肺腺癌预警模型构建方法技术

本申请提供一种肺腺癌预警模型构建方法

【技术实现步骤摘要】
肺腺癌预警模型构建方法、系统、终端及存储介质


[0001]本申请涉及健康监测
，尤其涉及一种肺腺癌预警模型构建方法
、
系统
、
终端及存储介质
。

技术介绍

[0002]肺腺癌
(Lung Adenocarcinoma
，
LUAD)
是肺癌的一种亚型，在全球范围内的发病率和死亡率均较高，对人类健康构成了严重威胁
。
目前，肺腺癌往往难以识别，大多数患者在诊断时已处于晚期，癌细胞的远距离扩散会导致严重的健康后果
。
化疗
、
放疗和手术是肺癌的常规治疗方法，但不同患者的治疗效果有所不同，有些患者预后效果较差，需要及时介入
。
因此，迫切需要识别预后特征，以预测
LUAD
患者的长期生存率，从而为提供个体化治疗方案
、
改善预后提供依据
。
[0003]铜在细胞内可以与多种关键蛋白质结合，如
MEK、ERK、ULK1、ULK2、PDK1
和
AKT
，从而调控多条信号通路，包括
MAPK、
自噬和
PI3K
‑
AKT
等通路
。
这些信号通路在细胞的生存
、
增殖和转化中起着至关重要的作用，因此铜在其中的作用可能会影响肿瘤的发展和预后
。
[0004]目前，相关技术中缺乏根据铜质增生基因预测肺腺癌的方法
。

