增强子制造技术

本发明专利技术涉及增强子

【技术实现步骤摘要】
增强子RNA功能性位点rs3094296的检测试剂在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用


[0001]本专利技术涉及于基因工程及肿瘤医学领域，具体涉及一种增强子
RNA
功能性位点
rs3094296
的检测试剂在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用
。

技术介绍

[0002]结直肠癌作为一种常见的消化道恶性肿瘤，严重威胁我国人民的健康，其发病率和死亡率在我国恶性肿瘤中分别位列第三位和第二位
。
随着人口老龄化的加剧以及居民生活方式和饮食结构的改变，我国结直肠癌的发病率和死亡率呈现逐年上升趋势，成为我国亟待解决的重大公共卫生问题
。
目前，针对结直肠癌最有效的筛查方法是粪便隐血检查
(FIT)
结合结肠镜检查
。
但是，这些方法存在检出率不高以及患者接受度不高等弊端
。
因此，需要更加便捷精准的方法对结直肠癌的高危个体开展筛查和早期诊断，提高患者的接受度更高，从而为国家节省大量的医疗支出
。
[0003]近年来，以分子遗传学为基础的个体化筛查方案，成为结直肠癌高危人群筛查的重点
。
单核苷酸多态性
(Single Nucleotide Polymorphism
，
SNP)
作为一类最常见的遗传变异，能够反映个体的遗传背景差异，已被证实与肿瘤的发生风险相关
。
迄今为止，全基因组关联研究
(Genome
‑<br/>Wide Association Study
，
GWAS)
已经鉴别出了一系列与中国人群结直肠癌易感性密切相关的遗传变异位点
。
然而，鉴定出的大部分结直肠癌相关位点位于基因组的非编码区域，揭示这些统计学关联背后真正起作用的功能性遗传变异及其潜在的生物学机制仍然十分困难，为此，研究人员利用一种基于数量性状位点
(Quantitative Trait Loci
，
QTL)
的分析方法系统挖掘真正的功能
SNP。
非编码区域包含着许多顺式调控元件，其中增强子在基因表达调控中起着至关重要的作用
。
随着高通量测序技术的快速发展，活性增强子被发现可以转录出一种非编码
RNA
，称为增强子
RNA(enhancer RNA
，
eRNA)
，它们能够激活增强子活性
、
促进增强子
‑
启动子环的形成
,
从而激活下游基因的表达，人类的许多癌症和疾病都与
eRNA
的异常表达有关
。
此外，研究报道位于增强子上的遗传变异通过影响
eRNA
的产生，从而进一步影响疾病的发生
。
因此，在全基因组范围内系统鉴定影响
eRNA
表达的遗传变异
(enhancer RNA quantitative trait locus,eRNAQTL)
，是解析易感位点生物学功能的一个重要的切入点，同时鉴定出的
SNP
标记可以应用于中国人群结直肠癌高危个体的识别
、
早期筛查和辅助诊断
。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于克服现有技术的不足，本专利技术的目的是提供一种增强子
RNA
功能性位点
rs3094296
的检测试剂在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用
。
[0005]具体为增强子
RNA
功能性位点
rs3094296
的检测试剂在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用
。
[0006]检测试剂包括增强子
RNA
功能性位点
rs3094296
的特异性扩增引物和特异性探针，
所述特异性扩增引物序列为
SEQ ID NO
：1和
SEQ ID NO
：2，特异性探针序列为
SEQ ID NO
：3和
SEQ ID NO
：
4。
[0007]本专利技术的有益效果为：本专利技术从分子生物学及基因诊断水平上，提供了筛选结直肠癌高危人群的技术方法
。
通过结合结直肠癌
eRNAQTLs
遗传图谱和大规模人群验证显示，
rs3094296
位点与中国人群的结直肠癌易感性相关
。
通过针对
rs3094296
位点进行巧妙的引物和探针设计，能够依靠荧光定量
PCR
，即可对正常人群进行
rs3094296
变异的检测，从而鉴别结直肠癌的高危人群，辅助结直肠癌患者的早期筛查及诊断
。
该技术方法设计巧妙
、
简易可行
、
结果准确可靠，可在各级医院进行推广，对于评估结直肠癌的患病风险提供了帮助，有助于临床上对该类人群进行结直肠癌筛查和早期干预
。
附图说明
[0008]图1为
eRNAQTLs
图谱筛选结直肠癌易感位点
rs3094296
的流程图；
[0009]图2为
eRNAQTL rs3094296
的人群结果和潜在调控的目标
eRNA
示意图；
[0010]图3为基于
SNP
位点
rs3094296
的结直肠癌风险预测模型
AUC
曲线示意图；
[0011]图4为
rs3094296
双荧光素酶报告基因实验结果示意图；
[0012]图5为转录因子
HOXA5
等位基因特异性结合于
rs3094296
上下游示意图；
[0013]图6为
rs3094296
基因型对靶基因
SENP7
表达水平的调控示意图；
[0014]图7为
SENP7e
和
SENP7
影响结直肠癌细胞系增殖能力的示意图
。
具体实施方式
[0015]以下对本专利技术的原理和特征进行描述，所举实例只用于解释本专利技术，并非用于限定本专利技术的范围
。
[0016]结合中国人群结直肠癌功能性
eRNAQTLs
和多中心病例对照研究，鉴定出一种与结直肠癌早期筛查和辅助诊断相关的增强子
RNA
功能位点标志物，该标志物为
rs3094296。
[0017]所述
rs3094296
的特异性扩增引物序列为
SEQ ID NO
：1和
SEQ ID NO
：
2。<本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
增强子
RNA
功能性位点
rs3094296
的检测试剂在制备结直肠癌辅助诊断试剂盒中的应用
。2.
根据权利要求1的应用，其特征在于，检测试剂包括增强子
RNA
功能性位点
rs309429...

【专利技术属性】
技术研发人员：田剑波，缪小平，蔡祎旻，鲁泽群，金梦，
申请(专利权)人：武汉大学，
类型：发明
国别省市：