【技术实现步骤摘要】
一种基于CRISPR/Cas12a
‑
RPA快速检测草地贪夜蛾的序列组合及其应用
[0001]本专利技术属于生物检测
,尤其涉及一种基于
CRISPR/Cas12a
‑
RPA
快速检测草地贪夜蛾的序列组合及其应用,具体地是一种基于
CRISPR/Cas12a
‑
RPA
快速检测草地贪夜蛾的序列组合
、
检测试剂盒
、
检测方法和应用
。
技术介绍
[0002]草地贪夜蛾(
Spodoptera frugiperda
)别名又叫秋粘虫,最初分布在美洲热带和亚热带地区,是美洲的本地物种,它于
2016
年初在西部和中部非洲首次被发现,现已成为许多非洲和亚洲国家最严重的入侵鳞翅目害虫之一(
Sparks et al 1979
;陆耀辉等
2023
)
。
草地贪夜蛾是一种多食性迁徙性害虫,由于其出色的飞行能力,可以利用季节 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.
一种基于
CRISPR/Cas12a
‑
RPA
快速检测草地贪夜蛾的序列组合,其特征在于,包括根据
COI
基因设计的
RPA
引物对序列和
crRNA
序列,
RPA
引物对序列为:正向引物
RPA
‑
COI
‑
F1
的序列如
SEQ ID NO
:1所示;反向引物
RPA
‑
COI
‑
R2
的序列如
SEQ ID NO
:2所示;
crRNA
序列如
SEQ ID NO
:3所示
。2.
根据权利要求1所述的一种基于
CRISPR/Cas12a
‑
RPA
快速检测草地贪夜蛾的序列组合,其特征在于,所述序列组合还包括
ssDNA
探针序列;所述
ssDNA
探针序列是用于荧光定量
PCR
仪器检测的草地贪夜蛾的
ssDNA
探针序列
、
用于可视化荧光检测的草地贪夜蛾的
ssDNA
探针序列或用于侧流层析试纸条检测的草地贪夜蛾的
ssDNA
探针序列
。3.
根据权利要求2所述的一种基于
CRISPR/Cas12a
‑
RPA
快速检测草地贪夜蛾的序列组合,其特征在于,用于荧光定量
PCR
仪器检测的草地贪夜蛾的
ssDNA
探针序列为
ssDNA
‑
reporter
‑
FAM
或
ssDNA
‑
reporter
‑
CY5
;其中,
ssDNA
‑
reporter
‑
FAM
为:5’‑6’
FAM
‑
TTATT
‑
BHQ1
‑3’
;
ssDNA
‑
reporter
‑
CY5
为:5’‑
CY5
‑
TGTCTTATcccccATAAGACA
‑
BHQ1
‑3’
;用于可视化荧光检测的草地贪夜蛾的
ssDNA
探针序列为
ssDNA
‑
reporter
‑
FAM
‑2,具体为:5’‑6’
FAM
‑
TGTCTTATcccccATAAGACA
‑
BHQ1
‑3’
;用于侧流层析试纸条检测的草地贪夜蛾的
ssDNA
探针序列为
FB
‑
reporter
,具体为:5’‑6’
FAM
‑
TTTTTTTTT
‑
Biotin
‑3’
。4.
一种快速检测草地贪夜蛾的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1‑3中任一项所述的
RPA
引物对序列和
crRNA
序列
。5.
根据权利要求4所述的一种快速检测草地贪夜蛾的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含水合
Buffer、MgOAC、
酶干粉
、Cas12a
酶和
ddH2O。6.
根据权利要求4或5所述的一种快速检测草地贪夜蛾的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括用于进行
RPA
扩增反应的反应体系和用于进行
CRISPR/Cas12a
反应的体系;用于进行
RPA
扩增反应的反应体系的总体积为
50
μ
L
,反应体系包括:正向引物
RPA
‑
COI
‑
F1、
反向引物
RPA
‑
COI
‑
R2、
水合
buffer、ddH2O
和模板
DNA
,混匀后迅速放入含有酶干粉的
PCR
反应管中,将酶干粉溶解后,最后加入
MgOAC
;用于进行
CRISPR/Cas12a
反应的体系总体积为
20
μ
L
,所述体系选自如下任一种:所述体系包括:
SF
缓冲液
、crRNA
序列
、RNA
酶抑...
【专利技术属性】
技术研发人员:赵辉,张金鑫,胡帅,杜晓希,纪长绵,贾瑞宗,张雨良,郭安平,
申请(专利权)人:中国热带农业科学院三亚研究院,
类型:发明
国别省市:
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