【技术实现步骤摘要】
一种抗菌肽及其应用
[0001]本专利技术属于生物
,具体涉及一种抗菌肽及其应用
。
技术介绍
[0002]抗菌肽
(Antimicrobial Peptides,AMPs)
,也被称为宿主防御肽
(Host Defense Peptides,HDPs)
,被认为是先天免疫系统必不可少的组成部分
。
抗菌肽有着不尽相同的序列组成以及物理
、
化学方面的结构和性质,通常由较短的氨基酸序列组成,一般少于
100
个氨基酸残基,其中有很大一部分是带正电荷的氨基酸残基
。
[0003]抗菌肽在自然界中广泛存在,具有抗菌活性的芋螺多肽,它们通常对革兰氏阴性细菌和
、
革兰氏阳性细菌以及真菌
、
霉菌等都具有广谱的活性
。
而且,它们对包膜病毒
、
体内外的寄生虫甚至是癌细胞都可以产生杀灭作用
。
抗菌肽还可以对先天免疫和适应性免疫进行调节,可能会抑制导致炎症的反应发生,减轻对巨噬细胞
、
嗜中性粒细胞
、
嗜酸性粒细胞和
T
淋巴细胞的补充增殖
。
[0004]抗菌素耐药性的加速增长和全球扩大加深了对发现新型抗菌素药物的需求
。
与传统抗生素相比,抗菌肽具有明显的优势,包括耐药性出现较慢
、
广谱抗菌膜活性以及有利于调节宿主免疫反应的能力 >。
[0005]细菌感染对人体健康有严重威胁
。
在中国每年至少有
300
万人受到感染,直接导致约
33000
人死亡
。
特别是近年来,由于传统抗生素的滥用以及多重耐药细菌进化速度加快使得许多细菌产生耐药性
。
加之由于商业利益等原因,相比抗菌药物的研发速度,细菌的抗药性则以惊人的速度发展着
。
因此迫切需要一种新的抗菌药物来抑制细菌,尤其是多重耐药菌的生长
。
技术实现思路
[0006]本专利技术基于深度学习和分子动力学模拟设计,得到了一种基于人工智能设计的全新序列的抗菌肽及其变体,具有高效广谱的抗菌作用
。
并通过圆二色谱
(CD)
和
Alphafold2
三维结构预测,证明了该抗菌肽的二级结构主要为
α
螺旋
。
据此完成了本专利技术
。
[0007]第一方面,本专利技术提供一种抗菌肽,所述抗菌肽的序列为选自
SEQ ID NO.3340、SEQ ID NO.3341、SEQ ID NO.3342、SEQ ID NO.3344
和
SEQ ID NO.3346
中的一种或多种,所述序列如表1所示
。
[0008]进一步的,所述氨基酸序列中的某一些位点可以发生缺失或突变,缺失或突变后的氨基酸序列与原氨基酸序列具有
80
%
‑
100
%的同源性,优选具有
99
%
、95
%
、90
%
、95
%
、80
%的同源性
。
[0009]进一步的,所述氨基酸序列的如下一个或多个氨基酸发生突变,所述氨基酸突变位点包括:
L17A、V14R、K11A、R16A、R13A、R10A、R9A
和
R3A
;所述突变后的序列为表3:
[0010]优选的,所述突变体的氨基酸序列如表3中
3344[A18R]至
3344[L1A]所示
。
[0011]更进一步,所述氨基酸序列的
N
端截短为
DN1
或
DN2
;
[0012]更进一步,所述氨基酸序列的
C
端截短为
DC1
或
DC2
;
[0013]更进一步,所述氨基酸序列为
D
型序列,其中发生如下突变:
d3344
或
dV14R。
[0014]所述抗菌肽具有高效广谱的抗菌作用
。
[0015]第二方面,本专利技术提供一种含有抗菌肽的组合物,所述抗菌肽为本专利技术第一方面所述抗菌肽
。
[0016]进一步的,所述抗菌肽组合物可以制备为药物
、
保健品
、
抗菌剂或杀菌剂等
。
[0017]更进一步的,所述药物
、
保健品
、
抗菌剂或杀菌剂等可以制备为片剂
、
胶囊剂
、
丸剂
、
散剂
、
颗粒剂
、
喷雾剂
、
熏洗剂
、
洗搽剂
、
注射剂等
。
[0018]第三方面,本专利技术提供一种抗菌肽在制备抑制细菌生长的药物或制剂中的应用,所述抗菌肽为本专利技术第一方面所述抗菌肽
。
[0019]进一步的,所述细菌为革兰氏阴性菌或革兰氏阳性菌
。
[0020]进一步的,所述革兰氏阴性菌包括:铜绿假单胞菌
ATCC27853、
铜绿假单胞菌
PAO1、
大肠杆菌
ATCC 25922、
嗜麦芽窄食单胞菌
CGMCC 1.1788、
产酶溶杆菌
YC36、
牙龈卟啉单胞菌
ATCC33277。
[0021]进一步的,所述革兰氏阳性菌包括:金黄色葡萄球菌
CMCC(B)26003、
李斯特菌
bio
‑
59992、
变异链球菌
ATCC25175。
[0022]优选地,抗菌肽抑制铜绿假单胞菌
ATCC27853、
牙龈卟啉单胞菌
ATCC33277
和变异链球菌
ATCC25175。
附图说明
[0023]图1是由
Alphafold 2
预测抗菌肽的二级结构
。
[0024]图2是抗菌肽的圆二色谱表征结果
。
具体实施方式
[0025]下面对本专利技术的具体实施方式作进一步说明
。
在此需要说明的是,对于这些实施方式的说明用于帮助理解本专利技术,但并不构成对本专利技术的限定
。
此外,下面所描述实施方式中所涉及的技术特征只要彼此之间未构成冲突就可以相互组合
。
[0026]下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法,下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为可通过常规的商业途径购买得到
...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.
一种抗菌肽,其特征在于,所述抗菌肽的氨基酸序列为选自
SEQ ID NO.3340、SEQ ID NO.3341、SEQ ID NO.3342、SEQ ID NO.3344
和
SEQ ID NO.3346
中的一种或多种
。2.
如权利要求1所述的抗菌肽,其特征在于,所述氨基酸序列中的某一些位点可以发生缺失或突变,缺失或突变后的氨基酸序列与原氨基酸序列具有
80
%
‑
100
%的同源性
。3.
如权利要求2所述的抗菌肽,其特征在于,所述氨基酸序列的如下一个或多个氨基酸发生突变,所述氨基酸的突变位点包括
L17A、V14R、K11A、R16A、R13A、R10A、R9A
和
R3A。4.
如权利要求3所述的抗菌肽,其特征在于,所述氨基酸发生
N
端截短
DN1
和
DN2
或
C
端截短
DC1
和
DC2。5.
如权利要求3所述的抗菌肽,其特征在于,所述氨基酸发生
D
型突变,即
d3344
或
dV14R。6.
一种包含权利要求1‑5任一项所述抗菌肽的组合物,其特征在于,所述组合物可以制备为药物
、
保健品
、
抗菌...
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