基于抗生素与金属β-内酰胺酶作用机理研发抑制剂的模拟方法技术

本发明专利技术属于生物技术领域，具体涉及基于抗生素与金属β

【技术实现步骤摘要】
基于抗生素与金属
β
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内酰胺酶作用机理研发抑制剂的模拟方法


[0001]本专利技术属于生物
，具体涉及基于抗生素与金属β
‑
内酰胺酶作用机理研发抑制剂的模拟方法。

技术介绍

[0002]2017年，WHO公布的对人类健康威胁最大的超级细菌中，耐碳青霉烯鲍氏不动杆菌、绿脓杆菌和肠杆菌被列为“极大危害”级别。碳青霉烯类抗生素被誉为“人类健康的最后防线”，而被耐此类药物的细菌感染后，临床上治疗基本束手无策。该类细菌耐碳青霉烯类抗生素的机制是其体内存在编码金属β
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内酰胺酶的基因，该酶可催化抗生素水解失效。目前，对人类威胁最大的一类金属β
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内酰胺酶是新德里金属β
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内酰胺酶(NDM
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1)，其因为在于金属β
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内酰胺酶(NDM
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1)可高效水解β
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内酰胺类抗生素，且编码NDM的基因位于质粒上，可在细菌间快速传播，并有极高的概率发生突变。
[0003]目前，有关抑制剂本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.基于抗生素与金属β
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内酰胺酶作用机理研发抑制剂的模拟方法，其特征在于，包括以下步骤：1)获取金属β
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内酰胺酶与抗生素的复合物晶体三维结构模型及抑制剂结构式；2)预测搭建金属β
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内酰胺酶与抑制剂复合物模型，得到金属β
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内酰胺酶与抑制剂的复合物结构。3)基于复合物结构，通过分子动力学模拟方法分析抗生素、潜在抑制剂与蛋白质的作用规律。2.根据权利要求1所述的模拟方法，其特征在于，所述金属β
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内酰胺酶与抑制剂复合物模型预测搭建方法包括：基于X
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射线衍射得到的金属β
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内酰胺酶与青霉素V复合物的电子云密度结构，利用CCP4软件包内Coot软件，将抑制剂结构搭建于金属β
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内酰胺酶晶体结构活性中心处的空缺电子云密度处，并使用Desmond软件包对复合物结构模型进行能量最小化。3.根据权利要求1所述的模拟方法，其特征在于，还包括：将晶体三维结构模型中的金属β
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内酰胺酶与抗生素及抑制剂的复合物模型进行分子动力学模拟。4.根据权利要求3所述的模拟方法，其特征在于，所述分子动力学模拟包括：利用Desmond软件包内的Molecular Dynamics模块，在NVT与NPT系统下...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘威，史祥睿，张庆华，韩婷，代宇婕，
申请(专利权)人：中国人民解放军陆军军医大学，
类型：发明
国别省市：