一种瓜蒌SSR分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术涉及分子生物学技术领域，公开了一种瓜蒌SSR分子标记及其应用，包括一种瓜蒌SSR分子标记，所述瓜蒌SSR分子标记如GL001

【技术实现步骤摘要】
一种瓜蒌SSR分子标记及其应用


[0001]本专利技术涉及分子生物学
，尤其涉及一种瓜蒌SSR分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]瓜蒌作为重要的药用植物和休闲食品，在中国，长期历史进化过程中形成了适应各地生态环境的品种资源，具有广泛的遗传多样性和广泛的遗传基础。加强瓜蒌遗传资源研究和利用，发掘优异相关基因为育种服务，是培养高产、优质和抗逆瓜蒌新品种的有效途径，是促进育种其进程的重要推动力。为了科学、公正、合理地开展相关测定，保护品种合法权益，促进种质资源评价，提高种质资源鉴定水平，急需制定适合瓜蒌品种鉴定技术规程。
[0003]SSR标记具有
①
数量丰富，广泛分布于整个基因组，
②
具有较多的等位性变异，
③
共显性标记，可鉴别出杂合子和纯合子，
④
实验重复性好，结果可靠等优点。已经被广泛使用于大田作物的品种鉴定和分子标记辅助育种。但当前瓜蒌上的研究还未见报道，开发瓜蒌SSR分子标记，为瓜蒌的品种鉴定，基因分型、乃至遗传定位和分子标记辅助选择奠定基础。能够提高瓜蒌品种鉴定的科学性、实用性和适用性。

