基因组合物在检测肺腺癌免疫微环境中制造技术

本发明专利技术公开了一种基因组合物在检测肺腺癌免疫微环境中

【技术实现步骤摘要】
基因组合物在检测肺腺癌免疫微环境中NK细胞浸润以及肺腺癌预后中的应用


[0001]本专利技术涉及一种基因组合物在检测肺腺癌免疫微环境中
NK
细胞浸润以及肺腺癌预后中的应用，属于分子诊断

。

技术介绍

[0002]肺癌是一种高发的恶性肿瘤，其致死率在全球所有肿瘤中排名第一
。
肺腺癌是肺癌的最常见亚型，占肺癌病例的
60
％以上
。
免疫治疗对于肺腺癌患者有显著的疗效，提高了他们的生存期，开启了肺腺癌治疗的免疫时代
。
因此，如何准确评估肺腺癌的分子特征，预测肺腺癌患者对免疫治疗的反应和预后，对于患者的精准治疗和减少社会负担具有重要意义
。
[0003]目前，
TNM
分期系统是肺腺癌患者预后预测的主要依据，而
PD
‑1和
PD
‑
L1
的免疫组化分析是肿瘤免疫治疗的主要预测标志物
。TMB
等肿瘤免疫治疗的预测靶点虽然受到了广泛的关注，但目前在临床免疫治疗效果的指导方面仍然不够
。
目前已经有多个研究发现利用不同基因的组合表达谱作为新型的肿瘤标志物可以更好地反映肿瘤的生物学和免疫学特征，从而更准确地预测免疫治疗的效果和预后，这一方向有望为肺腺癌患者的精准治疗和个性化诊治带来希望
。
[0004]NK
细胞是一种具有自然杀伤活性的免疫细胞，能够识别和消灭肿瘤细胞
。NK
>细胞在肿瘤微环境中协同其他免疫细胞参与肿瘤的破坏和转移控制
。
许多研究表明，在实体瘤的肿瘤微环境中浸润有限，
NK
细胞数量稀少
、
功能失调；肿瘤细胞亦发展出多种逃避
NK
细胞攻击的机制
。
此外，肿瘤浸润的
NK
细胞处于耗竭状态，代谢和功能受损
。
因此，利用肿瘤肺免疫微环境中
NK
细胞浸润程度评估肿瘤的预后具有潜在的应用价值
。
[0005]因此，如果能够开发一种用于检测肺腺癌免疫微环境中
NK
细胞浸润程度的生物标志物将有助于实现肺腺癌患者的预后评估，从而有助于实现针对患者的精准治疗
。

技术实现思路

[0006]本专利技术旨在提供一种基因组合物在检测
/
评估肺腺癌免疫微环境中
NK
细胞浸润以及预测
/
评估肺腺癌预后中的应用
。
[0007]为了实现上述目的，本专利技术采取了以下技术方案：
[0008]本专利技术的第一方面，提供一种基因组合物在制备检测肺腺癌免疫微环境中
NK
细胞浸润程度和
/
或预测肺腺癌患者预后的产品中的应用，所述基因组合物由
ADRB2、IDH2、SFTPC、CCDC69
和
CCND2
组成
。
其中，所述免疫治疗指的是接受免疫检查点抑制剂的治疗
。
[0009]优选地，所述产品包括试剂盒或体外诊断系统或设备
。
[0010]优选地，所述产品为试剂盒，所述试剂盒中至少包括检测所述基因组合物表达量的试剂
。
[0011]优选地，所述试剂为通过转录组测序技术检测基因表达量的试剂，包括总
RNA
抽提
试剂
(
可以是
TRIzol
试剂
)
和转录组测序试剂
(
可以是本领域常规的转录组测序试剂，例如
VAHTS Universal V8 RNA
‑
seq Library Prep
试剂盒或功能相同的试剂盒
)。
[0012]优选地，所述试剂盒内还包括说明书，所述说明书中记载了如下评分公式：
[0013]Score
＝－
0.058
×
SFTPC
－
0.241
×
IDH2
－
0.027
×
CCDC69
－
0.138
×
CCND2
－
0.213
×
ADRB2
；
[0014]上述公式中，各基因代表的是该基因的相对表达量；具体地，是以
log2(FPKM+1)
作为该基因
ADRB2
的相对表达量值，
FPKM
的计算公式为：
FPKM
＝
(
每条
RNA
比对到的
reads
数目
)/(
样本总比对
read
数目
×
基因的长度
)
×
106。
[0015]所述评分公式的评分
Score
截断值为
‑
2.33。
评分判断规则为：当检测样本评分
Score
＜
‑
2.33
时，代表该样本风险系数小，肺腺癌肿瘤微环境
NK
细胞浸润程度相对高
(
相对于
Score≥
‑
2.33
的样本
)、
预后相对
(
相对于
Score≥
‑
2.33
的样本
)
好，纳入低风险组；当检测样本评分
Score≥
‑
2.33
时，则代表该样本风险系数高，肺腺癌肿瘤微环境
NK
细胞浸润程度相对
(
相对于
Score
＜
‑
2.33
的样本
)
低
、
预后相对
(
相对于
Score
＜
‑
2.33
的样本
)
差，纳入高风险组
。
[0016]本专利技术的第二方面，提供一种用于检测肺腺癌免疫微环境中
NK
细胞浸润程度和
/
或预测肺腺癌预后的试剂盒，所述试剂盒内至少包括特异性检测以下基因表达量的试剂：
ADRB2、IDH2、SFTPC、CCDC69
和
CCND2。
[0017]优选地，所述检测采用的样本为受试者新鲜组织肿瘤样本
。
[0018]优选地，所述试剂盒内还包括说明书，所述说明书中记载了如下评分公式：
[0019]Score
＝－
0.058
×
SFTPC
－
0.241
×
IDH2
－
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种基因组合物在制备检测肺腺癌免疫微环境中
NK
细胞浸润程度和
/
或预测肺腺癌患者预后的产品中的应用，其特征在于，所述基因组合物由
ADRB2、IDH2、SFTPC、CCDC69
和
CCND2
组成
。2.
根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述产品包括试剂盒或体外诊断系统或设备
。3.
根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述产品为试剂盒，所述试剂盒中至少包括检测所述基因组合物表达量的试剂
。4.
根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂盒内还包括说明书，所述说明书中记载了如下评分公式和评分标准：
Score
＝－
0.058
×
SFTPC
－
0.241
×
IDH2
－
0.027
×
CCDC69
－
0.138
×
CCND2
－
0.213
×
ADRB2
；上述公式中，各基因代表的是该基因的相对表达量；所述评分公式的评分
Score
截断值为
‑
2.33。5.
一种用于检测肺腺癌免疫微环境中
NK
细胞浸润程度和
/
或预测肺腺癌预后的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒内至少包括特异性检测以下基因表达量的试剂：
ADRB2、IDH2、SFTPC、CCDC69
和
CCND2。6.
如权利要求5所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒内还包括说明书，所述说明书中记载了如下评分公式和评分标准：
Score
＝－
0.058
×

【专利技术属性】
技术研发人员：金星，隋启海，单光耀，梁嘉琪，詹成，
申请(专利权)人：复旦大学附属中山医院，
类型：发明
国别省市：