男性家系基因比对方法、装置、计算机设备及存储介质制造方法及图纸

本发明专利技术实施例公开了男性家系基因比对方法、装置、计算机设备及存储介质。所述方法包括：获取男性家系信息；对所述男性家系信息进行基于Y

【技术实现步骤摘要】
男性家系基因比对方法、装置、计算机设备及存储介质


[0001]本专利技术涉及数据分析方法，更具体地说是指男性家系基因比对方法、装置、计算机设备及存储介质。

技术介绍

[0002]男性家系信息的分析可用于男性遗传病以及同类犯罪男性家族信息的分析，男性家系信息的分析是基于Y
‑
STR的比对方法，该方法大多会涉及数百个家系，办案人员需要耗费大量时间进一步筛查，无法智能推荐排查对象和范围。
[0003]因此，有必要设计一种新的方法，实现量化Y
‑
STR比对结果，可智能推荐排查对象和范围。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于克服现有技术的缺陷，提供男性家系基因比对方法、装置、计算机设备及存储介质。
[0005]为实现上述目的，本专利技术采用以下技术方案：男性家系基因比对方法，包括：
[0006]获取男性家系信息；
[0007]对所述男性家系信息进行基于Y
‑
STR的比对，以得到比对结果；
[0008]根据所述比对结果确定排查对象和范围；
[0009]输出所述排查对象和范围至终端。
[0010]其进一步技术方案为：所述对所述男性家系信息进行基于Y
‑
STR的比对，以得到比对结果，包括：
[0011]检验所述男性家系信息中每一个变异和数量性状之间的关联性，得到单个突变检验的P值；
[0012]按照Fisher结合P值方法增强单个突变检验的P值，以得到比对结果。<br/>[0013]其进一步技术方案为：所述按照Fisher结合P值方法增强单个突变检验的P值，以得到比对结果，包括：
[0014]利用Fisher结合P值方法在单个突变检验的P值的基础上增加权重，以得到比对结果。
[0015]其进一步技术方案为：所述检验所述男性家系信息中每一个变异和数量性状之间的关联性，得到单个突变检验的P值，包括：
[0016]设定给定基因内有M个突变，对n个个体在M个突变上进行电泳测序，对于第i个个体，y
i
表示数量性状值，x
im
∈{0,1,2}表示第m个突变的基因型积分，z
i1
～z
ik
为k个协变量，i＝1～n，m＝1～M；对于第m个突变，应用线性回归模型：y
i
＝a0+a
T
z
i
+b
m
x
im
+ε
i
；其中a0是截距项，a＝(a1,a2,
…
,a
k
)
T
是协变量，z
i
＝(z1,z2,
…
,z
k
)
T
的回归系数；b
m
是基因型积分x
im
的回归系数；ε1～ε
n
是独立同分布的，并且ε
i
＝N(0,σ2)；令Y＝(y1,y2,
…
,y
k
)
T
，Z
i
＝(1,ε
T
)
T
，i＝1～n，Z＝(Z1,Z2,
…
,Z
k
)
T
，X
m
＝(x
1m
,x
2m
,
…
,x
km
)
T
；每个突变与性状之间的关联性检验等价与检
验零假设H0：b
m
＝0，根据定理得计分检验统计量：S
m
＝(1/σ2)U
m
V
m
U
m
；其中σ2是在零假设下σ2的最大似然估计，即σ2＝(1/n)Y
T
(I
n
‑
Q)
Y
，I
n
为n阶单位阵，Q＝Z(Z
T
Z)
‑1Z
T
，U
m
＝X
mT
(I
n
‑
Q)Y，V
m
＝X
mT
(I
n
‑
Q)X
m
；当n符合要求时，S
m
近似服从自由度为1的卡方分布，根据S
m
获得单个突变检验的P值，分别记为p1～p
M
。
[0017]其进一步技术方案为：所述利用Fisher结合P值方法在单个突变检验的P值的基础上增加权重，以得到比对结果包括：
[0018]用y
i
和协变量z
i1
～z
ik
做线性回归，得到y
i
的残差；权重为：ω
i
＝Beta(q
m
；1,25)|Cov(Y,X
m
)|；其中q
m
为第m个突变的次等位基因频率，m＝1～M。
