高粱制造技术

本发明专利技术属于分子生物学技术领域，具体涉及高粱

【技术实现步骤摘要】
高粱DNA指纹图谱、构建方法及应用


[0001]本专利技术属于分子生物学
，具体涉及高粱
DNA
指纹图谱
、
构建方法及在高粱种质资源快速鉴定上的应用
。

技术介绍

[0002]高粱是我国白酒酿造的主要原料，尤其在川南黔北的“白酒金三角”地区
。
泸州老窖
、
茅台和五粮液等知名酒企都以高粱为主要原料
。
种植高粱不仅是当地广大农民群众增收的重要途径，也是支撑白酒产业发展的关键
。
随着酒企对产品品质的监管日益严格，致使他们对高粱种子来源和品质越加重视
。
在这一背景下，绿色有机糯红高粱，如泸州老窖的国窖红1号和茅台的红缨子的种植面积逐年增加
。
即便如此，川南黔北地区的糯红高粱产量仍远远无法满足当地酒企的需求，导致糯红高粱的价格不断攀升
。2022
年茅台酒用高粱农户收购保护价调整为
11.2
元
/
公斤
。
与此同时，国外高粱以及北方粳高粱和杂交高粱等替代品开始以次充好，以假充真，给当地市场和酒企带来了重大影响
。
因此，迫切需要精准鉴定高粱品种，以增强市场保护和保证各大酒企专用高粱的纯正性
。
[0003]DNA
指纹图谱技术是基于
DNA
分子标记建立的能够用于种质资源分类鉴定的一种现代手段
。
构建植物品种
DNA
>指纹图谱，可以克服单纯依据形态特征鉴定品种的局限性，这对于开展种质资源精准鉴定与基因发掘工作十分重要
。DNA
指纹图谱技术在品种资源多样性和品种鉴定研究中被广泛应用，但在高粱上鲜有相关报道
。
且目前已有的品种鉴定标准大多是基于经验依靠种子外观来区分，还没有基于
DNA
分子标记构建指纹图谱实现高粱品种鉴定的方法
。
因此，迫切需要开发一种基于
DNA
指纹图谱的高粱品种鉴定方法，从而满足市场需求并确保高粱种子来源的可追溯性
。

