诊断犬科动物的心脏疾病和退行性二尖瓣疾病制造技术

本发明专利技术涉及通过使用包括特定属和种的微生物组来诊断犬科动物的心脏疾病的方法，该心脏疾病包括早期退行性二尖瓣疾病。在一个实施方案中，该方法可包括：测量粪便细菌的标准化相对丰度，该粪便细菌包括：粪杆菌属、Turicibacter、链球菌属、大肠杆菌、布劳特氏菌属、梭菌属和C.hiranonis；基于粪便细菌计算失调指数；以及如果该失调指数大于

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】诊断犬科动物的心脏疾病和退行性二尖瓣疾病
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2020年12月18日提交的美国临时申请序列号63/127,247的优先权，其公开内容全文以引用方式并入本文。

技术介绍

[0003]犬科动物退行性二尖瓣疾病(DMVD)的特征在于缓慢进行性瓣膜变性，其引起二尖瓣回流，并且在一些狗中引起充血性心力衰竭(CHF)。虽然早期阶段的狗通常具有较长的临床前时期，但一旦进展到CHF阶段，疾病就更快地进展，平均存活时间小于12个月。因此，在早期临床前阶段进行干预以延长受影响狗的寿命是非常有意义的。近年来，由美国兽医内科学院(ACVIM)制定的同意委员会采用了用于对犬科动物DMVD进行分类的分期方案。处于发展成DMVD风险但在其它方面健康的狗被认为是阶段A；由于二尖瓣回流而具有心脏杂音但无CHF临床征象的狗被归类为阶段B；具有明显CHF临床征象的狗被归类为阶段C。由于不存在或存在心脏重塑，阶段B狗被进一步分成阶段B1或B2。
[0004]目前，已证明对早期临床前DMVD有效的唯一药物是pimobanden，其与任何药物一样具有副作用。目前，DMVD诊断的黄金标准为超声心动图，其不仅昂贵而且还需要高度专业化的兽医心脏病专家。因此，一直在寻求克服当前方法和治疗的缺点的有效诊断方法和治疗。

