一种用于肺腺癌非创早期诊断、药效评估的分子标志物及试剂盒制造技术

技术编号:38594637 阅读:14 留言:0更新日期:2023-08-26 23:31
本发明专利技术公开了一种用于肺腺癌非创早期诊断、药效评估的分子标志物及试剂盒。本发明专利技术具体地公开了PRSS3基因的CpG岛作为分子标志物和/或检测所述分子标志物甲基化水平的物质在制备非小细胞肺癌的治疗、诊断或预后评估的产品中的应用。本发明专利技术的分子标志物及其甲基化状态或水平的检测引物具有敏感性强、特异性高的特点;基于检测PRSS3基因内DNA序列甲基化的试剂盒可以特异地检测PRSS3基因相关的DNA甲基化水平,还能够对PRSS3基因相关的DNA甲基化水平进行特异、定量检测;检测结果可以为非小细胞肺癌患者病情及个体化用药监测、肿瘤早期诊断,对药物治疗的预后检测提供评价方法。对药物治疗的预后检测提供评价方法。

【技术实现步骤摘要】
一种用于肺腺癌非创早期诊断、药效评估的分子标志物及试剂盒


[0001]本专利技术属于分子诊断
,涉及一种用于肺腺癌非创早期诊断、药效评估的分子标志物及试剂盒,具体涉及一种用于肺腺癌非创早期诊断、药效评估尤其是表观药物疗效评估的潜在标志物及试剂盒,及该分子标志物在制备非小细胞肺癌诊断、治疗与预后检测的制剂中的应用。

技术介绍

[0002]非小细胞肺癌(Non

small cell lung cancer,NSCLC)是我国最常见的高发性肿瘤之一,其致死率在世界及我国居各类恶性肿瘤的前列(Bray F,Jemal A,Grey N,Ferlay J,Forman D.Global cancer transitions according to the Human Development Index(2008

2030):a population

based study[J].Lancet Oncol 2012;13:790

801.)。NSCLC是一种由遗传和表观遗传改变引起、具有高度异质性肿瘤肺腺癌(Chen Z,Fillmore CM,Hammerman PS,Kim CF,Wong KK.Non

small

cell lung cancers:a heterogeneous set of diseases.Nature reviews Cancer.2014;14:535

>546.)。NSCLC的异质性被认为是生物标志物驱动的治疗干预和早期诊断的重大障碍,导致所有NSCLC患者的5年生存率都远远不能令人满意。因此,鉴别肺癌早期分子靶标,对肿瘤的精准诊断与个体化治疗,具有重要的临床意义和科学价值。
[0003]进一步了解肺癌的肿瘤基因组时,发现肿瘤异质性可在致癌驱动和抑癌基因(TSGs)中共同发生基因组改变,而不是定义NSCLC肿瘤发生和分子分类的单基因组驱动模型。通过表观基因组和转录组改变的非遗传异质性已经证明了开发新的生物标志物和有效的靶向治疗策略的潜力。尤其是表观遗传通过DNA甲基化及组蛋白等的修饰改变调控细胞组织特异性基因表达,与基因突变不同,表观遗传学改变导致的渐进可逆性表型变化,这一特性为一些疾病尤其是肿瘤的预防治疗开辟了新的途径,对于研究开发去甲基化药物治疗肿瘤具有重要意义。如抑癌基因启动子区CpG岛异常高甲基化及组蛋白修饰异常所致基因表达与功能的异常改变,不仅作为表观遗传标志物与靶点应用于肿瘤的分子诊断、治疗及预后评估等,而且被认为是引发疾病以及治疗耐药形成的主要因素之一(Oh JH,Jung SH,Hong SJ,and Rhyu MG:DNA Methylation as Surrogate Marker For Gastric Cancer.J Cancer Prev 20:172

178,2015.)。
[0004]DNA甲基化(DNA methylation)是表型修饰的一种,与癌症的发生密切相关。尤其是CpG岛区的启动子超甲基化可能会导致抑癌基因转录沉默,从而影响肿瘤发生的进程。由于DNA甲基化几乎在所有癌症中均有发现,并且多发生在癌前或者癌症早期阶段,因而有望成为癌症早期诊断的理想标志物。通过对特定基因甲基化情况进行检测,可有效提高肺癌的诊断效能,相关的甲基化检测也渐渐从科研走向临床应用。
[0005]目前,以肺癌靶向治疗为代表的精准医学迅速发展,但仍面临诸多问题和挑战,精准医疗需要更明确的标志物应用于肺癌的早期诊断,因此,筛选特异性强、敏感性高的肺癌
标志物用于指导早期诊断和评估疗效对肺癌的精准治疗具有重要的临床意义。

