一种评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂盒制造技术

本发明专利技术提供了一种评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂盒，含有用于检测rs133328478位点基因型的试剂，该位点位于NC_037343.1：41160246，即ARS

【技术实现步骤摘要】
一种评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂盒


[0001]本专利技术属于分子育种
更具体地，涉及一种评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂盒。

技术介绍

[0002]中国荷斯坦奶牛是本地黄牛与引进的荷斯坦奶牛经过不断选育后逐渐形成的适合本地环境养殖的品种，属于肉乳兼用型品种，也是我国饲养最多的奶牛品种。经过长期的选育，逐渐形成更加具有中国特色的荷斯坦奶牛，是我国产奶量最高、数量最多、分布最广的奶牛品种。在奶牛的健康管理中，通过遗传改良策略改善奶牛乳品质性能的应用越来越广泛，结合健康性状信息的育种策略有机会改善动物的健康状况和整个乳产业的现状。
[0003]脱氢酶/还原酶3(dehydrogenase/reductase 3，DHRS3)又被称为视网膜短链脱氢酶/还原酶(retinal short
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chain dehydrogenase/reductase，retSDR1)，短链醇脱氢酶/还原酶超家族(SDR16C家族)中高度保守的成员，是一类蛋白质编码基因。据报道DHRS3是一种脂滴蛋白，并且在脂质和类维生素A(视黄醇)的代谢中起作用。视黄醇是类视黄醇化合物家族中的一员，主要通过调节基因表达影响细胞生物学的几个方面。DHRS3能够根据底物和辅因子的可用性催化氧化或还原，是将全反式视黄醛(All
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trans retinal)还原为全反式视黄醇(All
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trans retinol,atRAL)即维生素A，并防止过量视黄酸的合成。最初DHRS3被鉴定为具有与全反式视黄醇脱氢酶相似的酶活性，随后被证明在视锥细胞视周期中促进视网膜还原为视黄醇。脱氢酶/还原酶家族被认为依赖于NADP(H)，并且具有多种底物。而DHRS3可催化多种底物的氧化/还原，包括类视黄醇和类固醇。基于此观点，相关研究证实，只有全反式视黄醛被确定为DHRS3底物。有研究表明，在小鼠成肌细胞分化过程中DHRS3的表达显著增加，表明了DHRS3对C2
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C12成肌细胞分化和小鼠骨骼肌再生起积极作用。有研究报道在视锥细胞的视觉周期中，DHRS3减少了视黄醛向视黄醇的转化；以及DHRS3作为视黄醇还原酶，DHRS3和视黄酸脱氢酶10，这两个相关的膜结合蛋白在功能上相互激活，介导视黄醇和视网膜之间的转化。DHRS3通过降低全反式视黄醇水平参与全反式视黄酸(all trans
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retinoic acid，atRA)的代谢，从而阻止atRA在胚胎发育过程中的过度形成。目前已经证实当有过多的维甲酸，DHRS3的表达上调，而当维甲酸合成被阻断时，DHRS3的表达下调，表明DHRS3基因转录对的维甲酸的形成具有一定调控作用。
[0004]此外，DHRS3在医学临床上也有相关报道，证实DHRS3是一类肿瘤抑制因子，与人类胃癌及骨关节炎的作用机制和肿瘤分化程度有关。研究发现DHRS3的表达降低与胃癌的发生有关，研究发现上调DHRS3可以促进hBMSCs成骨分化。据报道，成神经细胞瘤细胞中DHRS3的异位表达可增加视黄醇的浓度，支持DHRS3作为视网膜还原酶在生成视黄醇存储形式中的作用。最近的研究显示，磷酸化缺陷突变体RARαS77A的抗肿瘤作用至少部分是由miR
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5p的上调所介导的，它直接针对DHRS3，通过抑制RARαS77的磷酸化，可以绕过RA刺激以反式激活肿瘤抑制性miR
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5p并减少致癌DHRS3，从而达到治疗肿瘤的目的。虽然关于DHRS3对视黄醇代谢影响的研究很多，但DHRS3对于乳品质性状的影响仍缺少理论依据。
[0005]产奶性状是奶牛最重要的经济性状，包括产奶量、乳脂量、乳蛋白量、乳脂率和乳蛋白率，属于受大量基因和诸多环境因素共同影响的数量性状。其中乳脂是决定奶牛的产奶性能的重要性状之一，它的组成及含量是影响牛奶口感及营养价值的主要因素。牛乳脂代谢是一个复杂而又高度协调的基因表达程序，主要受遗传因素调控。基因的表达调控、候选基因的选择、基因间的相互作用，共同构成了奶牛乳脂性状的调控作用网络。在过去的几十年里，数量性状位点(Quantitative Trait Locus QTL)、候选基因分析和全基因组关联研究(Genome
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Wide Association Studies GWAS)被广泛用于鉴定奶牛的产奶性状基因，例如AGPAT6、GHR和POU1F1等基因已被证实与产奶性状显著相关。但是关于DHRS3基因在中国荷斯坦牛产奶性能方面尚无相关报道。

