用于药物的靶点蛋白质预测方法及装置、设备、存储介质制造方法及图纸

技术编号:37851867 阅读:25 留言:0更新日期:2023-06-14 22:42
本发明专利技术提供了用于药物的靶点蛋白质预测方法及装置、设备、存储介质,预测方法包括:获取药物数据、靶点蛋白质数据以及相互作用数据;根据相互作用数据,构建多个药物数据与多个靶点蛋白质数据的第一相互作用关系;对第一相互作用关系进行调整,以将不确定值调整为结合可能值,得到第二相互作用关系;根据第二相互作用关系中至少一个药物数据与靶点蛋白质数据的结合可能值,对靶点蛋白质数据进行排序,并将排名在预设范围内的靶点蛋白质数据作为第一靶点蛋白质数据。本发明专利技术通过第二相互作用关系中至少一个药物数据与多个靶点蛋白质数据的结合可能值,对多个靶点蛋白质数据进行排序,能够极大减少算力,从而提高对药物的靶点蛋白质的预测效率。点蛋白质的预测效率。点蛋白质的预测效率。

【技术实现步骤摘要】
用于药物的靶点蛋白质预测方法及装置、设备、存储介质


[0001]本专利技术涉及计算机
,具体涉及一种用于药物的靶点蛋白质预测方法及装置、设备、存储介质。

技术介绍

[0002]目前,针对靶点蛋白质发现的相关研究中,仅利用实验方法寻找与药物具有相互作用的靶点蛋白质,进而制造新药是较为困难的。不仅因为药物通常影响人体上的相关通路,还因为靶点蛋白质的表达会随着基因和基因表达丰度的影响,在人体不同部位浓度不同。为了寻找能够抑制或者激活相关通路的靶点蛋白质,现有技术中主要采取以下方式:将已知药物分子与海量靶点蛋白质分别进行对接,以根据其结合情况来对药物分子的靶点蛋白质进行预测;但这种预测方式由于需要将已知药物分子与海量靶点蛋白质分别进行分子对接,其对接过程会耗费大量算力,造成药物的靶点蛋白质的预测效率低的问题。
[0003]针对上述相关预测方式中由于需要将已知药物分子与海量靶点蛋白质分别进行分子对接,其对接过程会耗费大量算力,造成药物的靶点蛋白质的预测效率低的问题,目前尚未提出有效的解决方案。

技术实现思路
/>[0004]本专本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于药物的靶点蛋白质预测方法,其特征在于,包括:获取药物数据、靶点蛋白质数据以及相互作用数据;所述相互作用数据为药物分子与靶点蛋白质之间相互作用的数据;根据所述相互作用数据,构建多个所述药物数据与多个所述靶点蛋白质数据的第一相互作用关系;所述第一相互作用关系包括结合可能值和不确定值,所述结合可能值表示药物分子与靶点蛋白质结合的可能性,所述不确定值表示药物分子与靶点蛋白质结合的不确定性;对所述第一相互作用关系进行调整,以将所述不确定值调整为结合可能值,得到第二相互作用关系;根据所述第二相互作用关系中至少一个药物数据与多个所述靶点蛋白质数据的结合可能值,对多个所述靶点蛋白质数据进行排序,并将排名在预设范围内的靶点蛋白质数据作为第一靶点蛋白质数据。2.根据权利要求1所述的用于药物的靶点蛋白质预测方法,其特征在于,所述根据所述相互作用数据,构建多个所述药物数据与多个所述靶点蛋白质数据的第一相互作用关系,包括:根据所述药物数据、所述靶点蛋白质数据以及所述相互作用数据,构建第一矩阵;其中,所述第一矩阵用于表示第一相互作用关系,所述第一矩阵的每一行表示一个所述药物数据与多个靶点蛋白质数据的相互关系,每一列表示一个所述靶点蛋白质数据与多个所述药物数据的相互关系。3.根据权利要求2所述的用于药物的靶点蛋白质预测方法,其特征在于,所述对所述第一相互作用关系进行调整,以将所述不确定值调整为结合可能值,得到第二相互作用关系,包括:将所述第一矩阵进行奇异值分解,得到药物特征矩阵和蛋白质特征矩阵;对所述蛋白质特征矩阵的转置矩阵和所述药物特征矩阵进行聚合处理,得到第二矩阵;其中,所述第二矩阵用于表示第二相互作用关系,所述第二矩阵的每一行表示一个所述药物数据与多个靶点蛋白质数据的相互关系,每一列表示一个所述靶点蛋白质数据与多个所述药物数据的相互关系。4.根据权利要求1所述的用于药物的靶点蛋白质预测方法,其特征在于,所述方法还包括:分别计算所述至少一个药物数据对应的药物分子与多个第一靶点蛋白质数据对应的靶点蛋白质的结合能;根据所述结合能,从多个第一靶点蛋白质数据中筛选出第二靶点蛋白质数据。5.根据权利要求4所述的用于药物的靶点蛋白质预测方法,其特征在于,所述分别计算所述至少一个药物数据对应的药物分子与多个第一靶点蛋白质数据对应的靶点蛋白质的结合能之前,所述方法还包括:判断是否识别出所述第一靶点蛋白质数据对应的靶点蛋白质的对接口袋;所述对接口袋表示靶点蛋白质表面或内部与药物分子结合的位置;如果识别出所述靶点蛋白质的对接口袋,...

【专利技术属性】
技术研发人员:徐敏捷耿威李世博吕川
申请(专利权)人:上海微观纪元数字科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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