技术实现思路

[0006]本专利技术的目的是提供一种敏感性强、特异性高、用于非小细胞肺癌诊断检测的分子标志物,和/或,用于检测该分子标志物甲基化水平的引物对。所要解决的技术问题不限于所描述的技术主题,本领域技术人员通过以下描述可以清楚地理解本文未提及的其它技术主题。
[0007]为实现上述目的,本专利技术首先提供了分子标志物和/或检测所述分子标志物甲基化水平的物质在制备用于鉴别肺鳞癌与肺腺癌、非小细胞肺癌的诊断和/或预后评估的产品中的应用,所述分子标志物是核苷酸序列是SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和/或SEQ ID No.4的DNA分子。
[0008]进一步地,所述分子标志物为本专利技术鉴定的4个PRSS3基因的CpG岛(CpGI_1

4),其中:
[0009]CpGI_1作为分子标志物M1,其序列为位于PRSS3剪接变异体1基因转录起始位点+21bp~+452bp的DNA序列,核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;
[0010]CpGI_2作为分子标志物M2,其序列为位于PRSS3剪接变异体1基因转录起始位点+428bp~+840bp的DNA序列,核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;
[0011]CpGI_3作为分子标志物M3,其序列为位于PRSS3剪接变异体2基因转录起始位点

355bp~+126bp的DNA序列,核苷酸序列如SEQ ID No.3所示;
[0012]CpGI_4作为分子标志物M4,其序列为位于PRSS3剪接变异体1基因转录起始位点386bp(+386bp)至其下游序列540bp(+540bp)的DNA序列,核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。
[0013]进一步地,所述检测所述分子标志物甲基化水平的物质可为检测PRSS3基因CpG岛(CpGI_1

4)甲基化水平的物质。
[0014]上述应用中,所述物质可为用于检测所述分子标志物甲基化水平的引物对。
[0015]上述应用中,所述引物对可为下述至少任一种:
[0016]A1)由引物F1和引物R1组成的引物对;所述引物F1为SEQ ID No.5所示的单链DNA分子;所述引物R1为SEQ ID No.6所示的单链DNA分子;
[0017]A2)由引物F2和引物R2组成的引物对;所述引物F2为SEQ ID No.7所示的单链DNA分子;所述引物R2为SEQ ID No.8所示的单链DNA分子;
[0018]A3)由引物F3和引物R3组成的引物对;所述引物F3为SEQ ID No.9所示的单链DNA分子;所述引物R3为SEQ ID No.10所示的单链DNA分子;
[0019]A4)由引物F4和引物R4组成的引物对;所述引物F4为SEQ ID No.11所示的单链DNA分子;所述引物R4为SEQ ID No.12所示的单链DNA分子;
[0020]A5)由引物F5和引物R5组成的引物对;所述引物F5为SEQ ID No.13所示的单链DNA分子;所述引物R5为SEQ ID No.14所示的单链DNA分子。
[0021]本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.分子标志物和/或检测所述分子标志物甲基化水平的物质在制备用于鉴别肺鳞癌与肺腺癌、非小细胞肺癌的诊断和/或预后评估的产品中的应用,其特征在于,所述分子标志物是核苷酸序列是SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQ ID No.3和/或SEQ ID No.4的DNA分子。2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述物质为用于检测权利要求1中所述分子标志物甲基化水平的引物对。3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述引物对为下述至少任一种:A1)由引物F1和引物R1组成的引物对;所述引物F1为SEQ ID No.5所示的单链DNA分子;所述引物R1为SEQ ID No.6所示的单链DNA分子;A2)由引物F2和引物R2组成的引物对;所述引物F2为SEQ ID No.7所示的单链DNA分子;所述引物R2为SEQ ID No.8所示的单链DNA分子;A3)由引物F3和引物R3组成的引物对;所述引物F3为SEQ ID No.9所示的单链DNA分子;所述引物R3为SEQ ID No.10所示的单链DNA分子;A4)由引物F4和引物R4组成的引物对;所述引物F4为SEQ ID No.11所示的单链DNA分子;所述引物R4为SEQ ID No.12所示的单链DNA分子;A5)由引物F5和引物R5组成的引物对;所述引物F5为SEQ ID No.13所示的单链DNA分子;所述引物R5为SEQ ID No.14所示的单链DNA分子。4.权利要求...

【专利技术属性】
技术研发人员:林舒晔黄家强秦林王海潮
申请(专利权)人:北京市结核病胸部肿瘤研究所
类型:发明
国别省市:

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