技术实现思路

[0005]本公开总体上涉及诊断犬科动物的心脏疾病和退行性二尖瓣疾病(DMVD)，并且在一个方面，涉及诊断早期DMVD。在一个实施方案中，诊断犬科动物的心脏疾病的方法可包括：测量粪便细菌的标准化相对丰度，该粪便细菌包括：粪杆菌属、Turicibacter、链球菌属、大肠杆菌、布劳特氏菌属、梭菌属和C.hiranonis；基于粪便细菌计算失调指数；以及如果该失调指数大于
‑
1.0则确定犬科动物患有心脏疾病。
[0006]在另一个实施方案中，诊断犬科动物的早期DMVD的方法可包括：测量生物标志物的标准化相对丰度，该生物标志物选自：Catenibacterium mitsuokai、Butyricicoccus pullicaecorum、Bacteroides coprocola、Bacteroides plebeius、Allobaculum stercoricanis或它们的组合；以及如果Catenibacterium mitsuokai的标准化相对丰度介于0.3至3之间，Butyricicoccus pullicaecorum的标准化相对丰度介于0.14至0.35之间，Bacteroides coprocola的标准化相对丰度介于0.6至1.3之间，Bacteroides plebeius的标准化相对丰度介于0.1至0.8之间，或Allobaculum stercoricanisi的标准化相对丰度介于0.1和1.5之间，则确定犬科动物患有早期DMVD。
[0007]在另一个实施方案中，诊断犬科动物的早期DMVD的方法可包括：测量属中细菌的标准化相对丰度，其中所述属选自：链型杆菌属、普雷沃菌属、丁酸球菌属、粪杆菌属、梭菌属、Allobaculum或它们的组合；以及如果链型杆菌属中细菌的标准化相对丰度介于0.3至3之间，普雷沃菌属中细菌的标准化相对丰度介于0.5至4之间，丁酸球菌属中细菌的标准化
相对丰度介于0.14至0.4之间，粪杆菌属中细菌的标准化相对丰度介于0.012至0.04之间，梭菌属中细菌的标准化相对丰度介于2和4之间，或Allobaculum属中细菌的标准化相对丰度介于0.2和1.5之间，则确定犬科动物患有早期DMVD。
[0008]另外的特征和优点在本文中有所描述，并且在阅读下述具体实施方式之后将是显而易见的。
具体实施方式
[0009]定义
[0010]如在本公开和所附权利要求中所用，单数形式“一个”、“一种”和“所述(该)”包括复数指代物，除非上下文另外明确规定。因此，例如，提及“一种或多种粪便细菌”或“所述一种或多种粪便细菌”包括两种或更多种此类细菌。在“X和/或Y”的上下文中使用的术语“和/或”应解释为“X”或“Y”或“X和Y”。当在本文中使用时，术语“示例”和“诸如”(特别是当后跟项目列表时)仅是示例性和说明性的，不具有排他性或全面性。
[0011]如本文所用，“约”应理解为是指某一数值范围内的数字，例如所提及数字的
‑
10％至+10％的范围、在所提及数字的
‑
5％至+5％的范围内，或在一个方面在所提及数字的
‑
1％至+1％的范围内，在一个特定方面在所提及数字的
‑
0.1％至+0.1％的范围内。此外，本文中的所有数值范围都应理解为包含该范围内的所有整数或分数。另外，这些数值范围应理解为对涉及该范围内任何数字或数字子集的权利要求提供支持。例如，1至10的公开应理解为支持1至8、3至7、1至9、3.6至4.6、3.5至9.9等的范围。
[0012]如本文所用，“介于
…
之间”包括端值。例如，介于
‑
1和0.5之间的失调指数包括其中失调是
‑
1或0.5。
[0013]除非另外特别规定，否则本文表述的所有百分比都以组合物的干物质基础按重量计算。本领域的技术人员将认识到，术语“干物质基础”是指移除组合物中的任何游离水分后，再测量或确定组合物中成分的浓度或百分比。当提及pH时，其值对应于利用标准设备在25℃处测量的pH。“量”可以是每份组合物或每个独立单位组合物中所提及组分的总量，以及/或者可以是按干重计的所提及组分的重量百分比。此外，“量”包括零；例如，化合物量的表述不一定意味着该化合物存在，除非后跟不含零的范围。
[0014]如本文所用，“标准化相对丰度”是指通过获取每个计数并除以每个样品中的总序列计数并用平方根转化而计算的每种微生物的量。
[0015]如本文所用，“早期退行性二尖瓣疾病”是指退行性二尖瓣疾病的阶段B。
[0016]如本文所用，“阶段A”是指具有发生退行性二尖瓣疾病的风险，但在其它方面具有健康心脏的狗。
[0017]如本文所用，“阶段B”是指由于二尖瓣回流而具有心脏杂音但没有充血性心力衰竭临床征象的狗。“阶段B”包括阶段B1(不存在心脏重塑)和阶段B2(存在心脏重塑)。
[0018]如本文所用，“阶段C”是指具有充血性心力衰竭的狗。
[0019]如本文所用，“退行性二尖瓣疾病”、“DMVD”、“慢性瓣膜性心脏疾病”、“CVD”、“黏液瘤二尖瓣疾病”和“MMVD”可互换使用，并且是指引起二尖瓣回流和/或充血性心力衰竭(CHF)的进行性瓣膜变性，并且包括阶段A、阶段B和阶段C。
[0020]如本文所用，“失调指数”或“DI”通过测量测试样品与每一类的平均值(原型)的接
stercoricanis或它们的组合；以及如果Catenibacterium mitsuokai的标准化相对丰度介于0.3至3之间，本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.诊断犬科动物的心脏疾病的方法，所述方法包括：测量粪便细菌的标准化相对丰度，所述粪便细菌包括：粪杆菌属(Faecalibacterium)、Turicibacter、链球菌属(Streptococcus)、大肠杆菌(E.Coli)、布劳特氏菌属(Blautia)、梭菌属(Fusobacterium)和C.hiranonis；基于所述粪便细菌计算失调指数；以及如果所述失调指数大于
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1.0，则确定所述犬科动物患有心脏疾病。2.根据权利要求1所述的方法，当所述失调指数介于
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1和0.5之间时，进一步确定所述犬科动物患有早期退行性二尖瓣疾病。3.根据权利要求2所述的方法，当所述失调指数介于
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1和
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0.25之间时，进一步确定所述早期退行性二尖瓣疾病是B1。4.根据权利要求2所述的方法，当所述失调指数介于
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0.25和0.5之间时，进一步确定所述早期退行性二尖瓣疾病是B2。5.根据权利要求1所述的方法，当所述失调指数大于0.5时，进一步确定所述犬科动物患有充血性心力衰竭。6.诊断犬科动物的早期退行性二尖瓣疾病的方法，所述方法包括：测量生物标志物的标准化相对丰度，所述生物标志物选自：Catenibacterium mitsuokai、Butyricicoccus pullicaecorum、Bacteroides coprocola、Bacteroides plebeius、Allobaculum stercoricanis或它们的组合；以及如果所述Catenibacterium mitsuokai的标准化相对丰度介于0.3至3之间，所述Butyricicoccus pullicaeco...

【专利技术属性】
技术研发人员：Q，
申请(专利权)人：雀巢产品有限公司，
类型：发明
国别省市：