LTBP2基因SNP作为猪胴体和育肥性状相关的分子标记及应用，所述分子标记选自猪第7号染色体上第97752805位，该处存在C/T碱基突变。通过检测本发明专利技术的分子标记的基因型，能够准确且高效地选育出胴体性能和育肥性能佳的优势猪，具有简单、快捷、灵敏度高和特异性好等突出优点，有助于有效缩短育种年限，加快进程，促进新品种选育，应用价值高。应用价值高。
【技术实现步骤摘要】
LTBP2基因SNP作为猪胴体和育肥性状相关的分子标记及应用
[0001]本专利技术涉及生物领域。具体地，本专利技术涉及LTBP2基因SNP作为猪胴体和育肥性状相关的分子标记及应用。
技术介绍
[0002]猪的育肥和胴体都是在养猪生产过程中十分重要的经济性状，通过对这些性状进行优化以提高猪生产性能一直都是畜牧研究中的重要问题，而这些性状较为复杂，选育群体规模受限，普通育种方法难以实现快速改良，其分子标记能提高遗传进展，与育肥和胴体相关的主效基因或分子遗传标记是现代分子育种的关键。
[0003]LTBP2基因属于LTBPs超家族的一员，全长106395bp，包含34个外显子，cDNA长7585bp，编码1728个氨基酸，该基因是一种蛋白质编码基因，是家族中唯一一个不与TGFβ结合，能够独立存储和激活的成员，通过编码潜在转化因子β结合蛋白2发挥作用，主要在肺、心脏、睾丸、胎盘、脾脏、肝脏和骨骼肌中表达。最新研究发现，该基因与脊椎动物椎骨数量有关。
[0004]目前，虽然有研究报道LTBP2基因与猪肋骨数相关，但是，LTBP2基因对猪育肥、胴体的具体影响机制还不是很清楚。所以，通过分子生物学手段，找出影响猪育肥和胴体的突变位点并深入研究位点影响这些性状的机制，对于猪分子育种工作来说是非常有必要的。
技术实现思路
[0005]本专利技术旨在至少在一定程度上解决现有技术中存在的技术问题至少之一。为此，本专利技术提出了与猪胴体性状和育肥性状相关的分子标记、扩增与猪胴体性状和育肥性状相关的分子标记的引物对、预测猪胴体性状和育肥性状的试剂盒、检测猪胴体性状和育肥性状的方法及其在辅助育种中的应用。通过检测分子标记的基因型，能够准确且高效地选育出胴体性能和育肥性能佳的优势猪，具有简单、快捷、灵敏度高和特异性好等突出优点，有助于有效缩短育种年限，加快进程，促进新品种选育，应用价值高。
[0006]在本专利技术的一个方面，本专利技术提出了一种与猪胴体性状和育肥性状相关的分子标记。根据本专利技术的实施例，所述分子标记选自猪第7号染色体上第97752805位，该处存在C/T碱基突变。
[0007]本专利技术的专利技术人通过对猪的LTBP2基因进行扩增、测序及基因分型，并将分型结果与表型关联分析，发现第7号染色体上第97752805位具有C/T的等位基因突变，该突变使得LTBP2基因产生多态性，其不同基因型会显著影响猪育肥性状和胴体性状，具体体现于活体背膘厚、肋骨数、瘦肉率和后腿比例。
[0008]根据本专利技术的实施例，猪第7号染色体上第97752805位处存在CC、CT或TT三种基因型，其中T基因为优势等位基因；所述猪第7号染色体上第97752805位的基因型为TT的猪活体背膘厚极显著低于基因型为CC的猪活体背膘厚；所述猪第7号染色体上第97752805位的基因型为TT的猪肋骨数极显著多于基因型为CT和CC的猪肋骨数；所述猪第7号染色体上第
97752805位的基因型为TT的猪瘦肉率显著高于基因型为CC的猪瘦肉率；所述猪第7号染色体上第97752805位的基因型为TT的猪后腿比例显著高于基因型为CC的猪后腿比例。
[0009]在本专利技术的另一方面，本专利技术提出了一种扩增前面所述与猪胴体性状和育肥性状相关的分子标记的引物对。根据本专利技术的实施例，所述引物对具有如SEQ ID NO：1和2所示的核苷酸序列。利用该引物对可以有效地扩增猪第7号染色体上第97752805位的基因，对扩增产物进行测序，可以准确获知其基因型，进而可以预测猪胴体性状和育肥性状。
[0010]GAGGACAGTTCGTATGGCAT(SEQ ID NO：1)
[0011]CCAAACATCCAGGCTCCTT(SEQ ID NO：2)
[0012]在本专利技术的又一方面，本专利技术提出了一种预测猪胴体性状和育肥性状的试剂盒。根据本专利技术的实施例，所述试剂盒包含前面所述的引物对。利用该试剂盒可以有效地扩增猪第7号染色体上第97752805位的基因，对扩增产物进行测序，可以准确获知其基因型，进而可以预测猪胴体性状和育肥性状。
[0013]在本专利技术的又一方面，本专利技术提出了前面所述与猪胴体性状和育肥性状相关的分子标记、引物对和试剂盒在预测猪胴体性状和育肥性状中的应用。
[0014]在本专利技术的又一方面，本专利技术提出了一种检测猪胴体性状和育肥性状的方法。根据本专利技术的实施例，所述方法包括：(1)检测待测猪的前面所述猪胴体性状和育肥性状相关基因LTBP2的分子标记；(2)基于检测结果，预测所述待测猪的胴体性状和育肥性状。
