一种与鸡生长、体尺及胴体性状相关的SNP分子标记、检测引物、试剂盒及育种方法技术

本发明专利技术涉及一种与鸡生长、体尺及胴体性状相关的SNP分子标记、检测引物、试剂盒及育种方法。本发明专利技术通过研究发现鸡FGF2基因第1号内含子上的一个SNP位点rs53587188,存在A>G突变，经关联分析发现，该SNP位点与鸡生长、体尺及胴体性状显著相关，能够作为鸡品种遗传改良的分子标记。对上述SNP分子标记的基因型进行检测，能够早期、有效的预测鸡育成期体重，从而缩短育种时间，加快育种进程。本发明专利技术还提供了检测该SNP分子标记基因型的引物、试剂盒及鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种方法，可用于鸡的辅助选择和分子育种，对提高鸡的生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状具有重要的作用。重要的作用。重要的作用。

【技术实现步骤摘要】
一种与鸡生长、体尺及胴体性状相关的SNP分子标记、检测引物、试剂盒及育种方法


[0001]本专利技术涉及一种与鸡生长、体尺及胴体性状相关的SNP分子标记、检测引物、试剂盒及育种方法，属于生物育种


技术介绍

[0002]单核苷酸多态(Single nucleotide polymorphism，SNP)指在基因组水平上由于单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。研究证明，SNP的多样性与经济性状的相关性分析可为家禽分子选种育种方面提供辅助标记选择，因此，SNP多样性与经济性状的关联分析一直是畜禽遗传学研究的热点。
[0003]鸡作为一种重要的经济禽类，同时也是科研上的一种重要的模式生物，生长性状是评价鸡生产性能的主要指标，而体尺性状和胴体性状能够反映鸡生长速度和产肉性能，这三种性状均是非常重要的经济性状，因此研究鸡的生长性状、体尺性状和胴体性状具有重要的经济价值。如何在种质特性不改变的情况下提高地方畜禽品种的经济性状，维护地方畜禽的可持续发展是亟需解决的问题。在畜禽的遗传育种中，应用分子标记的现代育种技术是加快良种选育和提高种群遗传品质，从而增加畜禽生产性能先进的有效的方法。因此，有必要开发与鸡生长性状相关的候选基因，寻找到新的分子标记，借助分子生物学手段加快遗传改良工作进程，从而缩短育种时间，加快育种进程。