技术实现思路

[0004]针对现有技术中还未见采用
DNA
指纹图谱对高粱品种及来源鉴定的方法，本专利技术提供一种高粱
DNA
指纹图谱，构建方法及基于高粱
DNA
指纹图谱精准鉴定高粱种源的应用
。
本专利技术通过筛选得到的
20
个微核心
SNP
位点信息，构建高粱
DNA
指纹图谱，用于快速高效的追溯高粱种类及来源
。
所构建的
DNA
指纹图谱是基于高粱基因组重测序信息，其能用于高粱种质资源分类鉴定以及育种改良等方面，不仅提供了专属于不同用途高粱品种及其近缘种的全新身份信息，还可以精准鉴定个体真实性
。
在高粱种质资源分类
、
品种鉴定
、
追溯个体来源等方面具有良好的应用前景
。
[0005]本专利技术首先提供高粱
DNA
指纹图谱，其是通过以下
20
个微核心
SNP
位点建立的：
[0006]表
1 20
个微核心
SNP
位点
[0007]位点号染色体位置变异类型第1位点其位于1号染色体第
1199231bp
处变异类型为
T/C
第2位点其位于1号染色体第
67232638bp
处变异类型为
T/G
第3位点其位于2号染色体第
4500196bp
处变异类型为
T/G
第4位点其位于2号染色体第
63471876bp
处变异类型为
A/T
第5位点其位于3号染色体第
5944390bp
处变异类型为
G/A
第6位点其位于3号染色体第
53164324bp
处变异类型为
C/T
第7位点其位于4号染色体第
11091330bp
处变异类型为
C/A
第8位点其位于4号染色体第
57348837bp
处变异类型为
T/A
第9位点其位于5号染色体第
3699724bp
处变异类型为
A/T
第
10
位点其位于5号染色体第
69449675bp
处变异类型为
C/T
第
11
位点其位于6号染色体第
3322165bp
处变异类型为
G/T
第
12
位点其位于6号染色体第
51881035bp
处变异类型为
A/T
第
13
位点其位于7号染色体第
960712bp
处变异类型为
T/G
第
14
位点其位于7号染色体第
61360608bp
处变异类型为
A/G
第
15
位点其位于8号染色体第
1966649bp
处变异类型为
A/C
第
16
位点其位于8号染色体第
61076580bp
处变异类型为
C/T
第
17
位点其位于9号染色体第
2300487bp
处变异类型为
C/G
第
18
位点其位于9号染色体第
40568275bp
处变异类型为
T/G
第
19
位点其位于
10
号染色体第
7589533bp
处变异类型为
G/C
第
20
位点其位于
10
号染色体第
56000939bp
处变异类型为
T/C。
[0008]第二方面，本专利技术还提供了高粱
DNA
指纹图谱的构建方法，包括以下步骤：
[0009]S1、
获取一定数量的高粱全基因的序列数据，经过质控
、
预处理
、
变异位点识别，筛选提取出
SNP
变异位点；筛选条件包括：所有样本均检测到同样的变异位点，最小等位基因频率大于
0.35
，且在
100bp
范围内不存在其它变异位点；
[0010]S2、
在每条染色体两臂距离着丝粒大于
20Mb
区间选取
PIC
值最大的
SNP
变异位点，从而筛选出
20
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
高粱
DNA
指纹图谱，其特征在于：其是通过以下
20
个微核心
SNP
位点建立的：位点号染色体位置变异类型第1位点其位于1号染色体第
1199231bp
处变异类型为
T/C
第2位点其位于1号染色体第
67232638bp
处变异类型为
T/G
第3位点其位于2号染色体第
4500196bp
处变异类型为
T/G
第4位点其位于2号染色体第
63471876bp
处变异类型为
A/T
第5位点其位于3号染色体第
5944390bp
处变异类型为
G/A
第6位点其位于3号染色体第
53164324bp
处变异类型为
C/T
第7位点其位于4号染色体第
11091330bp
处变异类型为
C/A
第8位点其位于4号染色体第
57348837bp
处变异类型为
T/A
第9位点其位于5号染色体第
3699724bp
处变异类型为
A/T
第
10
位点其位于5号染色体第
69449675bp
处变异类型为
C/T
第
11
位点其位于6号染色体第
3322165bp
处变异类型为
G/T
第
12
位点其位于6号染色体第
51881035bp
处变异类型为
A/T
第
13
位点其位于7号染色体第
960712bp
处变异类型为
T/G
第
14
位点其位于7号染色体第
61360608bp
处变异类型为
A/G
第
15
位点其位于8号染色体第
1966649bp
处变异类型为
A/C
第
16
位点其位于8号染色体第
61076580bp
处变异类型为
C/T
第
17
位点其位于9号染色体第
2300487bp
处变异类型为
C/G
第
18
位点其位于9号染色体第
40568275bp
处变异类型为
T/G
第
19
位点其位于
10
号染色体第
7589533bp
处变异类型为
G/C
第
20
位点其位于
10
号染色体第
56000939bp
处变异类型为
T/C。2.DNA
指纹图谱的构建方法，其特征在于：包括以下步骤：
S1、
获取一定数量的高粱全基因的序列数据，经过质控
、
预处理
、
变异位点识别，筛选提取出
SNP
变异位点；筛选条件包括：所有样本均检测到同样的变异位点，...

【专利技术属性】
技术研发人员：张继伟，王文明，余志凡，赵菲菲，韩君如，
申请(专利权)人：四川农业大学，
类型：发明
国别省市：