精确和可编程的DNA切刻系统和方法技术方案

切刻分子切刻或切割易位通过实时单碱基读取纳米孔测序装置的多核苷酸分子，所述实时单碱基读取纳米孔测序装置通过探测所述多核苷酸分子的个别碱基实现实时单碱基读取测序。引导所述多核苷酸分子进入并且易位通过所述纳米孔测序装置的纳米孔。确定切口或分裂的靶序列，并且通过所述纳米孔测序装置对所述多核苷酸分子进行测序。在读取所述靶序列之后，施加外部激发以触发一个或多个切刻分子，并且从而在邻近所述一个或多个切刻分子的位置处切刻或切割所述多核苷酸。在需要进一步切割或切割相同靶序列的情况下，继续过程，并且在需要切割或切割另一靶序列的情况下，确定另一靶序列。列。列。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】精确和可编程的DNA切刻系统和方法


[0001]所公开的技术涉及用于切刻多核苷酸的方法和设备，并且更具体地，涉及通过单碱基分辨率的实时测序(下文称为“单碱基读取”)和分子切刻动作的协同组合的精确和可编程的多核苷酸切刻。

技术介绍

[0002]在基因组学和生物工程中，切刻或切割是大多数核酸体内和体外操作的关键步骤，如过多的分子马达一直沿着活细胞的染色体有力地工作所显示的。内切核酸酶是通过分离多核苷酸的核苷酸而切割多核苷酸链的酶。限制性内切核酸酶(RE)是重要的分子工具之一，其主要通过生成切口或分裂来操作双链DNA。自从Watson和Crick在1953中发现DNA双螺旋结构以来，已经发现了多种类型的RE。RE可以根据它们的结构、特异识别序列、催化活性和切刻或切割位置和分子进行分类。不同的RE用于核酸操作、分析和样本制备的应用中，其包括克隆、多态性研究、甲基化剖析、基因表达分析和高通量DNA测序的优化。
[0003]RE由识别结构域和切割结构域组成。前者识别并且结合特异核苷酸序列，称为识别序列。识别序列通常具有4至8个碱基。在该识别序列与识本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于精确和可编程的多核苷酸切刻的系统，其包含：一个或多个切刻分子，以对多核苷酸分子进行切刻或切割动作；单碱基读取纳米孔测序装置，其被配置成通过以下方式实现所述多核苷酸分子的实时单碱基读取测序：在所述单碱基读取纳米孔测序装置的纳米孔中探测所述多核苷酸分子的个别碱基的特性，获取所述多核苷酸分子的所述个别碱基的被探测的特性的测量值，将所述测量值传输到处理器，所述处理器被配置成将所述测量值转换为代表所述个别碱基的碱基身份，并且将所述碱基身份与先前测量的所述多核苷酸分子的个别碱基的碱基身份一起依次存储为多核苷酸分子序列数据；处理器，其被配置成读取所述多核苷酸分子序列数据并且识别预定序列；以及发射器，其传输信号以产生所述一个或多个切刻分子的激发，所述激发触发了所述多核苷酸分子上的所述切刻或切割动作。2.根据权利要求1所述的系统，其中所述预定序列是碱基身份的任何序列，并且所述多核苷酸分子上的所述切刻或切割动作在所述一个或多个切刻分子不与所述多核苷酸分子的识别位点结合的情况下发生。3.根据权利要求1所述的系统，其中所述一个或多个切刻分子在距离实时单碱基读取纳米孔测序装置的所述纳米孔已知距离处接枝。4.根据权利要求1所述的系统，其中所述一个或多个切刻分子中的每一个是天然或合成分子，并且所述纳米孔是生物纳米孔、无机纳米孔或有机纳米孔。5.根据权利要求1所述的系统，其中外部激发可以是化学、生物或物理激发。6.根据权利要求1所述的系统，其中当所述多核苷酸分子易位穿过所述纳米孔时，所述实时单碱基读取纳米孔测序装置以实时方式探测并且鉴定多核苷酸分子的个别碱基。7.根据权利要求6所述的系统，其中所述实时单碱基读取纳米孔测序装置被编程以读取和鉴定所述多核苷酸分子的个别碱基的至少一个预定序列。8.根据权利要求1所述的系统，其中所述纳米孔具有允许多核苷酸分子易位的形状。9.根据权利要求7所述的系统，其中所述特性是所述纳米孔中所述个别碱基的离子阻塞电流。10.一种用于多核苷酸切刻的方法，其包含：将多核苷酸分子引导至实时单碱基读取纳米孔测序装置的纳米孔；引导所述多核苷酸分子进入并且易位穿过所述纳米孔；确定切口或分裂的靶序列；通过所述实时单碱基读取纳米孔测序装置对所述多核苷酸进行测序；在通过所述实时单碱基读取纳米孔测序装置读取所述靶序列之后，施加外部激发以触发一个或多个切刻分子，并且从而切刻或切割所述多核苷酸分子的相邻位置；
在需要进一步切刻或切割相同靶序列的情况下，继续测序、读...

【专利技术属性】
技术研发人员：苏伟昌，黄家伟，何志业，
申请(专利权)人：纳生科技有限公司，
类型：发明
国别省市：