一种预测非组蛋白乳酸化位点的方法技术

本发明专利技术公开了一种预测非组蛋白乳酸化位点的方法，包括以下步骤：进行蛋白结构的获取，进行小分子的准备，基于电荷引力预测潜在的赖氨酸位点，基于存在电荷引力的潜在赖氨酸位点的验证。本发明专利技术通过计算模型可实现有效、快速、准确地预测非组蛋白赖氨酸乳酸化位点，填补Kla位点的常规表征湿实验方法的缺陷，为非组蛋白乳酸化研究提供新思路。同时鉴于本发明专利技术出色的性能和通用性，可以成为其他类型PTM位点预测模型的有效基线，促进相关领域的进一步发展。展。展。

【技术实现步骤摘要】
一种预测非组蛋白乳酸化位点的方法


[0001]本专利技术涉及生命医学与数据分析
，特别涉及一种预测非组蛋白乳酸化位点的方法。

技术介绍

[0002]蛋白质翻译后修饰(Post
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translational modification，PTM)是指mRNA翻译成蛋白质后，特定氨基酸残基的共价修饰，它是增加蛋白质功能和结构多样性的关键机制，可调节蛋白质的活性、定位、折叠、以及蛋白与其他生物大分子间(包括蛋白、核酸、脂质等)相互作用。越来越多的研究发现，许多重要的生命活动、疾病发生不仅与蛋白质的丰度相关，更重要的是被各类蛋白质翻译后修饰所调控。蛋白质修饰组学通过深入研究蛋白质翻译后修饰水平的变化差异，对揭示生命活动的机理、筛选疾病的临床标志物、鉴定药物靶点等方面具有重要意义。
[0003]乳酸化修饰(lactylation)是近年来新发现的蛋白质翻译后修饰，是乳酰基与蛋白质赖氨酸残基共价偶联，从而促进基因调控的一种蛋白质修饰方式，因此也被称为赖氨酸乳酸化(Kla)或乳酸化。早在数年前就有研究者发现了蛋白质的乳酰基替代。1本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种预测非组蛋白乳酸化位点的方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤一：进行蛋白结构的获取；步骤二：进行小分子的准备；步骤三：基于电荷引力预测潜在的赖氨酸位点；步骤四：基于存在电荷引力的潜在赖氨酸位点的验证。2.根据权利要求1所述的一种预测非组蛋白乳酸化位点的方法，其特征在于，在步骤一中，从蛋白结构数据库Proteindatabank中获取蛋白3D结构的pdb文件。3.根据权利要求1所述的一种预测非组蛋白乳酸化位点的方法，其特征在于，在步骤二中，通过PubChem数据库获取L
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乳酸3D结构的sdf文件，并导入ChemBioDrawUltra14.0软件中去除羧基上的H，加负电子，导出为L
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乳酸根离子。4.根据权利要求1所述的一种预测非组蛋白乳酸化位点的方法，其特征在于，在步骤三中，将步骤一中的相关蛋白分别导入BIOVIADiscovery Studio2021版本软件中，清除3D结构中的水分子、杂原子和其他配体，通过AddPolar给复合物添加极性氢，随后使用FromReceptorCavities定义活性口袋，最后添加CHARMm力场。5.根据权利要求4所述的一种预测非组蛋白乳酸化位点的方法，其特征在于，将L
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乳酸根离子导入D...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵天毓，陈立，张明，张美双，
申请(专利权)人：吉林大学，
类型：发明
国别省市：