一种鉴定甜瓜杂交种纯度的方法及其使用的技术

本发明专利技术涉及一种鉴定甜瓜杂交种纯度的方法及其使用的

【技术实现步骤摘要】
一种鉴定甜瓜杂交种纯度的方法及其使用的SNP引物组合


[0001]本专利技术属于生物
，具体涉及一种鉴定甜瓜杂交种纯度的方法及其使用的
SNP
引物组合；杂交种指杂交一代种，可能有亲本混杂
。

技术介绍

[0002]甜瓜为葫芦科甜瓜属一年生蔓性草本植物，果实营养丰富，深受消费者喜爱，是中国市场上最为畅销的果品之一
。
近年来，随着甜瓜产业的发展，越来越多的新品种进入市场，全国申请登记的甜瓜品种已超过
2000
份，种子的质量问题显得愈发重要
。
众所周知，目前市场上绝大多数甜瓜品种都是杂交种，杂交种子在生产过程中，由于去雄不彻底不及时或人为失误掺入杂种时，会使其纯度降低
。
杂交种子的纯度鉴定是判定商业化种子质量是否合格的重要指标之一，也是杜绝假冒伪劣种子流入市场的重要手段，更是种子企业进行产品质量控制的重要途径
。
[0003]甜瓜种子纯度鉴定有田间鉴定和分子鉴定这两种方法
。
传统的田间种植鉴定，虽可直观统计结果，但本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种
SNP
引物组合，包括第一引物组至第十二引物组，其中，第一引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP01
以确定
SNP
位点
TGSNP01
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP01
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的1号染色体上的第
8779544
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
A
或
G
；第二引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP02
以确定
SNP
位点
TGSNP02
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP02
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的2号染色体上的第
1937599
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
G
或
C
；第三引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP03
以确定
SNP
位点
TGSNP03
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP03
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的3号染色体上的第
28641302
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
G
或
A
；第四引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP04
以确定
SNP
位点
TGSNP04
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP04
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的4号染色体上的第
12956460
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
A
或
G
；第五引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP05
以确定
SNP
位点
TGSNP05
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP05
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的5号染色体上的第
16951407
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
A
或
T
；第六引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP06
以确定
SNP
位点
TGSNP06
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP06
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的6号染色体上的第
3552531
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
T
或
A
；第七引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP07
以确定
SNP
位点
TGSNP07
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP07
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的7号染色体上的第
21326763
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
G
或
A
；第八引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP08
以确定
SNP
位点
TGSNP08
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP08
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的8号染色体上的第
176762
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
G
或
A
；第九引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP09
以确定
SNP
位点
TGSNP09
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP09
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的9号染色体上的第
21606061
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
G
或
A
；第十引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP10
以确定
SNP
位点
TGSNP10
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP10
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的
10
号染色体上的第
8407131
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
C
或
A
；第十一引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP11
以确定
SNP
位点
TGSNP11
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP11
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的
11
号染色体上的第
20770253
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
T
或
C
；第十二引物组用于扩增甜瓜基因组中
SNP
位点
TGSNP12
以确定
SNP
位点
TGSNP12
所对应的基因型，所述
SNP
位点
TGSNP12
位于甜瓜
DHL92
参考基因组的
12
号染色体上的第
1189283
位核苷酸，该位点的核苷酸碱基为
T
或
C。2.
如权利要求1所述的
SNP
引物组合，其特征在于：所述第一引物组由序列表中
SEQ ID NO
：1所示的正向引物
1F1、SEQ ID NO
：2所示的正
NO
：
20
自5’
末端起第
22
至
47
位所示的正向引物
7F2
和
SEQ ID NO
：
21
所示的反向引物
7R
组成；所述第八引物组由
SEQ ID NO
：
22
自5’
末端起第
22
至
52
位所示的正向引物
8F1、SEQ ID NO
：
23
自5’
末端起第
22
至
55
位所示的正向引物
8F2
和
SEQ ID NO
：
24
所示的反向引物
8R
组成；所述第九引物组由
SEQ ID NO
：
25
自5’
末端起第
22
至
46
位所示的正向引物
9F1、SEQ ID NO
：
26
自5’
末端起第
22
至
47
位所示的正向引物
9F2
和
SEQ ID NO
：
27
所示的反向引物
9R
组成；所述第十引物组由
SEQ ID NO
：
28
自5’
末端起第
22
至
48
位所示的正向引物
10F1、SEQ ID NO
：
29
自5’
末端起第
22
至
48
位所示的正向引物
10F2
和
SEQ ID NO
：
30
所示的反向引物
10R
组成；所述第十一引物组由
SEQ ID NO
：
31
自5’
末端起第
22
至
46
位所示的正向引物
11F1、SEQ ID NO
：
32
自5’
末端起第
22
至
45
位所示的正向引物
11F2
和
SEQ ID NO
：
33
所示的反向引物
11R
组成；所述第十二引物组由
SEQ ID NO
：
34
自5’
末端起第
22
至
48
位所示的正向引物
12F1、SEQ ID NO
：
35
自5’
末端起第
22
至
47
位所示的正向引物
12F2
和
SEQ ID NO
：
36
所示的反向引物
12R
组成；优选地，所述第一引物组至第十二引物组中任一引物组的两条正向引物的
5'
端添加有发出不同颜色的荧光标签序列；进一步优选地，所述荧光标签序列选自
FAM、TET、VIC、HEX
中的一种

【专利技术属性】
技术研发人员：张建，杨静静，俞新华，张晓飞，夏昌选，赵泓，温常龙，
申请(专利权)人：北京市农林科学院，
类型：发明
国别省市：