一种与控制印度南瓜灰色果皮颜色基因Cmamg紧密连锁的分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术涉及分子标记技术领域。本发明专利技术提供了一种与控制印度南瓜灰色果皮颜色基因Cmamg紧密连锁的分子标记及其应用，所述分子标记为Cmamg

【技术实现步骤摘要】
一种与控制印度南瓜灰色果皮颜色基因Cmamg紧密连锁的分子标记及其应用


[0001]本专利技术涉及分子标记
，尤其涉及一种与控制印度南瓜灰色果皮颜色基因Cmamg紧密连锁的分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]印度南瓜（Cucurbita maxima ）属于葫芦科（Cucurbitaceae）南瓜属（Cucurbita）一年生蔓性草本植物，起源于南美洲，种质资源丰富，具有很高的营养价值、药用价值和栽培价值，种植广泛。果皮颜色是葫芦科作物重要的农艺性状之一，不同地域的消费人群对于南瓜果皮颜色有着不同的需求，其颜色的深浅以及均匀程度直接影响南瓜的商品价值。印度南瓜果皮颜色丰富多样，南瓜子房在授粉前呈浅黄或浅绿色，随着发育逐渐变为白色、浅黄色、深黄色、绿色、深绿色、橙红色、黑色等，可以大体分为绿色系，红色系和黄色系。其中绿色系果皮主要色素成分为叶绿素，红色系果皮从浅橙色到深红色变化与类胡萝卜素总含量及组成有关，黄色系果皮中叶绿素和类胡萝卜素含量都较低。
[0003]果皮着色程度是评价园艺作物成熟度和是否采收的重要指示标准，不仅对植物的生长发育具有重要的生理意义，也是消费者对不可鲜食蔬菜进行挑选时最直观的选择标准。因此，对于葫芦科作物来说，果皮颜色一直是育种家和种植者在育种以及栽培过程中的重点关注性状。目前，有关印度南瓜果皮颜色基因定位及相关分子标记开发的研究较少。基于此，提出本申请。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于提供一种与控制印度南瓜灰色果皮颜色基因Cmamg紧密连锁的分子标记及其应用，在植株苗期对其基因型进行直接选择，加快育种的进程。
[0005]为了实现上述专利技术目的，本专利技术提供以下技术方案：本专利技术提供了一种与控制印度南瓜灰色果皮颜色基因Cmamg紧密连锁的分子标记，所述分子标记为Cmamg
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01，所述Cmamg
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01由DNA片段1和DNA片段2组成；所述DNA片段1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述DNA片段2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
[0006]作为优选，所述DNA片段1与灰色果皮基因Cmamg连锁，所述DNA片段2与绿色果皮基因CmaMG连锁。
[0007]本专利技术还提供了所述分子标记在南瓜果皮颜色检测中的应用。
[0008]本专利技术还提供了一种用于检测分子标记的引物对，所述引物对包括上游引物和下游引物；所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
[0009]本专利技术还提供了所述引物对在南瓜果皮颜色检测中的应用。
[0010]本专利技术还提供了所述引物对在扩增所述分子标记中的应用。
[0011]本专利技术还提供了一种利用引物对扩增分子标记的方法，所述方法包括如下扩增程序：92~96℃ 3.5~4.5min；92~96℃ 28~32s；62~66℃ 28~32秒；70~74℃ 38~42s，33~37个循环；70~74℃ 4.5~5.5min，降温至2~6℃。
[0012]本专利技术还提供了一种所述引物对检测所述分子标记的方法，所述方法包括如下步骤：（1）提取待测印度南瓜材料的全基因组DNA；（2）利用所述引物对进行PCR扩增；（3）观察扩增的结果，具有灰色果皮表型的单株通过PCR扩增产生312 bp单一特征条带；具有绿色果皮表型的纯合单株产生892 bp的单一特征条带；具有绿色果皮表型但该位点为杂合基因型时，PCR扩增获得892 bp和312 bp的两条特征条带。
[0013]本专利技术提供了一种与控制印度南瓜灰色果皮颜色基因Cmamg紧密连锁的分子标记及其应用，所述分子标记为Cmamg
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01，所述Cmamg
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01由DNA片段1和DNA片段2组成；所述DNA片段1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述DNA片段2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本专利技术的分子标记与控制印度南瓜果皮颜色基因紧密连锁，可以在植株苗期对其基因型进行直接选择，加快育种的进程，并为解析南瓜果皮颜色形成的调控机制提供新的基因资源和理论依据，有利于南瓜果皮颜色的精准育种。
