黄颡鱼饲料利用率的分子标记及其应用制造技术

本申请涉及黄颡鱼饲料利用率技术领域，具体涉及黄颡鱼饲料利用率的分子标记及其应用。该分子标记包括黄颡鱼crhr1基因第二内含子上第4019nt处发生单核苷酸突变A>G形成的核苷酸序列。利用该分子标记设计引物，对包含该SNP位点的核苷酸序列进行PCR扩增的，能够在较短的时间内检测该SNP位点的基因多态性，从而检测黄颡鱼饲料利用率性状的差异，以为黄颡鱼品种的选育提供指导，且不需要昂贵的设备。且不需要昂贵的设备。且不需要昂贵的设备。

【技术实现步骤摘要】
黄颡鱼饲料利用率的分子标记及其应用


[0001]本申请涉及黄颡鱼饲料利用率
，具体涉及黄颡鱼饲料利用率的分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)是我国重要的水产养殖鱼类，具有明显的雌雄生长二态性，雄性的生长速度约为雌鱼的2.5～3倍，饲料所占的养殖成本在黄颡鱼养殖成本中占最大比重，随着饲料原材料价格的不断攀升，导致黄颡鱼的养殖成本不断增加，利润随之减少。饲料利用率(计算方式为：末始体重
‑
初始体重)/摄食量)作为一个重要的经济指标，具有高饲料利用率性能的黄颡鱼能减少鱼粉消耗和代谢物排泄，同时能够并减少对水体污染，有助于解决黄颡鱼养殖可持续性和经济性。因此，选育高饲料利用率的黄颡鱼具有十分重要的应用意义。一般而言，通过人工选育可以获得高饲料利用率的黄颡鱼，然而其选育周期和选育准确率均受到限制。