[0019]本专利技术还提供了男性家系基因比对装置，包括：
[0020]信息获取单元，用于获取男性家系信息；
[0021]比对单元，用于对所述男性家系信息进行基于Y
‑
STR的比对，以得到比对结果；
[0022]确定单元，用于根据所述比对结果确定排查对象和范围；
[0023]输出单元，用于输出所述排查对象和范围至终端。
[0024]其进一步技术方案为：所述比对单元包括：
[0025]关联性校验子单元，用于检验所述男性家系信息中每一个变异和数量性状之间的关联性，得到单个突变检验的P值；
[0026]增强子单元，用于按照Fisher结合P值方法增强单个突变检验的P值，以得到第一比对结果。
[0027]其进一步技术方案为：所述增强子单元，用于利用Fisher结合P值方法在单个突变检验的P值的基础上增加权重，以得到比对结果。
[0028]本专利技术还提供了一种计算机设备，所述计算机设备包括存储器及处理器，所述存储器上存储有计算机程序，所述处理器执行所述计算机程序时实现上述的方法。
[0029]本专利技术还提供了一种存储介质，所述存储介质存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时可实现上述的方法。
[0030]本专利技术与现有技术相比的有益效果是：本专利技术通过对男性家系信息进行基于Y
‑
STR的比对，确定基因突变率，并根据比对结果确定排查对象和范围，实现量化Y
‑
STR比对结果，可智能推荐排查对象和范围。。
[0031]下面结合附图和具体实施例对本专利技术作进一步描述。
附图说明
[0032]为了更清楚地说明本专利技术实施例技术方案，下面将对实施例描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图是本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.男性家系基因比对方法，其特征在于，包括：获取男性家系信息；对所述男性家系信息进行基于Y
‑
STR的比对，以得到比对结果；根据所述比对结果确定排查对象和范围；输出所述排查对象和范围至终端。2.根据权利要求1所述的男性家系基因比对方法，其特征在于，所述对所述男性家系信息进行基于Y
‑
STR的比对，以得到比对结果，包括：检验所述男性家系信息中每一个变异和数量性状之间的关联性，得到单个突变检验的P值；按照Fisher结合P值方法增强单个突变检验的P值，以得到比对结果。3.根据权利要求2所述的男性家系基因比对方法，其特征在于，所述按照Fisher结合P值方法增强单个突变检验的P值，以得到比对结果，包括：利用Fisher结合P值方法在单个突变检验的P值的基础上增加权重，以得到比对结果。4.根据权利要求3所述的男性家系基因比对方法，其特征在于，所述检验所述男性家系信息中每一个变异和数量性状之间的关联性，得到单个突变检验的P值，包括：设定给定基因内有M个突变，对n个个体在M个突变上进行电泳测序，对于第i个个体，y
i
表示数量性状值，x
im
∈{0,1,2}表示第m个突变的基因型积分，z
i1
～z
ik
为k个协变量，i＝1～n，m＝1～M；对于第m个突变，应用线性回归模型：y
i
＝a0+a
T
z
i
+b
m
x
im
+ε
i
；其中a0是截距项，a＝(a1,a2,
…
,a
k
)
T
是协变量，z
i
＝(z1,z2,
…
,z
k
)
T
的回归系数；b
m
是基因型积分x
im
的回归系数；ε1～ε
n
是独立同分布的，并且ε
i
＝N(0,σ2)；令Y＝(y1,y2,
…
,y
k
)
T
，Z
i
＝(1,ε
T
)
T
，i＝1～n，Z＝(Z1,Z2,
…
,Z
k
)
T
，X
m
＝(x
1m
,x
2m
,
…
,x
km
)
T
；每个突变与性状之间的关联性检验等价与检验零假设H0：b

【专利技术属性】
技术研发人员：郑诚，宫臣，樊旭晨，
申请(专利权)人：杭州创恒电子技术开发有限公司，
类型：发明
国别省市：