一种与连翘种质资源鉴定相关的SSR分子标记及其对应引物与应用制造技术

本发明专利技术公布了一种与连翘种质资源鉴定相关的SSR分子标记及其对应引物与应用，属于DNA分子标记及其检测技术领域。本发明专利技术通过对连翘转录组测序数据进行分析获得连翘多态性SSR引物，通过引物设计、琼脂糖凝胶电泳对连翘种质资源进行鉴定，检测结果具有多态性高、效率高和稳定性好等特点，填补了目前国内连翘SSR分子标记缺乏的空白。子标记缺乏的空白。

【技术实现步骤摘要】
一种与连翘种质资源鉴定相关的SSR分子标记及其对应引物与应用


[0001]本专利技术涉及分子生物
，尤其涉及一种与连翘种质资源鉴定相关的SSR分子标记及其对应引物与应用。

技术介绍

[0002]连翘(Forsythia suspensa(Thunb.)Vahl)为木犀科连翘属灌木或小乔木植物的果实，具有清热解毒、抗氧化、抗病毒、抗炎和抗肿瘤等功效。在我国主要分布于山西、河南、河北、陕西和湖北等省，是我国传统的大宗药材，连翘按照收获期的不同，分为“青翘”和“老翘”。连翘始记载于《神农本草经》：味苦平、主寒热、破血结、消肿毒、利小便。据《中国药典》记载连翘的主要药效成分为连翘苷、连翘酯苷A和挥发油，具有清热解毒、消肿散结，主治丹毒、风热感冒、温病初起、高热烦渴等。现代分析化学研究表明连翘含有丰富的生物活性成分，包括萜类、脂质、酚酸和和黄酮类化合物。连翘是连花清瘟胶囊、维C银翘片和抗病毒口服液等100多种药品的主要成分。
[0003]连翘主要以野生资源为主，因生长环境差异和采收时期不同等原因造成连翘质量参差不齐，个体间含量差异显著。现有本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与连翘种质资源鉴定相关的SSR分子标记及其对应引物与应用，其特征在于(1)通过三代转录组测序技术对连翘样本进行测序，将测序数据进行过滤，去除其中的接头序列及低质量的数据，进行序列组装获得高质量的连翘转录组数据(2)从转录组数据进行SSR检测(3)根据SSR信息进行引物设计(4)PCR体系扩增对引物进行筛选(5)引物有效性鉴定。2.根据权利要求1所述的一种与连翘种质资源鉴定相关的SSR分子标记及其对应引物与应用，其特征在于：步骤(1)转录组测序样本为不同种质资源的连翘果实样本。3.根据权利要求1所述的一种与连翘种质资源鉴定相关的SSR分子标记及其对应引物与应用，其特征在于：步骤(2)转录组SSR检测是采用MISA软件对转录组中的Unigene进行SSR进行鉴定，鉴定出6种类型的SSR：单碱基(Mono
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nucleotide)重复SSR、双碱基(Di
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nucleotide)重复SSR、三碱基(Tri
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nucleotide)重复SSR、四碱基(Tetra
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nucleotide)重复SSR、五碱基(Penta
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nucleotide)重复SSR和六碱基(Hexa
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nucleotide)重复SSR。4.据权利要求1所述的一种与连翘种...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘灵娣，姜涛，温春秀，田伟，
申请(专利权)人：河北省农林科学院经济作物研究所，
类型：发明
国别省市：