获取细菌１６Ｓ　ｒＲＮＡ基因的Ｖ３区核苷酸序列的方法及其专用引物技术

技术编号：3932171 阅读：1449 留言：0更新日期：2012-04-11 18:40

本发明专利技术公开了一种获取细菌１６Ｓ?ｒＲＮＡ基因的Ｖ３区核苷酸序列的方法及其专用引物。本发明专利技术的专用引物是由序列表的序列１７和序列１９所示的核苷酸组成的特异引物对。本发明专利技术提供的方法，包括如下步骤：（１）以细菌的基因组ＤＮＡ为模板，用通用引物进行ＰＣＲ扩增；通用引物是由序列表的序列１７和序列１８所示的核苷酸组成的引物对；（２）以步骤（１）的ＰＣＲ产物为模板，用所述特异引物对进行ＰＣＲ扩增；（３）将步骤（２）的ＰＣＲ产物采用测序引物进行测序；测序引物的核苷酸序列如序列表的序列２０所示。本发明专利技术提供的用于细菌多样性分析的针对１６Ｓ?ｒＲＮＡ基因Ｖ３区的引物对可以直接进行测序，无需借助载体，有助于降低了实验成本，缩短实验的周期，提高实验的准确性。本发明专利技术的特异引物对和方法特别适用于针对１６Ｓ?ｒＲＮＡ基因Ｖ３区用ＰＣＲ－ＤＧＧＥ技术分析环境样品细菌多样性试验。