预测肺癌免疫治疗疗效的标志物及评分体系的构建方法技术

本发明专利技术提供了一种预测肺癌免疫治疗疗效的标志物及评分体系的构建方法，涉及生物技术领域。经发明专利技术人研究发现，CypB的mRNA、FAM83H

【技术实现步骤摘要】
预测肺癌免疫治疗疗效的标志物及评分体系的构建方法


[0001]本专利技术涉及生物
，尤其是涉及一种预测肺癌免疫治疗疗效的标志物及评分体系的构建方法。

技术介绍

[0002]癌症是严重威胁人类生命健康的重大疾病。其中肺癌的发生率和死亡率位居癌症之首。对于肿瘤患者治疗来说，针对特定驱动基因突变的靶向治疗和近年来新兴的针对机体免疫系统调控的免疫治疗都具有较好的效果，但是这两种治疗方案有其适应征，仍有超过60％的患者既没有明确的基因突变作为药物靶点，也没有高表达PD
‑
L1，只能不断尝试不同的化疗药物，观察疗效后在决定继续治疗还是更换药物。
[0003]然而目前临床上，对于肿瘤患者尚缺乏有效的预后标志物。对于治疗中期的患者，主要进行影像学的评估，评估其肿瘤大小的变化，对于变化超过15％的患者才定义为进展。然而肿瘤体积的微小变化，以及肿瘤内部的分子改变，都无法从影响上获得信息。
[0004]并且，关于肿瘤患者的预后标志物，现有的研究很大一部分集中在肿瘤的血清标志物。但血清样本来源远离肿瘤病灶，已有一些研究报道了肿瘤局部的细胞因子水平与血清中具有巨大差别。因此血清可能无法反映肿瘤原位的状态。此外单标志物的评估也远不如，多标志物，多纬度的综合评估。
[0005]由于以上原因的存在，会导致有一部分发展较快的肺癌患者，可能因为没有及时使用有效的治疗方案而延误了治疗，无法制止肿瘤的迅速进展。因此，急需一种能在癌症早期判断患者预后的分子标志物，筛选出预后较差、进展较快的病人，发现治疗过程中肿瘤的微小进展，辅助患者治疗过程中的方案选择和及时的干预，这对挽救病人生命具有重要的意义。
[0006]有鉴于此，特提出本专利技术。