[0015]根据本专利技术的实施例，步骤(1)包括如下步骤：(1
‑
1)以待测猪个体的DNA为模板，利用前面所述的引物对扩增，获取扩增产物；(1
‑
2)对所述扩增产物进行测序，并使用基因分析软件对测序结果进行基因分型。
[0016]根据本专利技术的实施例，所述扩增的体系为：2
×
PCR Mix 12.5μL，DNA模板1.0μL，上、下游引物各0.5μL，ddH2O补充至总体积25μL；所述扩增的程序为：94℃预变性5min，94℃变性35s，61.2℃退火35s，72℃延伸35s，72℃延伸8min，循环35次。由此，可以有效地扩增猪第7号染色体上第97752805位的基因，对扩增产物进行测序，可以准确获知其基因型，进而可以预测猪胴体性状和育肥性状。
[0017]根据本专利技术的实施例，步骤(2)中，基于检测结果，按照下列方式预测所述待测猪的胴体性状和育肥性状：所述猪第7号染色体上第97752805位的基因型为TT的猪活体背膘厚极显著低于基因型为CC的猪活体背膘厚；所述猪第7号染色体上第97752805位的基因型为TT的猪肋骨数极显著多于基因型为CT和CC的猪肋骨数；所述猪第7号染色体上第97752805位的基因型为TT的猪瘦肉率显著高于基因型为CT和CC的猪瘦肉率；所述猪第7号染色体上第97752805位的基因型为TT的猪后腿比例显著高于基因型为CC的猪后腿比例。
[0018]在本专利技术的又一方面，本专利技术提出了前面所述与猪胴体性状和育肥性状相关的分子标记、引物对、试剂盒和方法在辅助育种中的应用。
[0019]根据本专利技术的实施例，所述辅助育种包括：筛选猪胴体性状和育肥性状的优势猪。
[0020]根据本专利技术的实施例，所述胴体性状和育肥性状包括：活体背膘厚、肋骨数、瘦肉率和后腿比例。
[0021]根据本专利技术的实施例，所述优势猪的第7号染色体上第97752805位的基因型为TT。
[0022]本专利技术的附加方面和优点将在下面的描述中部分给出，部分将从下面的描述中变得明显，或通过本专利技术的实践了解到。
附图说明
[0023]本专利技术的上述和/或附加的方面和优点从结合下面附图对实施例的描述中将变得明显和容易理解，其中：
[0024]图1显示了猪基因组DNA琼脂糖凝胶电泳图；
[0025]图2显示了利用表1引物和表2扩增条件对LTBP本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种与猪胴体性状和育肥性状相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记选自猪第7号染色体上第97752805位，该处存在C/T碱基突变。2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，猪第7号染色体上第97752805位处存在CC、CT或TT三种基因型，其中T基因为优势等位基因；所述猪第7号染色体上第97752805位的基因型为TT的猪活体背膘厚极显著低于基因型为CC的猪活体背膘厚；所述猪第7号染色体上第97752805位的基因型为TT的猪肋骨数极显著多于基因型为CT和CC的猪肋骨数；所述猪第7号染色体上第97752805位的基因型为TT的猪瘦肉率显著高于基因型为CC的猪瘦肉率；所述猪第7号染色体上第97752805位的基因型为TT的猪后腿比例显著高于基因型为CC的猪后腿比例。3.一种扩增权利要求1和2所述与猪胴体性状和育肥性状相关的分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对具有如SEQ ID NO：1和2所示的核苷酸序列。4.一种预测猪胴体性状和育肥性状的试剂盒，其特征在于，包括权利要求3所述的引物对。5.权利要求1或2所述与猪胴体性状和育肥性状相关的分子标记、权利要求3所述的引物对和权利要求4所述的试剂盒在预测猪胴体性状和育肥性状中的应用。6.一种检测猪胴体性状和育肥性状的方法，其特征在于，包括：(1)检测待测猪的权利要求1或2所述的猪胴体性状和育肥性状相关基因LTBP2的分子标记；(2)基于检测结果，预测所述待测猪的胴体性状和育肥性状。7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，步骤(1)包括如下步骤：(1
‑
1)以待测猪个体的DNA为模板，利用权利...
【专利技术属性】
技术研发人员：董新星，杨瑞飞，严达伟，金思琪，周春露，兰艺，罗舒元，兰国湘，
申请(专利权)人：云南农业大学，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。