附图说明
[0014]图1为InDel标记Cmamg
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01 F2群体PCR产物条带，M代表Marker，P1为印度南瓜品系银辉二号，P2为印度南瓜品系谢花面， F1为利用这两个亲本配制F1代，1~93为部分F2群体；图2为InDel标记Cmamg
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01 种质资源PCR产物条带，M代表Marker，种质资源有14个绿色果皮种质和9个灰色果皮种质。
具体实施方式
[0015]本专利技术提供了一种与控制印度南瓜灰色果皮颜色基因Cmamg紧密连锁的分子标记，所述分子标记为Cmamg
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01，所述Cmamg
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01由DNA片段1和DNA片段2组成；所述DNA片段1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；SEQ ID NO.1：AGTCCTCTTCAGCGGCTCCGTTGGACAACCTCCTTGTTCCGGTTAATTTTCAGGCCTATTAGTCGGAAGAACAGTAACGAATCTATCGATATTCTGCTGGCTACAGTTTGTTTCACTGTTCAGTTAGGGTTTACTCCGAGTTGCCTTCTTCAGGTGTAGATTCGTTAGTATTATGTTTCGTTTGGTGCATTATTCTCATTTCATGTTTGTGGCCTCGTAGATCGGTGCACCGCCGGAGGTCGCTAATATCCTAGGCAGAAGCGTTCGAGGAAGAGACATCGGCGAAAGAACTTCGGGCGTTTCAACTTGCTT；所述DNA片段2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；SEQ ID NO.2：AGTCCTCTTCAGCGGCTCCGTTGGACAACCTCCTTGTTCCGGTTAATTTTCAGGCCTATTCTACTGCTTCTGCAGACTATTCTCATTGGCTTCAGGTTTTTGGATCGGGACACGTACCGTCGGTGTCGTCGGGGGACTACGATGCCGCTTTGGCGGTTGTTTCCGAGGAGGAGTCTGCCGGTGCAATTAGAGAGAAAATTGCTTCTCATCCTCTTTACCC
TAGACTTGTCGATGCGTTTGTTGACTGCCAAAAGGTGGTTTTCTACTCTAAGCTTTAAGGCCACGACGTTCTAAACTTTAAAGAAATAATGCAATGCTTATGGTTGGATGTTAAGGAATGAAGAAAGATTCTTAAGAAATTTGTATGAGTGAGTAATTCTTTACGCCGTCAAAAAACTCGATACAGACTTGTTAACACTCACGAAATTAATTCAAAGACGGCATAGTACATGTCAAACTA本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与控制印度南瓜灰色果皮颜色基因Cmamg紧密连锁的分子标记，其特征在于，所述分子标记为Cmamg
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01，所述Cmamg
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01由DNA片段1和DNA片段2组成；所述DNA片段1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述DNA片段2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，所述DNA片段1与灰色果皮基因Cmamg连锁，所述DNA片段2与绿色果皮基因CmaMG连锁。3.权利要求1或2所述分子标记在南瓜果皮颜色检测中的应用。4.一种用于检测权利要求1所述分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括上游引物和下游引物；所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。5.权利要求4所述引物对在南瓜果皮颜色检测中的应用。6.权...

【专利技术属性】
技术研发人员：屈淑平，徐文龙，王超杰，王云莉，陈方圆，
申请(专利权)人：东北农业大学，
类型：发明
国别省市：