与鸡皮肤颜色相关的SNP分子标记的检测引物在鉴定皮肤颜色及鸡遗传育种的应用制造技术

本发明专利技术属于家禽基因工程技术领域，具体涉及一种与鸡皮肤颜色相关的SNP分子标记的检测引物在鉴定皮肤颜色及鸡遗传育种的应用。该SNP分子标记位于鸡CRP基因的CDS区的第1086位，第1086位为C或T。基于该SNP分子标记和检测该标记的引物对，可以通过对其中C/T突变位点的检测，确定目标鸡群皮肤颜色这一性状的基因型，也可以通过基因型判别某一个体的皮肤颜色，为有目的地对鸡群肤色性状进行选择提供依据，提高后代鸡群皮肤颜色的一致性。提高后代鸡群皮肤颜色的一致性。提高后代鸡群皮肤颜色的一致性。

【技术实现步骤摘要】
与鸡皮肤颜色相关的SNP分子标记的检测引物在鉴定皮肤颜色及鸡遗传育种的应用


[0001]本专利技术属于家禽基因工程
，具体涉及一种与鸡皮肤颜色相关的SNP分子标记的检测引物在鉴定皮肤颜色及鸡遗传育种的应用。

技术介绍

[0002]肤色性状是鸡的重要经济性状，鸡的肤色主要分为白色、黄色和黑色三种颜色。乌骨鸡是我国宝贵禽类品种资源，黑肤性状是乌骨鸡的重要特征之一。乌骨鸡富含蛋白质、氨基酸、矿物质、乌鸡肽和微量元素等有益成分，具有丰富的营养价值及药用价值，深受消费者青睐。乌骨鸡的肤色深浅与皮肤组织内黑色素沉积程度有关，且黑色素含量的高低直接影响其的药用价值；相比于浅色皮肤，具有深色皮肤的乌骨鸡有更好的营养价值和药用价值。
[0003]在实际饲养生产应用中，可以通过天然色素来满足人们对鸡皮肤色泽的要求，比如添加黑色素饲养乌骨鸡增加乌骨鸡的肤色深度。但是添加着色剂对肉鸡生产没有任何营养价值，也存在安全性得风险，并且使用着色剂也会增加养殖成本。因此，从长远考虑，可以通过育种和选种的方式，提高其后代鸡群肤色的一致性，减少养殖的成本和避免着色剂带来的风险。因此，建立一种快速鉴别鸡皮肤颜色相关基因型的方法，对于优质鸡育种具有重要作用。
[0004]单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism，SNP)，主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP作为第三代分子标记，具有数量多、分布广、代表性强和遗传稳定性好等特点。目前已经在动植物的遗传多样性分析、基因作图、分子标记辅助育种和功能基因学的研究中得到了广泛的应用。因此，研究与与鸡皮肤颜色相关的分子标记，并在分子育种中加以运用，能够实现鸡皮肤颜色的早期选择，尤其是乌骨鸡，可以节省生产成本并加快遗传进展。
[0005]CRP(C
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反应蛋白)为一种常见的炎症标记物，其参与调控炎症因子的产生，如白细胞介素
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6和肿瘤坏死因子(TNFα)，而炎症因子在黑色素合成过程中也具有关键作用，CRP可能是在黑色素合成与免疫调控起重要作用的关键基因。有研究通过差异表达基因分析和功能分析，发现CRP和OCA2在3个日龄段时(1日龄，10日龄，20日龄)鸡胫组织中都显著差异表达，同时在PPI网络分析中CRP的下游基因是OCA2基因，表明CRP可能是通过OCA2来参与黑色素生成的调控中。关于CRP基因对鸡皮肤颜色的影响，报道甚少，且现有技术中还没有与鸡皮肤颜色性状相关的SNP分子标记相关报道。

