基因集;再基于泛PCD通路基因集进行训练数据集的单样本基因集富集分析(ssGSEA),基于ssGSEA分析结果进行无监督聚类分析,从而筛选得到易于铜死亡的肝内胆管癌患者;通过加权基因共表达网络分析和机器学习算法进行易于铜死亡的肝内胆管患者的关键基因的筛选;最后基于关键基因构建易于铜死亡的肝内胆管癌患者的精准诊断模型。本发明专利技术构建的模型有助于临床医生对易于铜死亡的肝内胆管癌亚型进行早期预测,可指导临床医生为易于铜死亡的肝内胆管癌患者提供积极且精准的诊疗方案。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物医学,具体涉及一种易于铜死亡的肝内胆管癌患者的精准诊断模型的构建方法及其应用


技术介绍

1、肝内胆管癌(intrahepatic cholangiocarcinoma,icc)是一种起源于次级胆管及其分支上皮的腺癌,约占原发性肝癌的20%,仅次于肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,hcc)。icc起病隐匿,且极易侵犯肝周器官、组织、神经和淋巴结,因而大多数患者在诊断时通常往往处于疾病晚期阶段,彼时已缺乏有效的治疗手段。尽管icc的治疗方法(肝切除术、放化疗、免疫治疗和靶向治疗等)在过去几十年中发展迅速,接受治疗的icc患者的1年生存率有所提高,但5年生存率依旧不如意(仅20%-40%),远比接受治疗的hcc患者预后差(50%-70%)。近年来,精准医疗的概念受到越来越多的关注。每个icc患者在病因、发病机制、免疫组化特征等方面都有巨大的差异。针对上述情况,急需精准的诊疗策略以提高icc的远期生存率。程序性细胞死亡(programmed cell death,pcd)主要包括凋亡、自噬、铁死亡、焦亡、坏死性凋亡和铜死本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种易于铜死亡的肝内胆管癌患者的精准诊断模型的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤四中,从交集基因中筛选出易于铜死亡的肝内胆管癌患者的关键基因具体为:

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,肝内胆管癌患者的精准诊断模型表示如下:评分=CASP1基因表达量*13.2+CD274基因表达量*57.5+GZMB基因表达量*11.1+DAPP1基因表达量*10.5+EPSTI1基因表达量*9.7-44.7,评分越低,表示患者易于铜死亡的可能性越高。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,还包括基于...

【技术特征摘要】

1.一种易于铜死亡的肝内胆管癌患者的精准诊断模型的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤四中,从交集基因中筛选出易于铜死亡的肝内胆管癌患者的关键基因具体为:

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,肝内胆管癌患者的精准诊断模型表示如下:评分=casp1基因表达量*13.2+cd274基因表达量*57.5+gzmb基因表达量*11.1+dapp1基因表达量*10.5+epsti1基因表达量*9.7-44.7,评分越低,表示患者...

【专利技术属性】
技术研发人员:梁霄徐俊杰王雅丽沈泽锋蔡经纬陶力野郑俊浩潘昊宇林凯南刘洋李世豪
申请(专利权)人:浙江大学医学院附属邵逸夫医院
类型:发明
国别省市:

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