技术实现思路

[0004]为解决上述问题，本专利技术的第一个目的是提供一种与鸡生长、体尺及胴体性状相关的SNP分子标记，经过分析验证，该SNP位点与鸡生长性状、体尺性状及胴体性状显著相关，能够作为鸡品种遗传改良的分子标记，用于鸡的辅助选育和分子育种，对提高鸡的生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状具有重要的意义。
[0005]本专利技术的第二个目的是提供上述SNP分子标记在鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种中的应用，以解决上述问题。
[0006]本专利技术的第三个目的是提供一种用于检测上述SNP分子标记基因型的检测引物，以解决上述问题。
[0007]本专利技术的第四个目的是提供一种用于检测上述SNP分子标记基因型的试剂盒，以解决上述问题。
[0008]本专利技术的第五个目的是提供上述检测引物或检测试剂盒在鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种中的应用，以解决上述问题。
[0009]本专利技术的第六个目的是提供一种鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种方法，以解决上述问题。
[0010]为了实现上述目的，本专利技术中一种与鸡生长、体尺及胴体性状相关的SNP分子标记的技术方案是：
[0011]一种与鸡生长、体尺及胴体性状相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，5
’
端起第168位碱基为A或G。
[0012]上述技术方案的有益效果在于：本专利技术首次发现在鸡FGF2基因第1号内含子上的一个SNP位点rs53587188，存在A>G突变。该SNP分子标记尚未见报道，是新发现的一个SNP分子标记。
[0013]为了实现上述目的，本专利技术中SNP分子标记在鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种中的应用的技术方案是：
[0014]一种SNP分子标记在鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种中的应用。
[0015]上述技术方案的有益效果在于：经过分析验证，该SNP位点与鸡生长性状、体尺性状及胴体性状显著相关，能够作为鸡品种遗传改良的分子标记，用于鸡的辅助选育和分子育种，有利于性状优良的鸡种群的遗传改良，对提高鸡的生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状具有重要的意义。
[0016]具体地，在鸡体重、胫长、胫围、胸宽、胸角、胸骨长、体斜长、全净膛、半净膛、头重、爪重、双翅重、胸肌重、腿重、腿肌重、肌胃重、胸肌重率和/或褪毛后体重性状选育中的应用。体重是鸡的重要经济性状，而胫长、体斜长与鸡体型大小强相关，屠宰率和全净膛率是衡量畜禽产肉性能的主要指标。
[0017]作为进一步地改进，对SNP分子标记的基因型进行检测，选择SNP分子标记为AA或AG基因型的个体。
[0018]上述技术方案的有益效果在于：在实际应用中，可以直接检测如SEQ ID NO.1所示序列5'端起第168位核苷酸的类型，选择该位点为AA纯合型的鸡个体建立遗传资源优良的鸡种群。
[0019]为了实现上述目的，本专利技术中用于检测SNP分子标记基因型的检测引物的技术方案是：
[0020]一种用于检测SNP分子标记基因型的检测引物，所述检测引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2～3所示。
[0021]上述技术方案的有益效果在于：利用上述引物可以有效地扩增出含有与鸡生长、体尺及胴体性状相关的SNP分子标记的片段，辅助基因测序或限制性内切酶酶切等手段，可以快速检测并筛选出AA纯合型的鸡个体。
[0022]为了实现上述目的，本专利技术中用于检测SNP分子标记基因型的试剂盒的技术方案是：
[0023]一种用于检测SNP分子标记基因型的试剂盒，所述试剂盒包括上述检测引物，以及限制性内切酶BsaBI。
[0024]上述技术方案的有益效果在于：经分析验证发现，上述SNP分子标记造成了限制性内切酶BsaBI酶切位点，因此，可以使用SEQ ID NO.2～3所示的引物扩增出待测鸡的含SNP分子标记的片段，然后使用限制性内切酶BsaBI酶切，即可快速准确地判断该位点的具体基因型。
[0025]作为进一步地改进，所述试剂盒还包括dNTPs、PCR反应缓冲液、DNA聚合酶中的一种或几种。
[0026]为了实现上述目的，本专利技术中检测引物或试剂盒在鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种中的应用的技术方案是：
[0027]一种检测引物或试剂盒在鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种中的应用。
[0028]上述技术方案的有益效果在于：本专利技术提供的检测引物和试剂盒能够直接鉴定多态性位点，准确、快速、省时省力的检测该处SNP分子标记的基因型，检测结果准确可靠，可操作性强，性价比高，检测时间短，适宜大面积推广使用。
[0029]为了实现上述目的，本专利技术中一种鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种方法的技术方案是：
[0030]一种鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种方法，包括以下步骤：以待测鸡的基因组DNA为模板，用SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的检测引物进行PCR扩增，对PCR产物用BsaBI内切酶进行酶切反应，若酶切产物为568bp一条条带，SNP分子标记处为纯合GG型，若酶切产物为568bp、403bp和165bp三条条带，SNP分子标记处为杂合AG型，若酶切产物为403bp和165bp两条条带，SNP分子标记处为纯合AA型；选留AA纯合基因型个体。
[0031]上述技术方案的有益效果在于：使用上述改良育种方法，能够早期、有效地预测该SNP位点的基因型，有助于快速选择具本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与鸡生长、体尺及胴体性状相关的SNP分子标记，其特征在于：所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，5
’
端起第168位碱基为A或G。2.一种如权利要求1所述的SNP分子标记在鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种中的应用。3.根据权利要求2所述的SNP分子标记在鸡生长性状和/或胴体性状和/或体尺性状改良育种中的应用，其特征在于：对SNP分子标记的基因型进行检测，选择SNP分子标记为AA基因型的个体。4.一种用于检测权利要求1所述的SNP分子标记基因型的检测引物，其特征在于：所述检测引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2～3所示。5.一种用于检测权利要求1所述的SNP分子标记基因型的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒包括如权利要求4所述的检测引物，以及限制性内切酶BsaBI。6.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒还包括dNTPs、PCR反应缓冲液、DNA聚合酶中的一种或几种。7.一种如权利要求...

【专利技术属性】
技术研发人员：李红，曹玉珠，刘小军，贾其辉，刘晴，王丹丹，张彦华，郭玉洁，李东华，李转见，康相涛，田亚东，蒋瑞瑞，韩瑞丽，李国喜，孙桂荣，
申请(专利权)人：河南农业大学，
类型：发明
国别省市：