创建单病种数据库的方法、装置、设备及存储介质制造方法及图纸

本公开涉及一种创建单病种数据库的方法、装置、设备及存储介质，其中，方法包括：配置单病种指标和指标提取规则；若指标提取规则的输入源类型为指定字段输入，则从临床数据库中获取指定字段的临床数据；若输入源类型为指定变量输入，则从已定义变量的数据中确定指定变量的数据；根据NLP模型提取与单病种指标对应的单病种数据；若输出选择为变量输出，则按照变量映射配置建立单病种数据与定义的变量之间的映射关系；若输出选择为指标输出，则按照指标映射配置将单病种数据存储至单病种数据库。根据本公开的技术方案，能够实现自动化的单病种指标数据提取，提高创建单病种数据库的效率，适应各单病种的指标提取需求。适应各单病种的指标提取需求。适应各单病种的指标提取需求。

【技术实现步骤摘要】
创建单病种数据库的方法、装置、设备及存储介质


[0001]本公开涉及人工智能
，尤其涉及一种创建单病种数据库的方法、装置、设备及存储介质。

技术介绍

[0002]随着医院信息化建设持续深入，医院积累了大量具有研究价值的临床数据，为开展临床研究奠定了基础。由于院内临床信息化系统的数据结构是针对所有疾病的共性需求进行的数据结构设计，其数据存储结构更符合通用信息化存储需求，在开展具体的单病种科研项目过程中，按照课题的研究需要来定义对应科研数据指标的要求，对应科研指标的数据需要通过对临床数据库采集、转换和指标提取，才能转换为立足科研项目需要的单病种数据库。
[0003]目前，临床数据转换为单病种数据库的过程中，需要按单病种库中对应的指标要求进行大量的提取和转换工作，人工逐一进行指标内容提取时，对应工作量巨大，而基于临床数据通过数据转换工具对指标数据进行提取时，通过正则或关键词进行指标转换，若出现规则性不强或未纳入正则或关键词的文本，会导致对应指标无法提取。

