用于分子对接的方法、电子设备和计算机程序产品技术

本公开的实施例提供了一种用于分子对接的方法、电子设备和计算机程序产品。该方法包括确定表征第一分子的第一特征表示和表征第二分子的第二特征表示；至少基于第一特征表示和第二特征表示，确定第一分子的候选区域，候选区域包括用于对接第一分子与第二分子的多个候选位置；以及针对多个候选位置中的每个候选位置，确定在候选位置对接第一分子与第二分子的结果。利用本公开的方案能够针对第一分子的候选区域而非整个区域来计算对接结果，从而减少计算量。减少计算量。减少计算量。

【技术实现步骤摘要】
用于分子对接的方法、电子设备和计算机程序产品


[0001]本公开的实施例涉及生物信息领域，并且具体地，涉及用于分子对接的方法、电子设备和计算机程序产品。

技术介绍

[0002]分子对接是指通过研究分子间(例如，配体和受体)的相互作用来确定分子的结合(binding)模式和亲合力的理论模拟方法。分子对接可以被应用于药物设计、药物筛选、复合物生成等领域。目前，已经提出诸如Dock、AutoDock、FlexX等软件来实现分子对接。然而，由于分子的复杂的空间结构和理化性质，需要大量的计算资源来确定分子间的相互作用。因此，亟需一种分子对接方法来高效地确定分子间的结合情况。

技术实现思路

[0003]本公开的实施例提供了一种用于分子对接的方案。
[0004]在本公开的第一方面，提供了一种分子对接方法。该方法包括确定表征第一分子的第一特征表示和表征第二分子的第二特征表示；至少基于第一特征表示和第二特征表示，确定第一分子的候选区域，候选区域包括用于对接第一分子与第二分子的多个候选位置；以及针对多个候选位置中的每个候选位置，确定在候选位本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种分子对接方法，包括：确定表征第一分子的第一特征表示和表征第二分子的第二特征表示；至少基于所述第一特征表示和所述第二特征表示，确定所述第一分子的候选区域，所述候选区域包括用于对接所述第一分子与所述第二分子的多个候选位置；以及针对所述多个候选位置中的每个候选位置，确定在所述候选位置对接所述第一分子与所述第二分子的结果。2.根据权利要求1所述的方法，其中确定表征第一分子的第一特征表示和表征第二分子的第二特征表示包括：基于所述第一分子的氨基酸序列来确定所述第一特征表示；以及基于所述第二分子的氨基酸序列来确定所述第二特征表示。3.根据权利要求1所述的方法，其中确定表征第一分子的第一特征表示和表征第二分子的第二特征表示包括：利用至少一个特征提取模块来确定所述第一特征表示和所述第二特征表示，其中所述至少一个特征提取模块是AlphaFold模型的一部分。4.根据权利要求3所述的方法，其中所述至少一个特征提取模块包括第一特征提取模块和第二特征提取模块，并且所述第一特征提取模块基于与所述第一分子相关联的训练数据集被进一步训练，所述第二特征提取模块基于与所述第二分子相关联的训练数据集被进一步训练。5.根据权利要求1所述的方法，其中确定所述第一分子的所述候选区域包括还基于以下至少一项来确定所述候选区域：所述第一分子的氨基酸单元和所述第二分子的氨基酸单元的连接信息；以及所述第二分子的姿态信息。6.根据权利要求1所述的方法，其中确定所述第一分子的候选区域包括：利用机器学习模型来确定所述候选区域。7.根据权利要求1所述的方法，其中确定在所述候选位置对接所述第一分子与所述第二分子的结果包括：利用分子对接算法来确定所述结果，其中所述分子对接算法包括AutoDock。8.根据权利要求1所述的方法，其中所述第一分子是靶向蛋白质并且所述第二分子是配体。9.一种电子设备，包括：处理器；以及与所述处理器耦合的存储器，所述存储器具有存储于其中的指令，所述指令在被处理器执行时使所述设备执行动作，所述动作包括：确定表征第一分子的...

【专利技术属性】
技术研发人员：王子嘉，李三平，贾真，
申请(专利权)人：戴尔产品有限公司，
类型：发明
国别省市：