技术实现思路

[0006]针对以上问题，本专利技术目的在于提供一种与鸡皮肤颜色相关的SNP分子标记的检测引物在鉴定皮肤颜色及鸡遗传育种的应用。本专利技术可以准确鉴定目标鸡群皮肤颜色这一性状的基因型，也可以通过基因型判别某一个体的皮肤颜色。
[0007]本专利技术提供如下技术方案：
[0008]本专利技术一方面提供一种与鸡皮肤颜色相关的SNP分子标记的检测引物在鉴定皮肤颜色及鸡遗传育种的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示，且SNP位点为CRP基因CDS区第1086位点，为C或T，所述检测引物对P1包括SEQ ID NO:2所示的上游引物、SEQ ID NO:3所示的下游引物；所述检测引物对P2包括SEQ ID NO:4所示的上游引物、SEQ ID NO:5所示的下游引物；所述检测引物对P1为确定SNP位点所用，所述检测引物对P2为确定SNP位点的基因型所用。
[0009]本专利技术另一方面提供一种与鸡皮肤颜色相关的SNP分子标记的检测试剂盒在鉴定皮肤颜色及鸡遗传育种的应用，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示，且SNP位点为CRP基因CDS区第1086位点，为C或T，所述检测试剂盒包括检测引物对P1和检测引物对P2；所述检测引物对P1包括SEQ ID NO:2所示的上游引物、SEQ ID NO:3所示的下游引物；所述检测引物对P2包括SEQ ID NO:4所示的上游引物、SEQ ID NO:5所示的下游引物；所述检测引物对P1为确定SNP位点所用，所述检测引物对P2为酶切引物，为确定SNP位点的基因型所用。
[0010]进一步地，上述应用包括以下步骤：(1)用所述检测引物对P1进行待测鸡基因组DNA样品混池扩增，得到P1检测引物对对应的PCR扩增产物；(2)将所得P1检测引物对对应的PCR扩增产物测序后，经分析获得所述SNP分子标记位点；(3)用所述检测引物对P2扩增待测鸡的基因组DNA，得到P2检测引物对对应的PCR扩增产物；(4)将所得P2检测引物对对应的PCR产物用内切酶BlpI酶切后，获得所述SNP分子标记的基因型；(5)统计待测鸡个体的基因型，并将不同基因型与鸡皮肤颜色性状进行关联性分析，从而获取所述SNP分子标记的有利基因型。
[0011]本专利技术有益效果至少包括：基于本专利技术提供的与鸡皮肤颜色相关的SNP分子标记和检测该标记的引物对，可以通过对其中C/T突变位点的检测，确定目标鸡群皮肤颜色这一性状的基因型，也可以通过基因型判别某一个体的皮肤颜色，为有目的地对鸡群肤色性状进行选择提供依据，提高后代鸡群皮肤颜色的一致性。
附图说明
[0012]图1为鸡CRP基因CDS区C1086T位点(CT)SNP测序峰图；
[0013]图2为鸡CRP基因CDS区C1086T位点(CC)SNP测序峰图；
[0014]图3为鸡CRP基因CDS区C1086T位点(TT)SNP测序峰图；
[0015]图4为鸡CRP基因BlpI内切酶PCR
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RFLP电泳图。
具体实施方式
[0016]所举实施例是为了更好地对本专利技术进行说明，但并不是本专利技术的内容仅局限于所举实施例。所以熟悉本领域的技术人员根据上述
技术实现思路
对实施方案进行非本质的改进和调整，仍属于本专利技术的保护范围。
[0017]本文中使用的术语仅用于描述特定实施例，并且无意于限制本公开。除非在上下文中具有明显不同的含义，否则单数形式的表达包括复数形式的表达。如本文所使用的，应当理解，诸如“包括”、“具有”、“包含”之类的术语旨在指示特征、数字、操作、组件、零件、元
件、材料或组合的存在。在说明书中公开了本专利技术的术语，并且不旨在排除可能存在或可以添加一个或多个其他特征、数字、操作、组件、部件、元件、材料或其组合的可能性。如在此使用的，根据情况，“/”可以被解释为“和”或“或”。
[0018]本专利技术实施例提供一种与鸡皮肤颜色相关的SNP分子标记的检测引物在鉴定皮肤颜色及鸡遗传育种的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示，且SNP位点为CRP基因CDS区第1086位点，为C或T，所述检测引物对P1包括SEQ ID NO:2所示的上游引物、SEQ ID NO:3所示的下游引物；所述检测引物对P2包括SEQ ID NO:4所示的上游引物、SEQ ID NO:5所示的下游引物；所述检测引物对本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与鸡皮肤颜色相关的SNP分子标记的检测引物在鉴定皮肤颜色及鸡遗传育种的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示，且SNP位点为CRP基因CDS区第1086位点，为C或T，所述检测引物对P1包括SEQ ID NO:2所示的上游引物、SEQID NO:3所示的下游引物；所述检测引物对P2包括SEQ ID NO:4所示的上游引物、SEQ IDNO:5所示的下游引物；所述检测引物对P1为确定SNP位点所用，所述检测引物对P2为确定SNP位点的基因型所用。2.一种与鸡皮肤颜色相关的SNP分子标记的检测试剂盒在鉴定皮肤颜色及鸡遗传育种的应用，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示，且SNP位点为CRP基因CDS区第1086位点，为C或T，所述检测试剂盒包括检测引物对P1和检测引物对P2；所述检测引物对P1包括SEQ ID NO:2所示的上游引...

【专利技术属性】
技术研发人员：李春苗，赵振华，吴兆林，黄华云，王钱保，黄正洋，贾雪波，常玲玲，
申请(专利权)人：江苏省家禽科学研究所，
类型：发明
国别省市：