一种基于高通量靶向测序分析的肿瘤化疗分型系统技术方案

技术编号:39063003 阅读:35 留言:0更新日期:2023-10-12 19:55
本发明专利技术公开了一种基于高通量靶向测序分析的肿瘤化疗分型系统,所述分型系统包括检测模块和分型模块;检测模块用于将基因组测序数据比对到人类参考基因组得到含有变异位点信息的文件;分型模块用于对含有变异位点信息的文件进行数据清洗,并结合单位点判型表得到单位点分型结果,再结合已知分型类型和化疗位点进行判型,判型结果包括杂合突变型、纯合突变型及未知类型;所述肿瘤化疗分型系统可以在进行分子生物学诊断时预测患者的化疗位点分型,可分型的点高达99%,准确率高,解决了肿瘤患者在进行化疗用药前缺少患者化疗位点分型结果,进而导致用药不明确的问题。进而导致用药不明确的问题。进而导致用药不明确的问题。

【技术实现步骤摘要】
一种基于高通量靶向测序分析的肿瘤化疗分型系统


[0001]本专利技术涉及肿瘤分型
,具体为一种基于高通量靶向测序分析的肿瘤化疗分型系统。

技术介绍

[0002]化疗是一种广泛应用于肿瘤治疗的方法,通过使用化学药物抑制癌细胞的生长和分裂,从而控制和缓解肿瘤。主要适用于癌症局部进展或者转移后的治疗,并且具有以下优点:
[0003]1.强力杀灭癌细胞:化疗可以通过杀死癌细胞来控制和缓解肿瘤,适用于大多数癌症的治疗;
[0004]2.改善患者症状:肿瘤患者常伴随着许多不良症状,如疼痛、恶心、虚弱等。化疗可以通过控制肿瘤的生长和缓解症状来提高患者的生活质量;
[0005]3.预防复发和转移:化疗可以消灭癌症残留细胞,预防癌症的复发和转移,减少病情的危险性和风险。
[0006]化疗也会带来一定的副作用,如脱发、口腔溃疡、恶心、呕吐、免疫系统下降等,对患者身体健康造成一定的影响。
[0007]化疗分型是一种基于肿瘤个体化特征的治疗策略,通过高通量基因组测序和分析来确定肿瘤患者化疗基因的个体化特征,并根据分析结果来本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于高通量靶向测序分析的肿瘤化疗分型系统,其特征在于,包括检测模块和分型模块;检测模块用于将基因组测序数据比对到人类参考基因组得到含有变异位点信息的文件;分型模块用于对含有变异位点信息的文件进行数据清洗,并结合单位点判型表得到单位点分型结果,再结合已知分型类型和化疗位点进行判型,判型结果包括杂合突变型、纯合突变型及未知类型;所述数据清洗过程根据等位基因频率大小确定纯合野生型、纯合突变型和杂合突变型。2.根据权利要求1所述的分型系统,其特征在于,所述数据清洗过程将等位基因频率小于10%的位点调整为纯合野生型,等位基因频率大于90%的化疗位点调整为纯合突变型,等位基因频率在10%

90%之间的定义为杂合突变型。3.根据权利要求1所述的分型系统,其特征在于,所述判型过程先得到单位点分型类型0/1矩阵,再根据矩阵中符合...

【专利技术属性】
技术研发人员:李天一柳佳琦
申请(专利权)人:上海信诺佰世医学检验有限公司
类型:发明
国别省市:

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