一种检测呼吸道合胞病毒的探针和引物组合及其应用制造技术

本发明专利技术提供一种检测呼吸道合胞病毒

【技术实现步骤摘要】
一种检测呼吸道合胞病毒的探针和引物组合及其应用


[0001]本专利技术涉及分子生物基因检测
，具体涉及一种基于等温扩增结合
Cas13a
基因编辑方法检测呼吸道合胞病毒
(RSV)
的
crRNA
探针和引物组合
。

技术介绍

[0002]呼吸道合胞病毒
(Respiratory syncytial virus,RSV)
属于副黏病毒科的肺病毒属
(Pneumovirus)
，只有一种血清型
。
主要引起6个月以下婴儿患细支气管炎和肺炎等下呼吸道感染，以及较大儿童和成人的鼻炎
、
感冒等上呼吸道感染
。
[0003]病毒形态为球形，直径为
120
～
300nm
，有包膜，基因组为非分节段的单负链
RNA
，主要编码
10
种蛋白质，即融合蛋白
(F)、
黏附蛋白
(G)
和小疏水蛋白/>(SH)
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种检测呼吸道合胞病毒的探针和引物组合，其特征在于，所述
crRNA
探针包括：
RSV_probe
‑
F
和
RSV_probe
‑
R
，所述引物组合包括：
RSV_F1
和
RSV_R1
，其中，
RSV_probe
‑
F
和
RSV_F1
在5’
端带有
T7
启动子序列，所述
RSV_probe
‑
R
与
RSV_probe
‑
F
碱基序列反向互补；
T7
启动子序列为：
GAAATTAATACGACTCACTATAGGGRSV_probe
‑
F
的碱基序列为：
GAAATTAATACGACTCACTATAGGGGATTTAGACTACCCCAAAAACGAAGGGGACTAAAACGCATGTTAGACTACATGCCTTGATTTCA
；
RSV_probe
‑
R
的碱基序列为：
TGAAATCAAGGCATGTAGTCTAACATGCGTTTTAGTCCCCTTCGTTTTTGGGGTAGT CTAAATCCCCTATAGTGAGTCGTATTAATTTC
；
RSV_F1
的碱基序列为：
GAAATTAATACGACTCACTATAGGGAAGAAGCAAGCTGGCATATGATGTAACCAC
；
RSV_R1
的碱基序列为：
GTTTTCATAGTGAGATCTTTAACTGTAGTTAACATA。2.
根据权利要求1所述的一种基检测呼吸道合胞病毒的探针和引物组合，其特征在于，所述
RSV_F1
和
RSV_R1
的靶基因序列为：
GTGCCAATGTGTCCTTGGATGAAAGAAGCAAGCTGGCATATGATGTAACCACACCC TGTGAAATCAAGGCATGTAGTCTAACATGCCTAAAATCAAAAAATATGTTAACTACAGTT AAAGATCTCACTATGAAAACACTC。3.
根据权利要求1所述的检测呼吸道合胞病毒的探针和引物组合，其特征在于，所述
crRNA
探针的编码
DNA
序列包括：用于
Cas13a
核酸酶识别的核酸序列，以及与靶基因互补的核酸序列；用于
Cas13a
核酸酶识别的核酸序列为：
GATTTAGACTACCCCAAAAACGAAGGGGACTAAAAC
；与靶基因互补的核酸序列为：
GCATGTTAGACTACATGCCTTGATTTCA。4.
一种检测呼吸道合胞病毒的探针和引物组合的应用，其特征在于：所述检测呼吸道合胞病毒的探针和引物组合用于试纸条，并通过显示
C
线和
T
线的方式判断是否含有呼吸道合胞病毒
。5.
一种根据权利要求1所述的探针和引物组合检测呼吸道合胞病毒的方法，其特征在于：所述检测呼吸道合胞病毒的方法包括如下步骤：第一步：将浓度为
10mM
‑
50mM
的
RSV_probe
‑
F
和
RSV_probe
‑
R
各取5μ
L
混匀，
95℃
退火
5min。
后取退火的
RSV_probe
‑
F
和
RSV_probe
‑
R
加入转录反应体系中，混匀；将反应管置于

【专利技术属性】
技术研发人员：黄升海，黄依璇，蒋成成，刘晓洁，
申请(专利权)人：安徽医科大学，
类型：发明
国别省市：