高通量筛选模型的构建方法、高通量筛选方法及相关装置制造方法及图纸

本申请实施例公开了一种高通量筛选模型的构建方法、高通量筛选方法及相关装置，先获取在多肽工程菌质粒的突变位点处设计好特定引物的质粒作为目标质粒，并获取拼接了锚定蛋白基因和质粒框架的目标质粒作为第一质粒组装片段。接着获取经过预处理的第一质粒组装片段作为第一待测质粒，并计算第一待测质粒的活性，从而筛选出活性符合活性标准的第一待测质粒作为待学习质粒。获取待学习质粒的序列数据和活性数据，将序列数据和活性数据输入到神经网络中进行学习得到高通量筛选模型。本申请采用多肽序列数据计算、活性数据计算及机器学习结合的方法得到的高通量筛选模型可以大幅度降低筛选突变体文库所需的工作量，同时提高目标高活性多肽筛选成功率。标高活性多肽筛选成功率。标高活性多肽筛选成功率。

【技术实现步骤摘要】
高通量筛选模型的构建方法、高通量筛选方法及相关装置


[0001]本申请涉及高通量筛选的
，具体涉及一种高通量筛选模型的构建方法、高通量筛选方法及相关装置。

技术介绍

[0002]蛋白质改造是提高天然蛋白质的稳定性、耐受性及选择性的有效手段之一。蛋白质定向进化是通过各种实验技术对目的基因进行多轮突变、表达和筛选，在体外模拟自然进化机制，加速新突变的积累和选择，从而获取具有特定性质和功能蛋白质的工程。
[0003]多肽和小分子蛋白质的序列通常在100个氨基酸以内，空间结构复杂性较低，有利于通过计算模拟获取所需信息。即使如此，实验上对这些序列进行依次突变与活性筛选的工作量依然巨大。目前多肽活性优化的化学法通量低、成本高；常规生物法不仅纯化步骤繁琐而且依赖对蛋白质序列
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结构
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功能这些复杂关系认识的深入。
[0004]因此，如何提供一种可以快速计算多肽活性，同时可以高通量地筛选出活性较好的多肽的模型，是本领域技术人员急需解决的技术问题。

技术实现思路

[0005]基于上述问题，本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种高通量筛选模型的构建方法，其特征在于，所述方法包括：获取目标质粒，所述目标质粒为在多肽工程菌质粒的突变位点处设计好特定引物的质粒；获取第一质粒组装片段，所述第一质粒组装片段为拼接了锚定蛋白基因和质粒框架的目标质粒；获取经过预处理的所述第一质粒组装片段作为第一待测质粒，并计算所述第一待测质粒的活性，从而筛选出活性符合活性标准的第一待测质粒作为待学习质粒；获取所述待学习质粒的序列数据和活性数据，将所述序列数据和所述活性数据输入到神经网络中进行学习得到高通量筛选模型。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述获取经过预处理的所述第一质粒组装片段作为第一待测质粒，包括：获取转化到感受态的所述第一质粒组装片段作为第二待测质粒；获取所述第二待测质粒的测序结果作为第一质粒测序结果；根据所述第一质粒测序结果筛选出第三待测质粒；获取经过诱导表达的所述第三待测质粒作为第四待测质粒；将吸光度符合第一预设标准的所述第四待测质粒作为所述第一待测质粒。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述获取所述第二待测质粒的测序结果作为第一质粒测序结果，包括：获取所述第二待测质粒中经过细菌培养的单克隆菌落作为第一待培养质粒；对所述第一待培养质粒进行PCR验证，并筛选出阳性菌进行质粒测序得到各个所述阳性菌的氨基酸类型，将所述阳性菌的氨基酸类型作为所述第一质粒测序结果。4.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，在进行所述诱导表达时使用的培养基为200微升含抗生素和诱导剂的LB培养基。5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，在进行所述细菌培养时使用的培养基为100微升含抗生素的LB培养基。6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，在所述获取目标质粒之前，还包括：获取第二质粒组装片段，所述第二质粒组装片段为拼接了所述锚定蛋白...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈洁洁，韦婷婷，虞盛松，俞汉青，
申请(专利权)人：中国科学技术大学，
类型：发明
国别省市：