技术实现思路

[0004]为了解决上述技术问题，本公开提供了一种创建单病种数据库的方法、装置、设备及存储介质。
[0005]第一方面，本公开实施例提供了一种创建单病种数据库的方法，包括：
[0006]配置单病种指标和指标提取规则，其中，所述指标提取规则包括输入源类型和输出选择；
[0007]若所述输入源类型为指定字段输入，则从临床数据库中获取所述指定字段的临床数据，作为目标临床数据；
[0008]若所述输入源类型为指定变量输入，则从已定义变量的数据中确定所述指定变量的数据，作为所述目标临床数据；
[0009]基于所述目标临床数据，根据预训练的NLP模型提取与所述单病种指标对应的单病种数据；
[0010]若所述输出选择为变量输出，则按照变量映射配置建立所述单病种数据与定义的变量之间的映射关系；
[0011]若所述输出选择为指标输出，则按照指标映射配置将所述单病种数据存储至单病种数据库。
[0012]第二方面，本公开实施例提供了一种创建单病种数据库的装置，包括：
[0013]配置模块，用于配置单病种指标和指标提取规则，其中，所述指标提取规则包括输入源类型和输出选择；
[0014]第一获取模块，用于若所述输入源类型为指定字段输入，则从临床数据库中获取
所述指定字段的临床数据，作为目标临床数据；
[0015]第二获取模块，用于若所述输入源类型为指定变量输入，则从已定义变量的数据中确定所述指定变量的数据，作为所述目标临床数据；
[0016]提取模块，用于基于所述目标临床数据，根据预训练的NLP模型提取与所述单病种指标对应的单病种数据；
[0017]第一生成模块，用于若所述输出选择为变量输出，则按照变量映射配置建立所述单病种数据与定义的变量之间的映射关系；
[0018]第二生成模块，用于若所述输出选择为指标输出，则按照指标映射配置将所述单病种数据存储至单病种数据库。
[0019]第三方面，本公开实施例提供了一种电子设备，包括：处理器；用于存储所述处理器可执行指令的存储器；所述处理器，用于从所述存储器中读取所述可执行指令，并执行所述指令以实现上述第一方面所述的创建单病种数据库的方法。
[0020]第四方面，本公开实施例提供了一种计算机可读存储介质，所述存储介质存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现上述第一方面所述的创建单病种数据库的方法。
[0021]本公开实施例提供的技术方案与现有技术相比具有如下优点：通过配置单病种指标和指标提取规则，根据指标提取规则的输入源类型中的指定字段输入/变量输入，获取目标临床数据，根据预训练的NLP模型提取与单病种指标对应的单病种数据，以及根据输出选择中的变量输出/指标输出，将单病种数据存储至单病种数据库，由此，能够基于已有的临床数据库进行单病种数据库的创建，基于NLP实体和关系提取技术实现自动化的单病种指标数据提取，提高创建单病种数据库的效率，并且，按单病主题定义指标组后，在线定义的变量，可在指标提取规则中进行传递引用，以适应各单病种的指标提取需求，简化用户操作。
附图说明
[0022]此处的附图被并入说明书中并构成本说明书的一部分，示出了符合本公开的实施例，并与说明书一起用于解释本公开的原理。
[0023]为了更清楚地说明本公开实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，对于本领域普通技术人员而言，在不付出创造性劳动性的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0024]图1为本公开实施例所提供的一种创建单病种数据库的方法的流程示意图；
[0025]图2为本公开实施例所提供的一种指标提取规则配置流程示意图；
[0026]图3为本公开实施例所提供的一种模型训练示意图；
[0027]图4为本公开实施例所提供的一种创建单病种数据库的流程示意图；
[0028]图5为本公开实施例所提供的一种创建单病种数据库的装置的结构示意图。
具体实施方式
[0029]为了能够更清楚地理解本公开的上述目的、特征和优点，下面将对本公开的方案进行进一步描述。需要说明的是，在不冲突的情况下，本公开的实施例及实施例中的特征可
以相互组合。
[0030]在下面的描述中阐述了很多具体细节以便于充分理解本公开，但本公开还可以采用其他不同于在此描述的方式来实施；显然，说明书中的实施例只是本公开的一部分实施例，而不是全部的实施例。
[0031]图1为本公开实施例所提供的一种创建单病种数据库的方法的流程示意图，本公开实施例提供的方法可以由创建单病种数据库的装置来执行，该装置可以采用软件和/或硬件实现，并可集成在任意具有计算能力的电子设备上。
[0032]如图1所示，本公开实施例提供的创建单病种数据库的方法可包括：
[0033]步骤101，配置单病种指标和指标提取规则。
[0034]本实施例的方法，用于以下场景：基于已有的临床数据库，根据单病种科研项目的指标分析需求，从临床数据库中提取相应的指标数据以存储到单病种数据库中。
[0035]本实施例中，单病种指标包括单病种名称、单病种遗传史、单病种检查检验报告等。首先根据通过对主题库和指标的定义完成单病种数据库的初始化，具体地，根据科研项目对单病数据库指标的需求，在线进行单病种主题库定义，定义主题库后，在线对单病种指标进行动态配置和管理，其中，在配置指标时可以指定对应指标的展现形式，以用于进行人工确认时表单的动态显示。可选地，配置是否指定来源数据，若是，则与临床数据库的临床数据模型相关联，以获取指定来源的临床数据，例如，指定来源数据为特定部门的临床数据，从而在数据确认环节，提高确认人员的工作效率。
[0036]其中，配置单病种指标后，在线配置指标提取规则，临床数据库中涉及非结构化文本数据，在进行数据提本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种创建单病种数据库的方法，其特征在于，包括：配置单病种指标和指标提取规则，其中，所述指标提取规则包括输入源类型和输出选择；若所述输入源类型为指定字段输入，则从临床数据库中获取所述指定字段的临床数据，作为目标临床数据；若所述输入源类型为指定变量输入，则从已定义变量的数据中确定所述指定变量的数据，作为所述目标临床数据；基于所述目标临床数据，根据预训练的NLP模型提取与所述单病种指标对应的单病种数据；若所述输出选择为变量输出，则按照变量映射配置建立所述单病种数据与定义的变量之间的映射关系；若所述输出选择为指标输出，则按照指标映射配置将所述单病种数据存储至单病种数据库。2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述指标提取规则还包括指标维度，所述指标维度包括病历维度和病人维度两种，所述基于所述目标临床数据，根据预训练的NLP模型提取与所述单病种指标对应的单病种数据，包括：若所述指标维度为病历维度，则根据预训练的NLP模型，分别从单个病人的每个病历所涉及的目标临床数据中提取与所述单病种指标对应的单病种数据，以分别生成每个病历所对应的单病种数据；若所述指标维度为病人维度，则根据预训练的NLP模型，从单个病人的所有病历所涉及的目标临床数据中提取与所述单病种指标对应的单病种数据，以生成所述单个病人对应的单病种数据。3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，还包括：获取训练样本数据，并基于所述单病种指标对所述训练样本数据进行标记；基于所述训练样本数据，训练所述NLP模型。4.如权利要求3所述的方法，其特征在于，还包括：将提取的与所述单病种指标对应的单病种数据发送至人工审核模块，以进行人工确认；根据人工确认结果更新与所述单病种指标对应的单病种数据。5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述获取训练样本数据，包括：若...

【专利技术属性】
技术研发人员：周建国，刘磊，周笑楠，袁天慧，张东，康俊祥，
申请(专利权)人：北京易康医疗科技有限公司，
类型：发明
国别省市：