技术实现思路

[0005]有鉴于此，有必要提供一种肺腺癌预警模型构建方法，能够至少克服以上缺陷之一
。
[0006]第一方面，本申请实施例提供一种肺腺癌预警模型构建方法，所述肺腺癌预警模型构建方法包括：获取用户的肺腺癌转录信息及临床信息；
[0007]根据基因集变异分析对所述肺腺癌转录信息中的铜质增生基因进行评分，以获取基因集富集分数；
[0008]根据加权基因共表达网络分析对所述基因集富集分数进行处理，以获取共表达网络，所述共表达网络中包括铜质增生基因模块；
[0009]根据单因素
Cox
比例风险回归分析处理所述铜质增生基因模块，以获取与肺腺癌预后铜质增生基因；
[0010]根据套索回归分析及所述肺腺癌预后铜质增生基因构建肺腺癌预警模型
。
[0011]根据本申请的一个实施例，所述临床信息包括：性别
、
年龄
、
生存信息及肺腺癌病理分期
。
[0012]根据本申请的一个实施例，所述方法还包括：
[0013]根据所述肺腺癌预警模型获取
Cox
比例风险评分；
[0014]根据所述生存信息构建生存曲线，将所述用户划分为低危组用户和高危组用户；
[0015]获取所述低危组用户的生存状态及所述高危组用户的生存状态；
[0016]应用对数秩检验比较所述
Cox
比例风险评分及所述生存曲线，以获取所述肺腺癌预警模型的预测能力
。
[0017]根据本申请的一个实施例，所述方法还包括：
[0018]获取所述低危组用户与所述高危组用户的差异基因；
[0019]根据基因功能分析及通路分析处理所述差异基因，以获取所述差异的信号通路
。
[0020]根据本申请的一个实施例，所述方法还包括：
[0021]获取所述低危组用户的免疫点检查基因及所述高危组用户的免疫点检查基因；
[0022]获取所述低危组用户与所述高危组用户的差异免疫点检查基因
。
[0023]根据本申请的一个实施例，所述差异免疫点检查基因包括：
PDCD1、CD274、LAG3、TNFRSF14、NRP1。
[0024]根据本申请的一个实施例，所述方法还包括：
[0025]获取所述低危组用户的免疫细胞浸润程度及所述高危组用户的免疫细胞浸润程度；
[0026]获取所述低危组用户与所述高危组用户之间的免疫状态差异；
[0027]根据所述免疫状态差异获取针对所述高危组用户的靶向细胞，所述靶向细胞为巨噬细胞
。
[0028]第二方面，本申请实施例提供一种肺腺癌预警模型构建系统，所述肺腺癌预警模型构建系统包括：
[0029]信息获取模块，用于获取用户的肺腺癌转录信息及临床信息；
[0030]评分模块，用于根据基因集变异分析对所述肺腺癌转录信息中的铜质增生基因进行评分，以获取基因集富集分数；
[0031]共表达网络构建模块，用于根据加权基因共表达网络分析对所述基因集富集分数进行处理，以获取共表达网络，所述共表达网络中包括铜质增生基因模块；
[0032]基因获取模块，用于根据单因素
Cox
比例风险回归分析处理所述铜质增生基因模块，以获取与肺腺癌预后铜质增生基因；
[0033]模型构建模块，用于根据套索回归分析及所述肺腺癌预后铜质增生基因构建肺腺癌预警模型
。
[0034]第三方面，本申请实施例提供一种终端，包括：
[0035]处理器；
[0036]用于存储处理器可执行指令的存储器；
[0037]其中，所述处理器被配置为执行所述指令时实现如第一方面所述的肺腺癌预警模型构建方法
。
[0038]第四方面，本申请实施例提供一种计算机可读存储介质，包括指令，所述指令指示设备执行如第一方面所述的肺腺癌预警模型构建方法
。
[0039]本申请实施方式提供的肺腺癌预警模型构建方法，能够准确评估患者的患病风险，实现早期诊断和筛选
。
通过铜质增生基因的评分和加权基因共表达网络分析，模型不仅能为医生提供个体化治疗方案的依据，还可以预测患者的长期生存率，为临床医生制定更有效的治疗计划和随访策略提供支持
。
附图说明
[0040]图1为本申请一实施例提供的肺腺癌预警模型构建方法流程图
。
[0041]图2为本申请一实施例提供的尺度独立性示意图
。
[0042]图3为本申请一实施例提供的平均连接度示意图
。
[0043]图4为本申请一实施例提供的基因树状图及模块颜色示意图
。
[0044]图5为本申请一实施例提供的模块特征向量的聚类示意图
。
[0045]图6为本申请一实施例提供的模块与特征关系示意图
。
[0046]图7为本申请一实施例提供的生存曲线示意图
。
[0047]图8为本申请一实施例提供的受试者工作特征曲线示意图
。
[0048]图9为本申请另一实施例提供的生存曲线示意图
。
[0049]图
10
为本申请一实施例提供的免疫细胞浸润程度示意图<本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种肺腺癌预警模型构建方法，其特征在于，所述肺腺癌预警模型构建方法包括：获取用户的肺腺癌转录信息及临床信息；根据基因集变异分析对所述肺腺癌转录信息中的铜质增生基因进行评分，以获取基因集富集分数；根据加权基因共表达网络分析对所述基因集富集分数进行处理，以获取共表达网络，所述共表达网络中包括铜质增生基因模块；根据单因素
Cox
比例风险回归分析处理所述铜质增生基因模块，以获取与肺腺癌预后铜质增生基因；根据套索回归分析及所述肺腺癌预后铜质增生基因构建肺腺癌预警模型
。2.
如权利要求1所述的肺腺癌预警模型构建方法，其特征在于，所述临床信息包括：性别
、
年龄
、
生存信息及肺腺癌病理分期
。3.
如权利要求2所述的肺腺癌预警模型构建方法，其特征在于，所述方法还包括：根据所述肺腺癌预警模型获取
Cox
比例风险评分；根据所述生存信息构建生存曲线，将所述用户划分为低危组用户和高危组用户；获取所述低危组用户的生存状态及所述高危组用户的生存状态；应用对数秩检验比较所述
Cox
比例风险评分及所述生存曲线，以获取所述肺腺癌预警模型的预测能力
。4.
如权利要求3所述的肺腺癌预警模型构建方法，其特征在于，所述方法还包括：获取所述低危组用户与所述高危组用户的差异基因；根据基因功能分析及通路分析处理所述差异基因，以获取所述差异的信号通路
。5.
如权利要求3所述的肺腺癌预警模型构建方法，其特征在于，所述方法还包括：获取所述低危组用户的免疫点检查基因及所述高危组用户的免疫点检查基因；获取所述低危组用户与...

【专利技术属性】
技术研发人员：翁勰，郑大勇，晏菲菲，
申请(专利权)人：南方医科大学中西医结合医院，
类型：发明
国别省市：