技术实现思路

[0003]本申请专利技术人发现了黄颡鱼饲料利用率的分子标记，能够应用于高饲料利用率黄颡鱼的检测及选育。为此，本申请实施例至少公开了以下技术方案：
[0004]第一方面，实施例公开了黄颡鱼饲料利用率的分子标记，包括黄颡鱼crhr1基因第二内含子上第4019nt处发生单核苷酸突变A>G形成的核苷酸序列，所述黄颡鱼crhr1基因第二内含子如SEQ ID NO.1所示。
[0005]第二方面，实施例公开了黄颡鱼饲料利用率的分子标记引物，包括如SEQ ID NO.2所示的DNA分子和如SEQ ID NO.3所示的DNA分子。
[0006]第三方面，实施例公开了一种核酸分子，由所述的分子标记引物经PCR扩增而成，所述核酸分子的基因型与所述黄颡鱼饲料利用率性状关联。
[0007]第四方面，实施例公开了一种试剂盒，包括第二方面所述的分子标记引物以及其他PCR扩增所需试剂。
[0008]第五方面，实施例公开了黄颡鱼饲料利用率的检测方法，包括：
[0009]获取待测黄颡鱼个体的基因组DNA；
[0010]通过第二方面所述的分子标记引物进行PCR扩增；
[0011]根据扩增产物的核苷酸序列检测猪黄颡鱼crhr1基因第二内含子上第4019nt处的基因型；
[0012]根据所述基因型确定所述黄颡鱼饲料利用率。
[0013]第六方面，实施例公开了第一方面所述的分子标记、第二方面所述的分子标记引物、第三方面所述的核酸分子或第四方面所述的试剂盒的应用，所述应用选自如下任一：
[0014]1)黄颡鱼饲料利用率的检测与分析；
[0015]2)黄颡鱼的筛选与育种。
附图说明
[0016]图1为本申请实施例提供的黄颡鱼尾鳍组织用于基因组DNA的PCR产物电泳图，左泳道为Maker，其他为24个平行样品。
[0017]图2为本申请实施例提供的分子标记分型图。
[0018]图3为本申请实施例提供的分子标记不同基因型雌性黄颡鱼饲料利用率统计结果图。
[0019]图4为本申请实施例提供的分子标记不同基因型雄性黄颡鱼饲料利用率统计结果图。
[0020]图5为本申请实施例提供的分子标记不同基因型在验证黄颡鱼群体中的饲料利用率统计结果图。
具体实施方式
[0021]为了使本申请的目的、技术方案及优点更加清楚明白，以下结合实施例对本申请进行进一步详细说明。应当理解，此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本申请，并不用于限定本申请。本申请中未详细单独说明的试剂均为常规试剂，均可从商业途径获得；未详细特别说明的方法均为常规实验方法，可从现有技术中获知。
[0022]本申请实施例通过筛选发现，黄颡鱼crhr1基因第二内含子上第4019nt处发生单核苷酸突变A>G，其形成核苷酸序列及对应产生的基因型及遗传学特性，促使黄颡鱼个体在饲料利用率上产生不同的性状。
[0023]为此，本申请实施例公开了黄颡鱼饲料利用率的分子标记，包括黄颡鱼crhr1基因第二内含子上第4019nt处发生单核苷酸突变A>G形成的核苷酸序列，所述黄颡鱼crhr1基因第二内含子如SEQ ID NO.1所示。
[0024]在一些实施例中，黄颡鱼crhr1基因第二内含子上第4019nt处，AA基因型黄颡鱼个体饲料利用率高于GG基因型个体和AG基因型个体。对于选育而言，可以依据黄颡鱼crhr1基因第二内含子上第4019nt处的基因型优先选育基因型为AA的黄颡鱼个体。
[0025]另外，实施例还公开了黄颡鱼饲料利用率的分子标记引物，包括如SEQ ID NO.2所示的DNA分子和如SEQ ID NO.3所示的DNA分子。其中，“分子标记引物”是用来扩增包含黄颡鱼饲料利用率性状联锁的分子标记，例如SNPs的核苷酸序列，以分析该分子标记的基因型，从而得知黄颡鱼饲料利用率性状。
[0026]另外，实施例还公开了一种核酸分子，由上述的分子标记引物经PCR扩增而成，所述核酸分子的基因型与所述黄颡鱼饲料利用率性状关联。进一步地，所述核酸分子如SEQ ID NO.3所示。
[0027]另外，实施例还公开了一种试剂盒，包括上述的分子标记引物以及其他PCR扩增所需试剂。
[0028]基于此，实施例还公开了黄颡鱼饲料利用率的检测方法，包括：获取待测黄颡鱼个体的基因组DNA；通过上述实施例提供的所述分子标记引物进行PCR扩增；根据扩增产物的核苷酸序列检测黄颡鱼crhr1基因第二内含子上第4019nt处的基因型；根据所述基因型确定所述黄颡鱼饲料利用率。
[0029]在一些实施例中，该检测方法还包括将所述扩增产物进行电泳和测序，根据电泳
和测序结果判断黄颡鱼crhr1基因第二内含子上第4019nt处的基因型。
[0030]基于此，实施例还公开了黄颡鱼的筛选方法，包括上述实施例提供所述的检测方法，以确定黄颡鱼个体的饲料利用率性状。
[0031]基于此，实施例还公开了上述实施例提供的分子标记、上述实施例提供的分子标记引物、上述实施例提供的核酸分子或上述实施例提供的试剂盒的应用，所述应用选自如下任一：
[0032]1)黄颡鱼饲料利用率的检测与分析；
[0033]2)黄颡鱼的筛选与育种。
[0034]现结合具体实例对本申请作进一步的说明，以下实施例仅是为了解释本申请，但不构成对本申请的限制。在以下实施例中所用到的试验样本及试验过程包括以下内容(如果实施例中未注明的实验具体条件，通常按照常规条件，或按照试剂公司所推荐的条件；下述实施例中所用的试剂、耗材等，如无特殊说明，均可从商业途径得到)。
[0035]分子标记的筛选
[0036]1、养殖与样品采集
[0037]采用人工繁殖，构建黄颡鱼混合家系，并进行同塘养殖，养殖过程中严格执行“定时、定点、定量”的投喂原则。出膜后90天后，随机捕获240尾试验鱼，测量并记录每尾鱼体重数据，并在循环水系统中进行单缸养殖。每天投喂2本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.黄颡鱼饲料利用率的分子标记，包括黄颡鱼crhr1基因第二内含子上第4019nt处发生单核苷酸突变A>G形成的核苷酸序列，所述黄颡鱼crhr1基因第二内含子如SEQ ID NO.1所示。2.根据权利要求1所述的分子标记，黄颡鱼crhr1基因第二内含子上第4019nt处，AA基因型黄颡鱼个体饲料利用率高于GG基因型个体和AG基因型个体。3.黄颡鱼饲料利用率的分子标记引物，包括如SEQ ID NO.1所示的DNA分子和如SEQ ID NO.2所示的DNA分子。4.一种核酸分子，由如权利要求3所述的分子标记引物经PCR扩增而成，所述核酸分子的基因型与所述黄颡鱼饲料利用率性状关联。5.根据权利要求4所述的核酸分子，...

【专利技术属性】
技术研发人员：梅洁，王宇宏，郭稳杰，皇培培，巩高瑞，
申请(专利权)人：武汉轻工大学，
类型：发明
国别省市：