一种贴壁细胞计数方法技术

本发明专利技术提供了一种贴壁细胞计数方法，涉及医疗视觉技术领域，包括：采集待计数区域的细胞图片；根据所述细胞图片计算细胞像素汇合度；判断第一预设阈值是否大于所述细胞像素汇合度，若是，则将所述细胞图片划确定为高汇合度图片，若否，则将所述细胞图片确定为低汇合度图片；根据所述低汇合度图片中的细胞轮廓面积进行细胞计数，得到计算结果；或根据所述高汇合度图片的细胞面积进行细胞计数，得到计算结果。本发明专利技术能够提高细胞计数的准确性。本发明专利技术能够提高细胞计数的准确性。本发明专利技术能够提高细胞计数的准确性。

【技术实现步骤摘要】
一种贴壁细胞计数方法


[0001]本专利技术涉及医疗视觉
，特别是涉及一种贴壁细胞计数方法。

技术介绍

[0002]目前现有的粘连贴壁细胞的计数技术主要是分为三个方向。传统的采用手工对细胞进行计数速度又慢，效果又差，准确性也不好。目前也有一部分技术采用深度学习模型预测的mask直接对细胞进行计数，但是该计数不容易对粘连到一起的细胞进行计数，从而导致计数的结果不准确，数量偏低等情况。还有一部分是采用模型后处理的方式对粘连细胞先去除粘连后进行计数的方式，比如单纯采用分水岭算法来进行性去除粘连粘连并计数，但是该种计数存在两个问题，一个是针对细胞粘连不严重的细胞图片没办法做到每张图片的效果都一致从而导致计数不准确，另外一个问题就是针对细胞在图片上占比较大的去除粘连效果特别差，导致计数不准。

