扩大复合微生物群落的方法技术

本发明专利技术涉及一种扩大复合微生物群落的方法、通过所述方法获得的扩大的复合微生物群落、包含所述扩大的复合微生物群落的药物配制品以及所述扩大的复合微生物群落和所述药物配制品的用途。配制品的用途。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】扩大复合微生物群落的方法


[0001]本专利技术涉及一种扩大复合微生物群落的方法、通过所述方法获得的扩大的复合微生物群落、包含所述扩大的复合微生物群落的药物配制品以及所述扩大的复合微生物群落和所述药物配制品的用途。

技术介绍

[0002]复合微生物群落在健康和疾病中起着关键作用。特别地，已经发现复合微生物群落的使用，例如施用或移植可以治疗感染和疾病。
[0003]在使用复合微生物群落的情况下，重要的是所用样品在细菌的活力和多样性方面具有适当的谱。
[0004]目前应用的方法通常是经验性的，没有采取特别的预防措施来确保所用样品中存在的细菌多样性，或最好地保持细菌的活力。
[0005]此外，根据用途，复合微生物群落的多种用途是必要的。然而，随着时间的推移，初始样品收集不能为可重复剂量的整个治疗过程提供足够的材料。
[0006]吸引多个供体以获得所需数量的复合微生物群落本身并不足以弥补现有技术的缺陷。首先，供体的选择可能是挑剔和困难的，因为供体必须排除几种众所周知的病原微生物物种。供体选择受到严格控制，超过90%的潜在供体未通过筛选评估。其次，施用来自不同质的不同供体的不同剂量可能不利于治疗功效。例如，在治疗的情况下，为了确保受试者对接受的复合微生物群落的每个剂量（或样品）以相同的方式作出应答，可能需要使剂量尽可能均匀。
[0007]因此，在现有方法中，待使用的样品之间存在相当大的异质性，这是非常不希望的。
[0008]因此，需要提供一种提供更大量的初始复合微生物群落的方法，该方法是安全的（不需要测试许多供体）、可重复的（通过遵循相同的方案获得的不同剂量/样品之间存在同质性）、有效的、易于实施的（特别是在工业规模下），同时根据预期目的保留或优化细菌的多样性，并在整个方法和储存期间保留细菌的活力。
[0009]本专利技术响应于上述需求。
[0010]因此，本专利技术的目的是提供一种扩大的复合微生物群落，其具有最佳多样性和足够的细菌活力，以供其在例如施用或移植方法中使用，并且即使在工业下也可以安全、容易、可靠和可重复地生产。

