一种qPCR检测数据可视化处理方法、系统和存储介质技术方案

技术编号:38715436 阅读:6 留言:0更新日期:2023-09-08 14:58
本发明专利技术公开了一种qPCR检测数据可视化处理方法、系统和存储介质,方法包括:获取qPCR检测数据;对qPCR检测数据进行预处理,得到第一检测数据;根据预设质量标准,对第一检测数据的有效性进行检测,得到第一有效数据,并对没有相对应预设质量标准的检测数据进行标注,得到第二检测数据;通过人工检测的方式对第二检测数据的有效性进行检测,得到第二有效数据;根据第一有效数据和第二有效数据进行计算,得到检测数据矩阵;对检测数据矩阵进行数据可视化处理,并生成检测报告。本发明专利技术能够对不同格式的qPCR检测数据进行格式转换,并根据用户预设指标标准对数据进行质量评估和筛选,并对有效数据进行可视化展示。效数据进行可视化展示。效数据进行可视化展示。

【技术实现步骤摘要】
一种qPCR检测数据可视化处理方法、系统和存储介质


[0001]本申请涉及数据处理和数据传输领域,更具体的,涉及一种qPCR检测数据可视化处理方法、系统和存储介质。

技术介绍

[0002]qPCR(定量聚合酶链反应)是一种广泛应用于生命科学领域的分子生物学技术,能够对特定的DNA或RNA序列进行高灵敏度、高精度和高通量的定量检测和分析。qPCR在基因表达分析、疾病诊断、药物筛选、遗传变异检测等方面具有重要的应用价值。然而,由于qPCR实验涉及多个步骤和参数,且受到多种因素的影响,因此需要对实验数据进行有效的整合和质量控制,以保证实验结果的可信度和可重复性。此外,由于qPCR实验数据通常具有复杂性和多样性,因此需要对数据进行合理的图形展示,以便于用户对数据进行深入的理解和解释。
[0003]因此现有技术存在缺陷,急需改进。