技术实现思路

[0007]本专利技术的第一目的在于提供一种预测肺癌免疫治疗疗效的标志物，以解决上述问题中的至少一种。
[0008]本专利技术的第二目的在于提供上述标志物在制备预测肺癌免疫治疗疗效的产品中的应用。
[0009]本专利技术的第三目的在于提供一种预测肺癌免疫治疗疗效的试剂盒。
[0010]本专利技术的第四目的在于提供一种预测肺癌免疫治疗疗效的评分体系的构建方法。
[0011]第一方面，本专利技术提供了一种预测肺癌免疫治疗疗效的标志物，所述标志物包括RNA和细胞表面标记蛋白；
[0012]所述RNA包括CypB的mRNA、FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA和LncRNAVPS9D1
‑
AS1；
[0013]所述细胞表面标记蛋白包括panCK、CD3、CD4、CD8和Foxp3。
[0014]第二方面，本专利技术提供了上述标志物在制备预测肺癌免疫治疗疗效的产品中的应
用。
[0015]第三方面，本专利技术提供了一种预测肺癌免疫治疗疗效的试剂盒，所述试剂盒包括用于检测CypB、FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA和LncRNA VPS9D1
‑
AS1的探针，以及用于检测panCK、CD3、CD4、CD8和Foxp3的生物大分子。
[0016]作为进一步技术方案，所述生物大分子包括抗体或抗体功能片段。
[0017]第四方面，本专利技术提供了一种预测肺癌免疫治疗疗效的评分体系的构建方法，包括如下步骤：
[0018]a.以患者的肺癌组织为样本，检测样本中CypB的mRNA、FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA和LncRNAVPS9D1
‑
AS1，获取CypB的mRNA、FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA和LncRNA VPS9D1
‑
AS1的表达量评分；
[0019]b.检测a步骤样本中panCK、CD3、CD4、CD8和Foxp3，根据检测结果区分肿瘤细胞、杀伤性T细胞、辅助T细胞和调节性T细胞，并获得肿瘤细胞区域和肿瘤间质区域中杀伤性T细胞、辅助T细胞和调节性T细胞的计数；
[0020]c.构建评分体系公式：免疫评分＝a1*CypB的mRNA的表达量评分+a2*FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA的表达量评分+a3*LncRNA VPS9D1
‑
AS1的表达量评分+b1*肿瘤细胞区域内杀伤性T细胞的数量/肿瘤细胞区域内辅助T细胞的数量+b2*肿瘤细胞区域内杀伤性T细胞的数量/肿瘤细胞区域内调节性T细胞的数量+b3*肿瘤细胞区域内杀伤性T细胞的数量/肿瘤间质区域内杀伤性T细胞的数量+b4*肿瘤细胞区域内辅助T细胞的数量/肿瘤间质区域内辅助T细胞的数量；
[0021]所述a1、a2、a3、b1、b2、b3和b4为系数；
[0022]以CypB的mRNA的表达量评分、FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA的表达量评分、LncRNAVPS9D1
‑
AS1的表达量评分、肿瘤细胞区域内杀伤性T细胞的数量/肿瘤细胞区域内辅助T细胞的数量、肿瘤细胞区域内杀伤性T细胞的数量/肿瘤细胞区域内调节性T细胞的数量、肿瘤细胞区域内杀伤性T细胞的数量/肿瘤间质区域内杀伤性T细胞的数量、肿瘤细胞区域内辅助T细胞的数量/肿瘤间质区域内辅助T细胞的数量为自变量，以患者免疫治疗后的结局数据为因变量，采用数学建模方法确定系数a1、a2、a3、b1、b2、b3和b4的值。
[0023]作为进一步技术方案，a步骤中，样本中CypB的mRNA、FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA和LncRNA VPS9D1
‑
AS1的检测方法包括RNA scope方法。
[0024]作为进一步技术方案，b步骤中，样本中panCK、CD3、CD4、CD8和Foxp3的检测方法包括Opal多色荧光标记法。
[0025]作为进一步技术方案，b步骤中，panCK阳性，鉴定为肿瘤细胞；CD3阳性和CD8阳性，鉴定为杀伤性T细胞；CD3阳性、CD4阳性和Foxp3阴性，鉴定为辅助T细胞；CD3阳性、CD4阳性和Foxp3阳性，鉴定为调节性T细胞。
[0026]作为进一步技术方案，b步骤中，还包括对样本进行细胞核染色的步骤，以识别每一个单独的细胞。
[0027]作为进一步技术方案，所述数学建模方法包括lasso回归、支持向量机、随即森林或决策树中的至少一种。
[0028]作为进一步技术方案，a1＝
‑
0.202、a2＝
‑
0.734、a3＝
‑
0.505、b1＝2.331、b2＝0.785、b3＝1.732、b4＝
‑
2.862。
[0029]与现有技术相比，本专利技术具有以下有益效果：
[0030]经专利技术人研究发现，CypB的mRNA、FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA和LncRNA VPS9D1
‑
AS1与肺癌的预后有关，肺癌病灶周本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种预测肺癌免疫治疗疗效的标志物，其特征在于，所述标志物包括RNA和细胞表面标记蛋白；所述RNA包括CypB的mRNA、FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA和LncRNAVPS9D1
‑
AS1；所述细胞表面标记蛋白包括panCK、CD3、CD4、CD8和Foxp3。2.权利要求1所述的标志物在制备预测肺癌免疫治疗疗效的产品中的应用。3.一种预测肺癌免疫治疗疗效的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括用于检测CypB的mRNA、FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA和LncRNA VPS9D1
‑
AS1的探针，以及用于检测panCK、CD3、CD4、CD8和Foxp3的生物大分子。4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述生物大分子包括抗体或抗体功能片段。5.一种预测肺癌免疫治疗疗效的评分体系的构建方法，其特征在于，包括如下步骤：a.以患者的肺癌组织为样本，检测样本中CypB的mRNA、FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA和LncRNA VPS9D1
‑
AS1，获取CypB的mRNA、FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA和VPS9D1
‑
AS1 VPS9D1
‑
AS1的表达量评分；b.检测a步骤样本中panCK、CD3、CD4、CD8和Foxp3，根据检测结果区分肿瘤细胞、杀伤性T细胞、辅助T细胞和调节性T细胞，并获得肿瘤细胞区域和肿瘤间质区域中杀伤性T细胞、辅助T细胞和调节性T细胞的计数；c.构建评分体系公式：免疫评分＝a1*CypB的mRNA的表达量评分+a2*FAM83H
‑
AS1基因转录的RNA的表达量评分+a3*LncRNA VPS9D1
‑
AS1的表达量评分+b1*肿瘤细胞区域内杀伤性T细胞的数量/肿瘤细胞区域内辅助T细胞的数量+b2*...

【专利技术属性】
技术研发人员：‑，
申请(专利权)人：北京市结核病胸部肿瘤研究所，
类型：发明
国别省市：