技术实现思路

[0011]本专利技术涉及一种扩大复合微生物群落的方法，该方法包括以下步骤：(a) 在至少两个生物反应器，优选至少三个生物反应器中培养所述复合微生物群落，其中这些生物反应器具有至少一个不同参数，所述参数选自pH、温度、压力、培养时间、停留时间、通气条件、氧化还原电势及其组合，以获得至少两个收获的接种物，
(b) 混合在步骤 (a) 中获得的至少两个收获的接种物以获得扩大的复合微生物群落。
[0012]本专利技术还涉及通过本专利技术的方法获得的扩大的复合微生物群落，其特征在于所述扩大的复合微生物群落包含至少三个选自以下的细菌门：拟杆菌门（Bacteroidetes）、互养菌门（Synergistetes）、厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、疣微菌门（Verrucomicrobia）、软壁菌门（Tenericutes）、梭杆菌门（Fusobacteria）及其组合。
[0013]本专利技术还涉及通过根据本专利技术的方法获得的扩大的复合微生物群落，其特征在于所述扩大的复合微生物群落包含选自下列组的至少15个属，该组包含：梭菌属（Clostridium）、优杆菌属（Eubacterium）、厌氧棒状菌属（Anaerostipes）、拟杆菌属（Bacteroides）、双歧杆菌属（Bifidobacterium）、布劳特氏菌属（Blautia）、丁酸球菌属（Butyricicoccus）、柯林斯氏菌属（Collinsella）、小杆菌属（Dialister）、多尔氏菌属（Dorea）、艾森伯格氏菌属（Eisenbergiella）、埃希氏杆菌属
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志贺氏菌属（Escherichia
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Shigella）、粪杆菌属（Faecalibacterium）、纺锤链杆属（Fusicatenibacter）、Hungatella、腔隙杆菌属（Lachnoclostridium）、副萨特氏菌属（Parasutterella）、罗斯氏菌属（Roseburia）、优杆菌属（Eubacterium）、[优杆菌属]产粪甾醇群（[Eubacterium] coprostanoligenesgroup）、[优杆菌属]断链群（[Eubacterium] fissicatenagroup）、[瘤胃球菌属]扭矩群（[Ruminococcus] torquesgroup）、阿里松氏菌属（Allisonella）、嗜胆菌属（Bilophila）、克里斯滕森菌属（Christensenella）、克里斯滕森菌科R
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7群（ChristensenellaceaeR
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7 group）、梭菌属（Clostridium）、狭义的梭菌属1（Clostridium sensu stricto1）、粪球菌属（Coporococcus）、脱硫弧菌属（Desulfovibrio）、肠球菌属（Enterococcus）、黄杆菌属（Flavonifractor）、毛螺菌科NK4A136群（LachnospiraceaeNK4A136 group）、毛螺菌科UCG
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001（Lachnospiraceae UCG
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001）、乳杆菌属（Lactobacillus）、副拟杆菌属（Para bacteroides）、消化链球菌属（Peptostreptococcus）、罗姆布茨菌属（Romboutsia）、瘤胃梭菌属（Ruminoclostridium）、瘤胃球菌科UCG
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003（Ruminococcaceae UCG
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003）、瘤胃球菌科UCG
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013（Ruminococcaceae UCG
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013）、瘤胃球菌科UCG
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014（Ruminococcaceae UCG
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014）、瘤胃球菌属（Ruminococcus）、罕见小球菌属（Subdoligranulum）和萨特氏菌属（Sutterella）及其组合。
[0014]本专利技术还涉及包含通过本专利技术的方法获得的扩大的复合微生物群落的药物配制品。
[0015]本专利技术还涉及将通过本专利技术的方法获得的扩大的复合微生物群落、如前定义的扩大的复合微生物群落或如前定义的药物配制品，作为药物，任选地与基于药物的疗法、免疫疗法、免疫检查点抑制剂、靶向肿瘤新抗原的疗法、化学疗法和/或放射疗法组合使用的用途。
