一种鸡全净膛重的主效基因制造技术

本发明专利技术涉及分子标记技术领域，具体提供一种鸡全净膛重的主效基因

【技术实现步骤摘要】
一种鸡全净膛重的主效基因SERPINB6及提高全净膛重的分子标记辅助选择技术


[0001]本专利技术涉及分子标记
，尤其涉及一种鸡全净膛重的主效基因
SERPINB6
及提高全净膛重的分子标记辅助选择技术
。

技术介绍

[0002]以地方品种资源为基础培育的黄羽肉鸡品种，具有肉质细腻
、
风味鲜美等特点，深受消费者喜爱
。
但黄羽肉鸡产肉量少于白羽肉鸡，因此提高黄羽肉鸡的生产效率，增加产肉量一直是遗传育种工作的核心内容
。
[0003]胴体性状是肉鸡的最重要经济性状，与肌肉
、
骨骼等多组织发育紧密相关
。
胴体性状主要指产肉性状，其中全净膛重是胴体性状的重要指标
。
全净膛重不仅能体现肌肉产量，而且通过整个躯体结构也能反映胴体体型特征，良好的胴体外观能增加消费者的购买欲望，进而增加鸡肉消费产量
。
全净膛重是复杂的数量性状，受到遗传和环境共同调控，其中性别
、
品种
、
饲养环境
、
屠宰方式等均影响全净膛重
。
[0004]目前对鸡全净膛重的理论研究较少，尤其在黄羽肉鸡群体中
。
随着高通量测序技术的快速发展，转录组测序和全基因组重测序技术的联合分析，有助于鉴定候选功能基因和关键的分子标记
。
分子标记与重要经济性状紧密连锁时，可作为关键的遗传标记用于分子育种
。
>[0005]分子育种主要指分子标记辅助育种，随着芯片技术的发展，广泛应用的分子标记辅助育种是遗传密度更高的单核苷酸多态性
(SNP,Single Nucleotide Polymorphism)
，相较于传统育种，能够加快品种遗传改良进程，减少资源的浪费，实现目标性状的早期选择，对于优势基因型的选择也更加精准
。
因此，挖掘畜禽重要经济性状的功能基因和
SNPs
，为分子育种提供遗传标记，是农业动物遗传改良中的重中之重
。

技术实现思路

[0006]本专利技术提供一种与鸡全净膛重性状相关的分子标记及其应用，用以解决现有技术中不能在鸡品种选育早期，准确鉴定鸡全净膛重的缺陷，实现在鸡品种选育时，对全净膛重性状的定向选择
。
[0007]本专利技术的目的是提供一种与鸡全净膛重显著相关的
SNP
分子标记及高产量鸡选育方法
。
本专利技术以地方黄羽肉鸡品种为素材，利用转录组数据与胴体性状的多种关联分析
(MLM、EN、LASSO
和
RR)、
加权基因共表达网络分析和差异表达分析共同鉴定胴体性状候选基因，进一步鉴定候选基因区间内显著影响胴体性状的关键分子标记，加快遗传选育进展，实现产肉量的早期选择
。
[0008]胴体性状受到遗传和环境共同调控，目前虽然定位到全净膛重性状众多的
SNPs
，但是大多未验证
SNPs
所在基因的表达量与表型的关联程度
。
因此结合大样本量的转录组数据和重测序数据进行关联分析更有利于确定更为有效的分子标记
。
[0009]本专利技术提供的技术方案如下：
[0010]第一方面，本专利技术发现了，基因
SERPINB6
与鸡全净膛重相关联，具体提供了
SERPINB6
基因在检测鸡全净膛重中的应用，所述
SERPINB6
基因的核苷酸序列如
SEQ ID NO.3
所示
。
[0011]第二方面，本专利技术提供与鸡全净膛重性状相关的分子标记，所述分子标记包括：鸡2号染色体上第
67,631,671bp
处，多态性为
C/T
，记为
rs317934171。
[0012]以上分子标记的物理位置参考基因组
GRCg6a
版本
。
[0013]本专利技术所提供分子标记
rs317934171
所含多态性位点的基因型为
TT
，对应于待测鸡的全净膛重低，所含多态性位点的基因型为
CT
，对应于待测鸡的全净膛重居中，所含多态性位点的基因型为
CC
，对应于待测鸡的全净膛重高
。
[0014]扩增分子标记
rs317934171
的引物如
SEQ ID NO.1
‑2所示
。
[0015]第三方面，本专利技术还提供扩增上述分子标记的特异性引物对
。
[0016]本专利技术所提供扩增上述分子标记的特异性引物如
SEQ ID NO.1
‑2所示
。
[0017]第四方面，本专利技术提供一种检测鸡全净膛重性状的试剂或试剂盒，含有上述特异性引物
。
[0018]第五方面，本专利技术还提供了上述分子标记或上述特异性引物对或上述试剂或试剂盒在以下的应用：
[0019](1)
在鉴定鸡全净膛重表型中的应用；
[0020](2)
在鸡全净膛重性状早期预测中的应用；
[0021](3)
在鸡资源鉴定
、
改良或分子标记辅助育种中的应用
。
[0022]第六方面，本专利技术提供一种优质鸡的分子育种方法，包括：
[0023](1)
提取待测鸡总
DNA
；
[0024](2)
以
DNA
为模板，检测分子标记
rs317934171
的基因型；
[0025](3)
分析基因型，判断鸡遗传潜质，留种
、
繁种
。
[0026]在本专利技术所提供的优质鸡的分子育种方法中，步骤
(3)
包括：对扩增产物进行等位基因检测，根据基因分型结果判定如下：
[0027]若分子标记
rs317934171
所含多态性位点的基因型为
CC
，判断待测鸡的全净膛重具有高水平
。
[0028]本专利技术的有益效果至少在于：
[0029]本专利技术首次发现了，基因
SERPINB6
与鸡全净膛重相关联，进一步提供了与鸡全净膛重性状相关的分子标记
rs317934171
，基于分子标记
rs317934171
，本专利技术采用鸡胴体性状改良分子育种技术，整合利用显著
SNP
分子标记的关联分析方法，改良鸡全净膛重指标
。
[0030]利用本专利技术所提供的分子标记
rs317934171
，进行鸡种系选育，可增加鸡品种的全净膛重产量，对肉鸡的生产具有重大的指导意义
。
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.SERPINB6
基因在检测鸡全净膛重中的应用，其特征在于，所述
SERPINB6
基因的核苷酸序列如
SEQ ID NO.3
所示
。2.
与鸡全净膛重性状相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记位于鸡
SERPINB6
基因上，包括：鸡2号染色体上第
67,631,671bp
处，多态性为
C/T
，记为
rs317934171。3.
根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，分子标记
rs317934171
所含多态性位点的基因型为
TT
，对应于待测鸡的全净膛重低，所含多态性位点的基因型为
CT
，对应于待测鸡的全净膛重居中，所含多态性位点的基因型为
CC
，对应于待测鸡的全净膛重高
。4.
根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，扩增分子标记
rs317934171
的引物如
SEQ ID NO.1
‑2所示
。5.
扩增权利要求2‑4任一项所述分子标记的特异性引物对
。6.
根据权利要求5所述的特异性引物对，其特征在于，所述特异性引物对的引物如
SEQ ID NO...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵桂苹，刘冉冉，文杰，赵迪，崔焕先，王巧，
申请(专利权)人：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：