技术实现思路

[0004]鉴于上述问题,本专利技术的目的是提供一种qPCR检测数据可视化处理方法、系统和存储介质,能够从不同的qPCR仪器和实验平台导入原始数据,进行必要的格式转换和归一化处理,然后根据用户的设定参数和标准,对数据进行质量评估和筛选,剔除异常值和无效数据。该系统还能够对数据进行多种图形展示,如绘制质量控制图、CT值分布图、Tm值分布图等,以及生成详细的实验报告和结果表格。
[0005]本专利技术第一方面提供了一种qPCR检测数据可视化处理方法,包括:
[0006]获取qPCR检测数据;
[0007]对所述qPCR检测数据进行预处理,得到第一检测数据;
[0008]根据预设质量标准,对所述第一检测数据的有效性进行检测,得到第一有效数据,并对没有相对应预设质量标准的检测数据进行标注,得到第二检测数据;
[0009]通过人工检测的方式对所述第二检测数据的有效性进行检测,得到第二有效数据;
[0010]根据所述第一有效数据和所述第二有效数据进行计算,得到检测数据矩阵;
[0011]对所述检测数据矩阵进行数据可视化处理,并生成检测报告。
[0012]本方案中,所述对所述qPCR检测数据进行预处理,得到第一检测数据,包括:
[0013]对所述qPCR检测数据进行数据清洗;
[0014]对清洗后的检测数据进行格式转换,得到第一检测数据。
[0015]本方案中,所述根据预设质量标准,对所述第一检测数据的有效性进行检测,得到第一有效数据,并对没有相对应预设质量标准的检测数据进行标注,得到第二检测数据,包括:
[0016]根据所述第一检测数据进行分析,判断所述第一检测数据的每一项子数据是否存
在相对应的预设阈值区间;
[0017]若否,则将所述子数据标注为第二检测数据,并通过人工检测的方式对所述第二检测数据的数据有效性进行检测;
[0018]若是,则判断所述子数据是否处于相对应的预设阈值区间;
[0019]若不处于,则将所述数据标注为失控数据;
[0020]若处于,则标注为第一有效数据。
[0021]本方案中,所述通过人工检测的方式对所述第二检测数据的有效性进行检测,得到第二有效数据,包括:
[0022]将所述第二检测数据发送至显示终端进行显示,并通过人工检测的方式对所述第二检测数据进行处理,得到人工检测数据;
[0023]将所述人工检测数据反馈至系统,系统根据所述人工检测数据对所述第二检测数据进行标注,得到第二有效数据。
[0024]本方案中,所述根据所述第一有效数据和所述第二有效数据进行计算,得到检测数据矩阵,包括:
[0025]根据预设数据类型在所述第一有效数据和所述第二有效数据中选取多组具有相同基因名和样本名的子数据;
[0026]分别对所述多组具有相同基因名和样本名的子数据进行计算,得到多个计算数据;
[0027]将所述多个计算数据按照相对应的基因名和样本名分别输入至基于所述预设数据类型生成的空白矩阵,得到检测数据矩阵;
[0028]将所述检测数据矩阵的数据格式转换为预设格式并进行输出。
[0029]本方案中,所述对所述检测数据矩阵进行数据可视化处理,并生成检测报告,包括:
[0030]获取用户选择数据格式;
[0031]根据所述用户选择数据格式对所述检测数据矩阵进行数据可视化处理,得到可视化图像数据;
[0032]对所有可视化图像数据进行整合得到质量检测报告。
[0033]本专利技术第二方面提供了一种qPCR检测数据可视化处理系统,包括存储器和处理器,所述存储器中包括qPCR检测数据可视化处理方法程序,所述qPCR检测数据可视化处理方法程序被所述处理器执行时实现如下步骤:
[0034]获取qPCR检测数据;
[0035]对所述qPCR检测数据进行预处理,得到第一检测数据;
[0036]根据预设质量标准,对所述第一检测数据的有效性进行检测,得到第一有效数据,并对没有相对应预设质量标准的检测数据进行标注,得到第二检测数据;
[0037]通过人工检测的方式对所述第二检测数据的有效性进行检测,得到第二有效数据;
[0038]根据所述第一有效数据和所述第二有效数据进行计算,得到检测数据矩阵;
[0039]对所述检测数据矩阵进行数据可视化处理,并生成检测报告。
[0040]本方案中,所述对所述qPCR检测数据进行预处理,得到第一检测数据,包括:
[0041]对所述qPCR检测数据进行数据清洗;
[0042]对清洗后的检测数据进行格式转换,得到第一检测数据。
[0043]本方案中,所述根据预设质量标准,对所述第一检测数据的有效性进行检测,得到第一有效数据,并对没有相对应预设质量标准的检测数据进行标注,得到第二检测数据,包括:
[0044]根据所述第一检测数据进行分析,判断所述第一检测数据的每一项子数据是否存在相对应的预设阈值区间;
[0045]若否,则将所述子数据标注为第二检测数据,并通过人工检测的方式对所述第二检测数据的数据有效性进行检测;
[0046]若是,则判断所述子数据是否处于相对应的预设阈值区间;
[0047]若不处于,则将所述数据标注为失控数据;
[0048]若处于,则标注为第一有效数据。
[0049]本方案中,所述通过人工检测的方式对所述第二检测数据的有效性进行检测,得到第二有效数据,包括:
[0050]将所述第二检测数据发送至显示终端进行显示,并通过人工检测的方式对所述第二检测数据进行处理,得到人工检测数据;
[0051]将所述人工检测数据反馈至系统,系统根据所述人工检测数据对所述第二检测数据进行标注,得到第二有效数据。
[0052]本方案中,所述根据所述第一有效数据和所述第二有效数据进行计算,得到检测数据矩阵,包括:
[0053]根据预设数据类型在所述第一有效数据和所述第二有效数据中选取多组具有相同基因名和样本名的本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种qPCR检测数据可视化处理方法,其特征在于,包括:获取qPCR检测数据;对所述qPCR检测数据进行预处理,得到第一检测数据;根据预设质量标准,对所述第一检测数据的有效性进行检测,得到第一有效数据,并对没有相对应预设质量标准的检测数据进行标注,得到第二检测数据;通过人工检测的方式对所述第二检测数据的有效性进行检测,得到第二有效数据;根据所述第一有效数据和所述第二有效数据进行计算,得到检测数据矩阵;对所述检测数据矩阵进行数据可视化处理,并生成检测报告。2.根据权利要求1所述的qPCR检测数据可视化处理方法,其特征在于,所述对所述qPCR检测数据进行预处理,得到第一检测数据,包括:对所述qPCR检测数据进行数据清洗;对清洗后的检测数据进行格式转换,得到第一检测数据。3.根据权利要求1所述的qPCR检测数据可视化处理方法,其特征在于,所述根据预设质量标准,对所述第一检测数据的有效性进行检测,得到第一有效数据,并对没有相对应预设质量标准的检测数据进行标注,得到第二检测数据,包括:根据所述第一检测数据进行分析,判断所述第一检测数据的每一项子数据是否存在相对应的预设阈值区间;若否,则将所述子数据标注为第二检测数据,并通过人工检测的方式对所述第二检测数据的数据有效性进行检测;若是,则判断所述子数据是否处于相对应的预设阈值区间;若不处于,则将所述数据标注为失控数据;若处于,则标注为第一有效数据。4.根据权利要求1所述的qPCR检测数据可视化处理方法,其特征在于,所述通过人工检测的方式对所述第二检测数据的有效性进行检测,得到第二有效数据,包括:将所述第二检测数据发送至显示终端进行显示,并通过人工检测的方式对所述第二检测数据进行处理,得到人工检测数据;将所述人工检测数据反馈至系统,系统根据所述人工检测数据对所述第二检测数据进行标注,得到第二有效数据。5.根据权利要求1所述的qPCR检测数据可视化处理方法,其特征在于,所述根据所述第一有效数据和所述第二有效数据进行计算,得到检测数据矩阵,包括:根据预设数据类型在所述第一有效数据和所述第二有效数据中选取多组具有相同基因名和样本名的子数据;分别对所述多组具有相同基因名和样本名的子数据进行计算,得到多个计算数据;将所述多个计算数据按照相对应的基因名和样本名分别输入至基于所述预设数据类型生成的空白矩阵,得到检测数据矩阵;将所述检测数据矩阵的数据格式转换为预设格式并进行输出。6.根据权利要求1所述的qPCR检测数据可视化处理方法,其特征在于,所述对所述检测数据矩阵进行数据...

【专利技术属性】
技术研发人员:陈利民
申请(专利权)人:成都云检韵祥医学科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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