用于分析活性污泥微生物群落结构及动态变化的群落芯片制造技术

技术编号:3835342 阅读:260 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术公开了一种用于分析活性污泥微生物群落结构及动态变化的群落芯片,是在玻片或硅片或尼龙膜等材料上固定检测细菌的DNA探针,所述探针为序列表SEQ ID NO.1-SEQ IDNO.66所述的核苷酸序列,所述探针所针对的OTU及其代表克隆子Genbank登录号、各OTU最近源菌株及其相似性的关系如表1;利用本发明专利技术的群落芯片分析活性污泥微生物群落结构及动态变化,具有适时、灵敏、快速、准确、高效且获得菌群变化信息量大等特点。本发明专利技术可以快速分析活性污泥微生物群落结构,同一张芯片可以同时检测代表不同分类层次(门、纲、目、科、属)的57种OTUs。

【技术实现步骤摘要】

【技术保护点】
一种用于分析活性污泥微生物群落结构及动态变化的群落芯片,其特征是在玻片或硅片或尼龙膜等材料上固定检测细菌的DNA探针,所述探针为序列表SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.66所述的核苷酸序列,所述探针所针对的OTU及其代表克隆子Genbank登录号、各OTU最近源菌株及其相似性的关系如表1; 表1: 探针 针对OTU及其代 OTU最近源菌株及其Genbank登录号 相似性 表克隆子 % Genbank登录号 SEQ ID NO. 1 OTU2,FJ348598 Rhodobacter gluconicum,AB077986 99 SEQ ID NO.2 SEQ ID NO.3 OTU3,FJ348606 Rhodobacter gl uconicum,AB077986 96 SEQ ID NO.4 OTU5,FJ348609 Rhodobacter sp.THWCSN29,AM888193 88 SEQ ID NO.5 SEQ ID  NO.6 OTU7,FJ348602 未培养的红细菌科细菌克隆子DS105,DQ234188 92 OTU12,FJ348588 Rhodobium pfennigii AR2102,EU445271 90 S EQ ID NO.7 OTU8,FJ348603 Mesorhizobium huakuii CCBAU03094,EU399717 97 OTU9,FJ348601 Mesorhizobium sp.NH-14,A B196496 97 SEQ ID NO.8 OTU13,FJ348578 Methylobacterium oryzae CBMB110,AY683046 99 SEQ ID NO.9 SEQ ID  NO.10 OTU16,FJ348596 Diophrys sp.细菌共生体,AJ630204 98 SEQ ID NO.11 OTU17,FJ348593 Candidatus Alysiosphaera e uropeae,AY428766 93 SEQ ID NO.44 SEQ ID NO.12 OTU18,FJ348587 Hy...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:金敏李君文王新为王景峰陈照立邱志刚谌志强
申请(专利权)人:中国人民解放军军事医学科学院卫生学环境医学研究所
类型:发明
国别省市:12[中国|天津]

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