技术实现思路

[0003]为了克服现有技术的不足，本专利技术的目的是提供一种贴壁细胞计数方法。
[0004]为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：一种贴壁细胞计数方法，包括：采集待计数区域的细胞图片；根据所述细胞图片计算细胞像素汇合度；判断第一预设阈值是否大于所述细胞像素汇合度，若是，则将所述细胞图片划确定为高汇合度图片，若否，则将所述细胞图片确定为低汇合度图片；根据所述低汇合度图片中的细胞轮廓面积进行细胞计数，得到计算结果；或根据所述高汇合度图片的细胞面积进行细胞计数，得到计算结果。
[0005]优选地，根据所述低汇合度图片中的细胞轮廓面积进行细胞计数，得到计算结果，包括：采集所述低汇合度图片中的所有的细胞轮廓，并计算所述细胞轮廓面积；根据第二预设阈值与所述细胞轮廓面积将所述低汇合度图片划分为小面积细胞区域和大面积细胞区域；根据所述大面积细胞区域的面积和单个细胞的面积对细胞进行计数，得到第一数量；计算所述小面积细胞区域的细胞图上非零像素点到最近的零像素点之间的距离，并生成距离图；将距离图进行自适应的阈值分割，得到二值图，并根据所述二值图对细胞进行计数，得到第二数量；将所述第一数量和所述第二数量进行相加，得到所述计算结果。
[0006]优选地，根据所述大面积细胞区域的面积和单个细胞的面积对细胞进行计数，得
到第一数量，包括：将所有的大面积细胞区域的面积进行相加，得到大面积细胞区域的面积之和；将大面积细胞区域的面积之和除以单个细胞的面积，得到所述第一数量。
[0007]优选地，所述单个细胞的面积是基于大量细胞面积统计得到的数据。
[0008]优选地，将距离图进行自适应的阈值分割，得到二值图，并根据所述二值图对细胞进行计数，得到第二数量，包括：根据每张所述距离图上的最大距离的0.1倍到1这十个数值来选取最合适分割阈值，遍历这十个数值，根据这十个数值对应得到的二值图中轮廓数来选取具体的阈值，选取轮廓数最大所对应的阈值；使用轮廓数最大所对应的阈值对所述距离图进行二值化处理，得到一张二值图，此二值图是前景区域也就是确定的细胞区域，然后将原始图与二值化之后的图进行相减得到可能存在细胞粘连的部分，并将所述可能存在细胞粘连的部分定义为未知区域；将所述未知区域打标签，以得到标签图；不同的细胞被打上了不同的标签；打标签的过程中无细胞区域的标签被标记为0，将标签图统一加上1，这样无细胞的区域就被标记为1；根据所述未知区域将标签图中同样位置的标签置为0；根据标签图找到原图上的极小值点，并在原图上的极小值点周围4邻域或者8邻域范围内寻找领域中像素的最小值，当邻域中找到一个最小值接着在当前领域的下一个领域找最小值，依次迭代下去，在每个被打标签的极小值区域周围均得到一个包含最小值的队列，并且对每个队列进行区分，将每个队列的交集的位置的像素值置为
‑
1，将数组中为
‑
1的地方对应到原图上，并将原图为
‑
1的位置置为0，最后将原图进行腐蚀，以将粘连细胞分开；对分开的细胞进行计数，得到所述第二数量。
[0009]优选地，根据所述高汇合度图片的细胞面积进行细胞计数，得到计算结果，包括：将所有细胞区域面积相加得到细胞面积总和，然后将细胞面积总和除于单个细胞面积，得到大面积细胞团中的细胞数量，并作为所述计算结果。
[0010]根据本专利技术提供的具体实施例，本专利技术公开了以下技术效果：本专利技术提供了一种贴壁细胞计数方法，包括：采集待计数区域的细胞图片；根据所述细胞图片计算细胞像素汇合度；判断第一预设阈值是否大于所述细胞像素汇合度，若是，则将所述细胞图片划确定为高汇合度图片，若否，则将所述细胞图片确定为低汇合度图片；根据所述低汇合度图片中的细胞轮廓面积进行细胞计数，得到计算结果；或根据所述高汇合度图片的细胞面积进行细胞计数，得到计算结果。本专利技术能够提高细胞计数的准确性。
附图说明
[0011]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动性的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0012]图1为本专利技术实施例提供的方法流程图；图2为本专利技术实施例提供的步骤示意图；
图3为本专利技术实施例提供的低汇合度图片示意图；图4为本专利技术实施例提供的高汇合度细胞图片示意图；图5为本专利技术实施例提供的细胞数量随汇合度变化示意图；图6为本专利技术实施例提供的细胞粘连优化示意图。
具体实施方式
[0013]下面将结合本专利技术实施例中的附图，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。
[0014]在本文中提及“实施例”意味着，结合实施例描述的特定特征、结构或特性可以包含在本申请的至少一个实施例中。在说明书中的各个位置出现该短语并不一定均是指相同的实施例，也不是与其它实施例互斥的独立的或备选的实施例。本领域技术人员显式地和隐式地理解的是，本文所描述的实施例可以与其它实施例相结合。
[0015]本申请的说明书和权利要求书及所述附图中的术语“第一”、“第二”、“第三”和“第四”等是用于区别不同对象，而不是用于描述特定顺序。此外，术语“包括”和“具有”以及它们任何变形，意图在于覆盖不排他的包含。例如包含了一系列步骤、过程、方法等没有限定于已列出的步骤，而是可选地还包括没有列出的步骤，或可选地还包括对于这些过程、方法、产品或设备固有的其它步骤元。
[0016]本专利技术的目的是提供一种贴壁细胞计数方法，能够提高细胞计数的准确性。
[0017]为使本专利技术的上述目的、特征和优点能够更加明显易懂，下面结合附图和具体实施方式对本专利技术作进一步详细的说明。
[0018]图1为本专利技术实施例提供的方法流程图，如图1所示，本专利技术提供了一种贴壁细胞计数方法，包括：步骤100：采集待计数区域的细胞图片；步骤200：根据所述细胞图片计算细胞本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种贴壁细胞计数方法，其特征在于，包括：采集待计数区域的细胞图片；根据所述细胞图片计算细胞像素汇合度；判断第一预设阈值是否大于所述细胞像素汇合度，若是，则将所述细胞图片划确定为高汇合度图片，若否，则将所述细胞图片确定为低汇合度图片；根据所述低汇合度图片中的细胞轮廓面积进行细胞计数，得到计算结果；或根据所述高汇合度图片的细胞面积进行细胞计数，得到计算结果。2.根据权利要求1所述的贴壁细胞计数方法，其特征在于，根据所述低汇合度图片中的细胞轮廓面积进行细胞计数，得到计算结果，包括：采集所述低汇合度图片中的所有的细胞轮廓，并计算所述细胞轮廓面积；根据第二预设阈值与所述细胞轮廓面积将所述低汇合度图片划分为小面积细胞区域和大面积细胞区域；根据所述大面积细胞区域的面积和单个细胞的面积对细胞进行计数，得到第一数量；计算所述小面积细胞区域的细胞图上非零像素点到最近的零像素点之间的距离，并生成距离图；将距离图进行自适应的阈值分割，得到二值图，并根据所述二值图对细胞进行计数，得到第二数量；将所述第一数量和所述第二数量进行相加，得到所述计算结果。3.根据权利要求2所述的贴壁细胞计数方法，其特征在于，根据所述大面积细胞区域的面积和单个细胞的面积对细胞进行计数，得到第一数量，包括：将所有的大面积细胞区域的面积进行相加，得到大面积细胞区域的面积之和；将大面积细胞区域的面积之和除以单个细胞的面积，得到所述第一数量。4.根据权利要求3所述的贴壁细胞计数方法，其特征在于，所述单个细胞的面积是基于大量细胞面积统计得到的数据。5.根据权利要求2所述的贴壁细胞计数方法，其特征在于，将距离图进行自适应的阈值分割，得到二值图，并根据所述二值图...

【专利技术属性】
技术研发人员：史相杰，刘家宏，刘河山，杨程，
申请(专利权)人：南京九川科学技术有限公司，
类型：发明
国别省市：