一种位于7号染色体上与鸡生长性状相关的SNP位点及应用制造技术

本发明专利技术提供了鸡7号染色体上与鸡生长发育性状相关的SNP位点，所述SNP标记的位点为鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位G>A，第11913258位C>T，第11913354位G>A。本发明专利技术通过优选上述SNP的优势等位基因，能够逐代增加优势等位基因频率，提高鸡的优良生长发育性状，加快鸡遗传改良进展从而有效提高鸡育种的经济效益。济效益。济效益。

【技术实现步骤摘要】
一种位于7号染色体上与鸡生长性状相关的SNP位点及应用
[0001]用

[0002]本专利技术属于生物
，具体涉及鸡染色体上与生长发育性状相关的SNP位点及其应用。

技术介绍

[0003]种质资源，是在长久的社会发展中不断形成的重要的自然资源，含有各种丰富的优秀性状基因，这对改变当前畜禽现状具有重要作用。但是目前存在优良地方品种保护的问题，，尤其一些地方品种因保护不利而灭绝或濒临灭绝；育种技术较落后，畜禽疾病净化不到位，种质资源依赖进口，因此对畜禽种质资源的保护和选育已经迫在眉睫。
[0004]我国家禽养殖历史悠久，地方遗传资源丰富，总共有33个畜禽900多个品种，包括了地方、培育及引进品种和相关配套系；畜禽种质资源包括鸡240种，其地方品种就达115种之多，数量丰富。畜禽种质资源是保障畜产品有效供给的战略性资源，是农业科技原始创新与现代种业发展的物质基础。我国禽类资源虽然种类丰富，但大部分生产性能水平低，生长速度慢，从而导致耗料严重，饲养成本高。畜禽种质资源保护与开发利用已被高度重视，国家将重点支持畜禽种质资源发掘、品系培育、产业化开发等畜禽遗传资源改良和种业提升工程。
[0005]畜禽的生长速度缓慢，导致市场化程度低，从而导致养殖效益下降，使畜禽逐渐被市场边缘化，甚至面临淘汰的风险。畜禽产业在生产过程中非常重视体型的发育，可以很直观地用生长发育来判断畜禽的健康发育状况，生长发育状况很大程度上决定了畜禽的生产性能；其中骨骼发育和体重的发育规律略有不同，骨骼在10周龄发育较快，达到了成年时期的80％以上，12周龄达到90％，但体重则是在不断地发育过程中，8周龄时仅仅完成了最大体重的27％，而胫长又是衡量生长发育的关键指标，故可通过胫长衡量其生长发育情况，总之前期更应该关注骨骼的生长发育。根据畜禽骨骼和体重生长发育关系，必须在育雏期保证全面的营养供给，饲喂全价、营养的雏鸡料，使得胫长和体重均达标。
[0006]随着人们生活水平的提高和市场竞争日益激烈，消费者对肉品质的要求也在提高，肉质鲜美、风味独特的畜禽产品在市场上越来越受欢迎，无污染、无药物残留的绿色食品成为人们的追求。静原鸡具有耐粗饲、宜放牧、肉质鲜美等特点，在草原、林带、山地上放牧饲养，是一种天然的无公害食品，已得到广大消费者的普遍欢迎和认可。然而关于静原鸡的生长发育性状的研究，特别是与生长发育性状相关联的分子标记开发还十分欠缺。本专利技术从静原鸡生长发育规律开始，测量静原鸡关键时间点的体尺性状，分析其相关性；并通过研究KLF7基因在静原鸡中的多态性位点和生长性状相关联，筛选出对静原鸡生长发育性状有影响的位点，为地方鸡种特别是静原鸡分子育种，品种改良提供基础。

