【技术实现步骤摘要】
一种基于脂质代谢相关基因的风险模型及其构建方法
[0001]本专利技术涉及生物
,具体地说,是关于一种基于脂质代谢相关基因的风险模型及其构建方法。
技术介绍
[0002]宫颈癌是世界上第四常见的癌症,宫颈癌患者的治疗效果取决于诊断时的疾病进展,目前临床上对宫颈癌患者的生存预测主要通过国际妇产科联盟(FIGO)分期。尽管目前手术、放化疗和免疫疗法已极大改善了宫颈癌患者预后,但是晚期患者的预后仍然不容乐观,因此探索更加有效的预后生物标志物对于临床决策至关重要。
[0003]脂肪酸是能量代谢的重要组成部分,是生物膜信号转导网络的重要组成部分。从头合成脂肪酸是癌细胞中普遍存在的特殊代谢表型之一,现有的基于脂肪酸代谢相关基因的宫颈癌预后模型是通过LASSO
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COX分析构建的,能对宫颈癌患者进行危险度分层以预测宫颈癌患者预后、评估不同危险度宫颈癌患者肿瘤免疫微环境的特征,为临床个性化治疗提供了理论依据。而现有技术着重于分析不同危险度宫颈癌患者免疫微环境特征差异,却未阐明不同危险度患者对免疫治疗反应的差异 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种基于脂质代谢相关基因的风险模型的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:收集患者转录组数据和临床信息,以1:1的比例随机分为训练集和测试集;S2:进行COX单因素回归分析并确定关键基因;S3:进行COX多因素回归分析,然后输出风险评分,根据脂代谢基因的表达数据,按照以下公式计算风险评分:风险评分=表达系数
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基因1+表达系数
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基因2+表达系数
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基因n系数;S4:以风险评分将患者划分为不同的风险集群。2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述构建方法还包括步骤S5:验证模型的有效性;所述验证是通过ROC曲线、Kaplan
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Meier生存分析验证模型的准确性。3.一种基于脂质代谢相关基因的宫颈癌预后风险模型,其特征在于,所述的风险模型基于权利要求1
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2任一所述的方法构建获得。4.根据权利要求3所述的风险模型,其特征在于,所述的脂质代谢相关基因为以下8个基因的组合:ABHD3、ECH1、ALDH3A2、ACLY、AIG1、PLA2G4A、MSMO1和SGPL1。5.根据权利要求3所述的风险模型,其特征在于,所述的风险模型包括风险评分,所述风险评分的风险分数==
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0.300121165035544*ABHD3表达量
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【专利技术属性】
技术研发人员:徐韶华,叶颖君,徐芳芳,
申请(专利权)人:上海市第一妇婴保健院,
类型:发明
国别省市:
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