一种检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法及其应用技术

技术编号:39929771 阅读:24 留言:0更新日期:2024-01-08 21:43
本发明专利技术属基因检测技术领域,公开了一种检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法及其应用,S1:甘蔗总RNA提取及cDNA第一链合成;S2:ScERF3基因全长克隆及测序验证;S3:测序获得的序列进行生物信息学分析。本发明专利技术从甘蔗品种中克隆出ScERF3转录因子,编码350个氨基酸序列,对ScERF3蛋白结构、基因结构、亚细胞定位、表达进行了探究。该方法可以揭示甘蔗逆境胁迫响应的分子机制和调控途径,为甘蔗逆境胁迫抗性育种提供理论和实践指导,有望促进甘蔗产业的可持续发展。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因检测,尤其涉及一种检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法及其应用


技术介绍

1、甘蔗甘蔗是一种一年生或多年生热带和亚热带草本植物,属c4作物。乙烯存在于植物的某些组织、器官中,是由蛋氨酸在供氧充足的条件下转化而成的。当植物受到非生物胁迫时,植物体内乙烯的含量会发生变化,胁迫刺激后产生的乙烯通过其信号转导途径进行传递,能够对下游的胁迫相关基因进行调控,进而应答逆境胁迫。乙烯类转录因子ap2/erf家族是响应乙烯的主要元件,具有一个或两个ap2/erf结构域,是植物中最大的转录因子家族之一,乙烯响应因子是乙烯转导途径的最下游调控因子,含有一个ap2结构域,属于ap2/erf多基因家族,由58或59个氨基酸组成,这些氨基酸可以与乙烯响应基因启动子区域中发现的多种顺式作用元件结合,包括gcc box(核心序列为gccgcc)和dre/crt(dehydration-responsive element/c-repeat,核心序列为ccgac)。现有技术利用生物信息学方法从甘蔗野生种割手密基因组挖掘获得121条ssap2/erf基因序列,对其进行聚类分析本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法,该方法具体包括:

2.如权利要求1所述检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法,其特征在于,

3.如权利要求1所述检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法,其特征在于,S2:ScERF3基因全长克隆及测序验证具体包括:

4.如权利要求1所述检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法,其特征在于,S3:测序获得的序列进行生物信息学分析具体包括:

5.如权利要求1所述检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法,其特征在于,所述S1进一步包括:将甘蔗成熟叶片在液氮里充分研磨成粉末后,提取甘蔗总RNA,进行基因克隆和qRT-PCR的cDNA第一链反转录...

【技术特征摘要】

1.一种检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法,该方法具体包括:

2.如权利要求1所述检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法,其特征在于,

3.如权利要求1所述检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法,其特征在于,s2:scerf3基因全长克隆及测序验证具体包括:

4.如权利要求1所述检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法,其特征在于,s3:测序获得的序列进行生物信息学分析具体包括:

5.如权利要求1所述检测甘蔗乙烯响应转录因子的方法,其特征在于,所述s1进一步包括:将甘蔗成熟叶片在液氮里充分研磨成粉末后,提取甘蔗总rna,进行基因克隆和qrt-pcr的cdna第一链反转录,合成甘蔗成熟叶片cdna,于-80℃保存。

6.如权利要求1所述甘蔗乙烯响应转录因子的方法,其特征在于,所述s2进一步包括:基于甘蔗转录组测序数据序列,设计扩增scerf3基因全长序列引物,使用合成的甘蔗成熟叶片cdna做模板,进行扩增反应和1%...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈忠良黄东亮汪淼秦翠鲜廖芬李傲梅潘有强周丽黄甜梅
申请(专利权)人:广西壮族自治区农业科学院
类型:发明
国别省市:

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