技术实现思路

[0007]针对现有技术存在的问题，本专利技术提供通过KASP基因分型和相关性分析策略鉴别到了显著影响鸡生长发育性状的SNP，将其用于分子标记辅助选择和基因组选择中，选择对
改良鸡生长发育性状有利的基因型进行留种，从而逐代提高优势等位基因的基因频率，则能加快种鸡育种改良的进程，为地方鸡养殖带来巨大经济效益。
[0008]首要目的在于确定影响鸡生长发育性状的SNP分子标记。所述分子标记位于鸡基因组参考序列7号染色体(NC_052538.1)上。
[0009]所述的分子标记的SNP位点对应于鸡GRCg7b基因组7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位G>A突变，和/或第11913258位C>T突变，和/或第11913354位G>A突变。
[0010]所述SNP标记如SEQ ID NO:1，和/或SEQ ID NO:2，和/或SEQ ID NO:3所示，具体如下表所示
[0011][0012][0013]本专利技术的另一目的在于提供检测上述分子标记的KASP引物或包含上述KASP引物的检测试剂盒，所述引物如下表所示
[0014][0015]本专利技术的另一目的在于提供上述的分子标记在筛选优良生长性状的鸡个体中的应用。具体为，检测鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型，和/或第11913258位基因型，和/或第11913354位基因型，保留鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型AA的个体作为种鸡。
[0016]在一个优选实施例中，保留鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型AA，且第11913258位基因型为CC，且第11913354位基因型GG的个体作为种鸡。
[0017]在另一个优选实施例中，保留鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型AG，且第11913258位基因型为CT，且第11913354位基因型GA的个体作为种鸡。
[0018]本专利技术的另一目的在于提供一种上述KASP引物或检测试剂盒在鉴定影响鸡生长发育性状的基因型中的应用。具体为，利用上述KASP引物检测鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型，和/或第11913258位基因型，和/或第11913354位基因型，保留鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型AA的个体作为种鸡。
[0019]进一步地，将上述的KASP引物或检测试剂盒在鸡基因组选择育种中的应用。具体为，利用上述KASP引物或检测试剂盒检测鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型，和/或第11913258位基因型，和/或第11913354位基因型，保留鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型AA的个体作为种鸡。
[0020]在一个优选实施例中，保留鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型AA，且第11913258位基因型为CC，且第11913354位基因型GG的个体作为种鸡。
[0021]在另一个优选实施例中，保留鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型AG，且第11913258位基因型为CT，且第11913354位基因型GA的个体作为种鸡。
[0022]进一步地，将上述的KASP引物或检测试剂盒在改良鸡生长性状中的应用。具体为，利用上述KASP引物或检测试剂盒检测鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型，和/或第11913258位基因型，和/或第11913354位基因型，保留鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型AA的个体作为种鸡。
[0023]在一个优选实施例中，保留鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型AA，且第11913258位基因型为CC，且第11913354位基因型GG的个体作为种鸡。
[0024]在另一个优选实施例中，保留鸡7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位基因型AG，且第11913258位基因型为CT，且第11913354位基本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.影响鸡生长发育性状的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP标记位点包含对应于鸡基因组GRCg7b基因组7号染色体(NC_052538.1)上第11913237位G>A突变，和/或第11913258位C>T突变，和/或第11913354位G>A突变的分子标记。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP标记位于以下序列中，其中，11913237位G>A突变位于SEQ ID NO.1：TGGGAGCACTGCTGTGATGTCTCTCTAATAGCGATTTCTTTCCCTCCCTCCCCCTCCTGCAGACATGCCTCG AGTTGGAGCGATACCTTCAGACTGAACC[G/A]CGGAAGATCTCTGAGAGCTTCGGTGAGGACTTGGACTGCTTCC TTCATGCCTCCTCAGCTCCAGATGCAGAGGACAGTATCCGACGGCTGGACCCCATCC中；11913258位C>T突变位于SEQ ID NO.2：TCTCTAATAGCGATTTCTTTCCCTCCCTCCCCCTCCTGCAGACATGCCTCGAGTTGGAGCGATACCTTCAG ACTGAACCGCGGAAGATCTCTGAGAGCTT[C/T]GGTGAGGACTTGGACTGCTTCCTTCATGCCTCCTCAGCTCCA GATGCAGAGGACAGTATCCGACGGCTGGACCCCATCCTTTTGCCAGTGGAGACGAGTA中；11913354位G>A突变位于SEQ ID NO.3：GCTTCGGTGAGGACTTGGACTGCTTCCTTCATGCCTCCTCAGCTCCAGATGCAGAGGACAGTATCCGACGG CTGGACCCCATCCTTTTGCCAGTGGAGAC[G/A]AGTATGTGCGACAAAGGCGCCAACATGGACATTATCCTCTCA CGGGACAAGCTGCTGTCTGAGACGTGCCTCAGCCTGCAGTCCACCAGCTCTTCCACAG中。3.用于检测权利要求1或2所述的SNP分子标...

【专利技术属性】
技术研发人员：张娟，王荟珺，邓占钊，马天佑，何亮宏，曹国伟，蒋秋斐，陈亚飞，马丽娜，张莉，于正青，
申请(专利权)人：宁夏大学，
类型：发明
国别省市：