【技术实现步骤摘要】
本公开的示例实施例总体涉及计算机领域，特别地涉及生成配体分子的方法、装置、电子设备和计算机可读存储介质。
技术介绍
1、生物分子之间的相互作用是实现其生物活性的重要基础。例如，人体可以产生抗体蛋白与入侵的病毒结合从而抑制疾病。在生物制药研究中，可以通过分析那些已知可以互相结合的分子来理解分子间相互作用的物理、化学机制，从而帮助设计出可以与一些特定靶点相结合的新型药物分子。例如，可以确定与靶点蛋白相结合的配体分子，进而基于配体分子来进行药物设计。因此，如何高效地确定能够与靶点蛋白相结合的配体分子是目前需要解决的问题之一。
技术实现思路
1、在本公开的第一方面，提供了一种用于生成配体分子的方法。该方法包括：通过分解针对目标靶点的参考配体分子，确定一组初始臂；基于一组初始臂，生成一组候选配体分子；通过分解一组候选配体分子中的每个候选配体分子，确定与一组初始臂中的每个初始臂对应的一组候选臂；从一组候选臂中确定针对每个初始臂的目标候选臂，以确定一组目标候选臂；以及基于一组目标候选臂，生成针对目标靶点的一组配体分子。
2、在本公开的第二方面，提供了一种用于构建配体生成模型的方法。该方法包括：获取靶点配体分子对，靶点配体分子对包括训练靶点和对应的训练配体分子；通过分解训练配体分子，确定一组训练臂；基于一组训练臂的一组臂特征表示，更新训练配体分子中与一组训练臂对应的多个原子的原子特征表示；基于经更新的原子特征表示，确定靶点配体分子对的目标特征表示；以及利用靶点配体分子对的目标特征表示，
3、在本公开的第三方面，提供了一种用于生成配体分子的装置。该装置包括：第一分解模块，被配置为通过分解针对目标靶点的参考配体分子，确定一组初始臂；第一生成模块，被配置为基于一组初始臂，生成一组候选配体分子；第二分解模块，被配置为通过分解一组候选配体分子中的每个候选配体分子，确定与一组初始臂中的每个初始臂对应的一组候选臂；第一确定模块，被配置为从一组候选臂中确定针对每个初始臂的目标候选臂，以确定一组目标候选臂；以及第二生成模块，被配置为基于一组目标候选臂，生成针对目标靶点的一组配体分子。
4、在本公开的第四方面，提供了一种用于构建配体生成模型的装置。该装置包括：第一获取模块，被配置为获取靶点配体分子对，靶点配体分子对包括训练靶点和对应的训练配体分子；第三分解模块，被配置为通过分解训练配体分子，确定一组训练臂；特征更新模块，被配置为基于一组训练臂的一组臂特征表示，更新训练配体分子中与一组训练臂对应的多个原子的原子特征表示；第二确定模块，被配置为基于经更新的原子特征表示，确定靶点配体分子对的目标特征表示；以及模型训练模块，被配置为利用靶点配体分子对的目标特征表示，训练配体生成模型。
5、在本公开的第五方面，提供了一种电子设备。该设备包括至少一个处理单元；以及至少一个存储器，至少一个存储器被耦合到至少一个处理单元并且存储用于由至少一个处理单元执行的指令。指令在由至少一个处理单元执行时使电子设备执行第一方面或第二方面的方法。
6、在本公开的第六方面，提供了一种计算机可读存储介质。介质上存储有计算机程序，计算机程序被处理器执行时实现第一方面或第二方面的方法。
7、应当理解，该部分中所描述的内容并非旨在限定本公开的实施例的关键特征或重要特征，也不用于限制本公开的范围。本公开的其它特征将通过以下的描述而变得容易理解。
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1.一种生成配体分子的方法，包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中基于所述一组初始臂生成一组候选配体分子包括：
3.根据权利要求1所述的方法，其中所述参考配体分子包括：
4.根据权利要求1所述的方法，其中确定所述一组初始臂包括：
5.根据权利要求1所述的方法，其中从所述一组候选臂中确定针对每个初始臂的目标候选臂包括：
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述性质包括以下至少一项：亲和力、类药性以及可合成性。
7.根据权利要求1所述的方法，其中所述一组候选配体分子为第一组候选配体分子，所述一组候选臂为第一组候选臂，并且基于所述一组目标候选臂生成针对所述目标靶点的一组配体分子包括：
8.根据权利要求7所述的方法，其中所述预设条件包括：
9.一种构建配体生成模型的方法，包括：
10.根据权利要求9所述的方法，其中通过分解所述训练配体分子确定一组训练臂包括：
11.根据权利要求9所述的方法，还包括，通过以下过程构建所述一组训练臂中的第一训练臂的第一臂特征表示：
...【技术特征摘要】
1.一种生成配体分子的方法，包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其中基于所述一组初始臂生成一组候选配体分子包括：
3.根据权利要求1所述的方法，其中所述参考配体分子包括：
4.根据权利要求1所述的方法，其中确定所述一组初始臂包括：
5.根据权利要求1所述的方法，其中从所述一组候选臂中确定针对每个初始臂的目标候选臂包括：
6.根据权利要求5所述的方法，其中所述性质包括以下至少一项：亲和力、类药性以及可合成性。
7.根据权利要求1所述的方法，其中所述一组候选配体分子为第一组候选配体分子，所述一组候选臂为第一组候选臂，并且基于所述一组目标候选臂生成针对所述目标靶点的一组配体分子包括：
8.根据权利要求7所述的方法，其中所述预设条件包括：
9.一种构建配体生成模型的方法，包括：
10.根据权...
【专利技术属性】
技术研发人员：杨雨薇，周相鑫，程曦苇，鲍宇，
申请(专利权)人：抖音视界有限公司，
类型：发明
国别省市：
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