技术实现思路

[0004]针对现有技术存在的上述不足，本专利技术提供一种瓜蒌SSR分子标记及其应用。
[0005]本专利技术采用以下技术方案实现：一种瓜蒌SSR分子标记，所述瓜蒌SSR分子标记如GL001
‑
GL064所示的其中任意一种或至少任意两种组成的混合物。
[0006]所述瓜蒌SSR分子标记用于瓜蒌性质的检测。
[0007]所述瓜蒌性质包括瓜蒌品种、瓜蒌基因分型、瓜蒌亲缘关系、瓜蒌遗传多样性及瓜蒌基因定位。
[0008]一种瓜蒌SSR分子标记在制备用于检测瓜蒌性质的生物制品中应用，所述生物制品包含权利要求1所述的瓜蒌SSR分子标记。
[0009]所述生物制品包括试剂、试剂盒、芯片。
[0010]一种瓜蒌SSR分子标记在检测瓜蒌性质的方法，其特征在于，包括以下步骤：
[0011]S1瓜蒌基因组DNA提取：
[0012]提取待检样品的DNA，其中待检样品为已鉴定为瓜蒌或者瓜蒌属的植物；
[0013]S2SSR扩增反应：
[0014]提取后的待检样品的DNA加入上下游引物进行扩增反应；
[0015]S3电泳监测：
[0016]SSR扩增反应后的产物进行非变性丙烯酰胺凝胶电泳检测；
[0017]S4结果统计分析：
[0018]依据电泳检测后的条带的位置，判断分子量大小，确定引物的多态性和鉴定相关等位基因。
[0019]相比现有技术，本专利技术的有益效果在于：
[0020]本专利技术提出一种高效、便捷、快速鉴定不同基因型瓜蒌的SSR的标记和相关方法，仅仅需要基本的分子生物学仪器设备，灵敏度高，SSR具有共显性，能够鉴别瓜蒌的纯合型和杂合型，具有很高的特异性。本专利技术对于瓜蒌的品种鉴定、基因分型、亲缘关系分析、遗传多样性分析和基因定位等都有重要意义。
附图说明
[0021]图1为本专利技术提供的RNA测序分析图，其中：
[0022]图1A为Mapped_reads在mRNA上的位置分布图；
[0023]图1B为插入片段大小分布图；
[0024]图1C为转录组测序数据饱和度模拟图；
[0025]图2为本专利技术提供的瓜蒌的不同重复基元的重复数目分布及部分引物筛选电泳图，其中：
[0026]图2A为瓜蒌的不同重复基元的重复数目分布图；
[0027]图1B为在皖篓9号和17号上的引物筛选电泳图
[0028]图3为本专利技术提供的GL001、GL002、GL003和GL004分子标记的电泳检测图；
[0029]图4为本专利技术提供的GL005、GL006和GL007分子标记的电泳检测图；
[0030]图5为本专利技术提供的GL008、GL009和GL010分子标记的电泳检测图；
[0031]图6为本专利技术提供的GL011、GL012和GL013分子标记的电泳检测图；
[0032]图7为本专利技术提供的GL014、GL015和GL016分子标记的电泳检测图；
[0033]图8为本专利技术提供的GL017、GL018和GL019分子标记的电泳检测图；
[0034]图9为本专利技术提供的GL020、GL021和GL022分子标记的电泳检测图；
[0035]图10为本专利技术提供的GL023、GL024和GL025分子标记的电泳检测图；
[0036]图11为本专利技术提供的GL026、GL027和GL028分子标记的电泳检测图；
[0037]图12为本专利技术提供的GL029、GL030和GL031分子标记的电泳检测图；
[0038]图13为本专利技术提供的GL032、GL033和GL034分子标记的电泳检测图；
[0039]图14为本专利技术提供的GL035、GL036和GL037分子标记的电泳检测图；
[0040]图15为本专利技术提供的GL038、GL039和GL040分子标记的电泳检测图；
[0041]图16为本专利技术提供的GL041、GL042和GL043分子标记的电泳检测图；
[0042]图17为本专利技术提供的GL044、GL045和GL046分子标记的电泳检测图；
[0043]图18为本专利技术提供的GL047、GL048和GL049分子标记的电泳检测图；
[0044]图19为本专利技术提供的GL050、GL051和GL052分子标记的电泳检测图；
[0045]图20为本专利技术提供的GL053、GL054和GL055分子标记的电泳检测图；
[0046]图21为本专利技术提供的GL056、GL057和GL058分子标记的电泳检测图；
[0047]图22为本专利技术提供的GL059、GL060和GL061分子标记的电泳检测图；
[0048]图23为本专利技术提供的GL062、GL063和GL064分子标记的电泳检测图。
具体实施方式
[0049]下面，结合附图以及具体实施方式，对本专利技术做进一步描述，需要说明的是，在不相冲突的前提下，以下描述的各实施例之间或各技术特征之间可以任意组合形成新的实施
例。
[0050]实施例1：
[0051]一种瓜蒌SSR分子标记，所述瓜蒌SSR分子标记如GL001
‑
GL064所示的其中任意一种或至少任意两种组成的混合物。
[0052]所述瓜蒌SSR分子标记用于瓜蒌性质的检测。
[0053]所述瓜蒌性质包括瓜蒌品种、瓜蒌基因分型、瓜蒌亲缘关系、瓜蒌遗传多样性及瓜蒌基因定位。
[0054]一种瓜蒌SSR分子标记在制备用于检测瓜蒌性质的生物制品中应用，其特征在于，所述生物制品包含权利要求1所述的瓜蒌SSR分子标记。
[0055]所述生物制品包括试剂、试剂盒、芯片。
[005本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种瓜蒌SSR分子标记，其特征在于，所述瓜蒌SSR分子标记如GL001
‑
GL064所示的其中任意一种或至少任意两种组成的混合物。2.如权利要求1所述的一种瓜蒌SSR分子标记，其特征在于，所述瓜蒌SSR分子标记用于瓜蒌性质的检测。3.如权利要求1所述的一种瓜蒌SSR分子标记，其特征在于，所述瓜蒌性质包括瓜蒌品种、瓜蒌基因分型、瓜蒌亲缘关系、瓜蒌遗传多样性及瓜蒌基因定位。4.一种瓜蒌SSR分子标记在制备用于检测瓜蒌性质的生物制品中应用，其特征在于，所述生物制品包含权利要求1所述的瓜蒌SSR分子标记。5.如权...

【专利技术属性】
技术研发人员：何庆元，刘丽，徐荣华，李正鹏，朱军军，孙武，
申请(专利权)人：安徽科技学院，
类型：发明
国别省市：