[0016]本专利技术还涉及将通过本专利技术的方法获得的扩大的复合微生物群落，如前定义的扩大的复合微生物群落或如前定义的药物配制品，任选地与基于药物的疗法、免疫疗法、免疫检查点抑制剂、靶向肿瘤新抗原的疗法、化学疗法和/或放射疗法组合使用的用途，其用于预防和/或治疗败血症本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种扩大复合微生物群落的方法，所述方法包括以下步骤：(a) 在至少两个生物反应器、优选至少三个生物反应器中培养所述复合微生物群落，其中这些生物反应器具有至少一个不同参数，所述参数选自pH、温度、压力、培养时间、停留时间、通气条件、氧化还原电势及其组合，以获得至少两个收获的接种物，(b) 混合在步骤 (a) 中获得的至少两个收获的接种物以获得扩大的复合微生物群落。2.如权利要求1所述的方法，其特征在于这些生物反应器具有包括在6小时和102小时之间、优选在12小时和96小时之间、优选在24小时和72小时之间的不同的停留时间。3.如权利要求1或2所述的方法，其特征在于至少一个生物反应器具有包括在6小时和18小时之间、优选在9小时和15小时之间并且更优选在11小时和13小时之间的停留时间。4.如权利要求1至3中任一项所述的方法，其特征在于至少一个生物反应器具有包括在18小时和30小时之间、优选在21小时和27小时之间并且更优选在23小时和25小时之间的停留时间。5.如权利要求1至4中任一项所述的方法，其特征在于：
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第一生物反应器具有包括在18小时和30小时之间、优选在21小时和27小时之间并且更优选在23小时和25小时之间的停留时间，
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第二生物反应器具有包括在6小时和18小时之间、优选在9小时和15小时之间并且更优选在11小时和13小时之间的停留时间，或者包括在42小时和54小时之间、优选在45小时和51小时之间并且更优选在47小时和49小时之间的停留时间。6.如权利要求1至5中任一项所述的方法，其特征在于：
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第一生物反应器具有包括在6小时和18小时之间、优选在9小时和15小时之间并且更优选在11小时和13小时之间的停留时间，
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第二生物反应器具有包括在18小时和30小时之间、优选在21小时和27小时之间并且更优选在23小时和25小时之间的停留时间，以及
‑ꢀ
第三生物反应器具有包括在42小时和54小时之间、优选在45小时和51小时之间并且更优选在47小时和49小时之间的停留时间。7.如权利要求1至6中任一项所述的方法，其特征在于这些生物反应器具有包括在4.5和8.0之间、优选在5和7.6之间并且更优选在5.2和7.4之间的不同的pH设定点。8.如权利要求1至7中任一项所述的方法，其特征在于至少一个生物反应器具有包括在4.5和5.8之间、优选在5和5.6之间并且更优选在5.2和5.4之间的pH设定点。9.如权利要求1至8中任一项所述的方法，其特征在于：
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第一生物反应器具有包括在4.5和5.8之间、优选在5和5.6之间并且更优选在5.2和5.4之间的pH设定点，
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第二生物反应器具有包括在5.9和6.8之间、优选在6和6.6之间并且更优选在6.2和6.4之间的pH设定点，或者包括在6.9和8之间、优选在7和7.6之间并且更优选在7.2和7.4之间的pH设定点。10.如权利要求1至9中任一项所述的方法，其特征在于：
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第一生物反应器具有包括在4.5和5.8之间、优选在5和5.6之间并且更优选在5.2和5.4之间的pH设定点，
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第二生物反应器具有包括在5.9和6.8之间、优选在6和6.6之间并且更优选在6.2和6.4之间的pH设定点，以及
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第三生物反应器具有包括在6.9和8之间、优选在7和7.6之间并且更优选在7.2和7.4之间的pH设定点。11.如权利要求1至10中任一项所述的方法，其特征在于步骤 (a) 中使用的复合微生物群落呈悬浮液形式，所述悬浮液包含盐水溶液、至少一种冷冻保护剂和/或至少一种填充剂。12.如权利要求1至11中任一项所述的方法，其特征在于步骤 (a) 或步骤 (a) 和(b) 用与先前在步骤 (a) 中使用的相同的pH或不同的pH重复至少一次。13.如权利要求1至12中任一项所述的方法，其特征在于步骤 (a) 中使用的复合微生物群落的至少一部分或全部、步骤 (a) 中获得的收获的接种物的至少一部分或全部和/或步骤 (b) 中获得的扩大的复合微生物群落的至少一部分或全部被冷冻、解冻和/或冻干。14.如权利要求1至13中任一项所述的方法，其特征在于所述复合微生物群落是来自至少一个供体、优选来自至少两个供体的粪便微生物群。15.一种通过如权利要求1至14中任一项所述的方法获得的扩大的复合微生物群落，其特征在于所述扩大的复合微生物群落包含至少三个选自以下的细菌门：拟杆菌门（Bacteroidetes）、互养菌门（Synergistetes）、厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、疣微菌门（Verrucomicrobia）、软壁菌门（Tenericutes）、梭杆菌门（Fusobacteria）及其组合。16.一种通过如权利要求1至14中任一项所述的方法获得的扩大的复合微生物群落，其特征在于所述扩大的复合微生物群落包含选自下列组的至少15个属，所述组包含：梭菌属（Clostridium）、优杆菌属（Eubacterium）、厌氧棒状菌属（Anaerostipes）、拟杆菌属（Bacteroides）、双歧杆菌属（Bifidobacterium）、布劳特氏菌属（Blautia）、丁酸球菌属（Buty...

【专利技术属性】
技术研发人员：郝维，
申请(专利权)人：克莱蒙奥弗涅大学国家农业食品和环境研究所，
类型：发明
国别省市：