技术实现思路

[0006]本专利技术针对现有技术的不足，提供一种评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂盒。
[0007]本专利技术的第一目的是提供检测SNP位点的基因的试剂在评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状中的应用。
[0008]本专利技术的第二目的是提供检测SNP位点的基因的试剂在制备评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂盒中的应用。
[0009]本专利技术的第三目的是提供一种用于评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂。
[0010]本专利技术的第四目的是提供一种用于制备评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂盒的试剂。
[0011]本专利技术的第五目的是提供一种评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂盒。
[0012]本专利技术的第六目的是提供一种评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的方法。
[0013]本专利技术上述目的通过以下技术方案实现：
[0014]以DHRS3作为对象，通过扩增中国荷斯坦奶牛DHRS3基因，采用直接测序检测单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphisms，SNPs)，分析其在群体中的遗传多态性，并与乳品质相关性状进行关联分析，发现了一个跟乳汁中乳糖含量相关的SNP位点。DHRS3基因的3
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UTR中存在一个突变位点即rs133328478位点(其位于NC_037343.1：41160246，即ARS
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UCD1.2版牛基因组的第16染色体的第41160246位)，并存在AA、AG、GG 3种基因型，AG基因型个体的乳糖含量显著高于GG基因型个体(P<0.05)，而与乳脂、乳蛋白、产奶量、尿素氮以及干物质的含量均没有显著相关性(P>0.05)。
[0015]因此本专利技术要求保护检测SNP位点的基因的试剂在评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状中的应用，所述SNP位点位于为rs133328478位点，所述乳品质性状为乳糖含量，其基因型为AG的个体分泌的乳汁中乳糖含量显著比基因型为GG的个体分泌的乳汁中乳糖含量高。
[0016]本专利技术还要求保护检测SNP位点的基因的试剂在制备评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂盒中的应用，所述SNP位点位于为rs133328478位点，所述乳品质性状为乳糖含量，其基因型为AG的个体分泌的乳汁中乳糖含量显著比基因型为GG的个体分泌的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测SNP位点的基因的试剂在评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状中的应用，其特征在于，所述SNP位点为rs133328478位点，所述乳品质性状为乳糖含量，其基因型为AG的个体分泌的乳汁中乳糖含量比基因型为GG的个体分泌的乳汁中乳糖含量高。2.检测SNP位点的基因的试剂在制备评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂盒中的应用，其特征在于，所述SNP位点为rs133328478位点，所述乳品质性状为乳糖含量，其基因型为AG的个体分泌的乳汁中乳糖含量显著比基因型为GG的个体分泌的乳汁中乳糖含量高。3.根据权利要求1和2所述的应用，其特征在于，所述试剂为引物。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述引物为核苷酸序列如SEQ ID NO:1和2所示的引物。5.一种用于评估中国荷斯坦奶牛的乳品质性状的试剂，其特征在于，其用于检测rs133328478位点的基因型，所述乳品质性状为乳糖含量，其基因型为AG的...

【专利技术属性】
技术研发人员：姜平，赵志辉，刘文超，谭周兴，李龙，郭桐君，王欣雨，罗文君，
申请(专利权)人：广东海洋大学，
类型：发明
国别省市：