与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法及基因的应用技术

提供一种与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法及该基因的应用，其包括：步骤一、对口腔癌患者进行非靶向脂质组学检测，得到口腔癌患者和健康人之间的差异脂质代谢物；步骤二、结合生物信息学手段，从差异脂质代谢物中筛选与口腔癌发病机制和预后相关的脂质代谢基因；步骤三、采用WesternBlot手段验证脂质代谢基因在口腔癌细胞系中的表达。本发明专利技术探索OSCC脂质代谢调控的基因机制，通过调节脂质代谢辅助诊断OSCC，提高OSCC的临床诊疗模式提供坚实的基础。础。础。

【技术实现步骤摘要】
与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法及基因的应用


[0001]本专利技术涉及生物医疗
，尤其涉及一种与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法及基因的应用。

技术介绍

[0002]口腔癌是头颈部常见的恶性肿瘤，其中口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinomas，OSCC)为主要病理类型，占口腔癌病例的90％以上。OSCC治疗的首选方式是手术治疗，晚期通常辅以放疗和化疗。其中，40％的OSCC患者确诊时已经伴有淋巴结转移。无转移的OSCC患者的5年生存率约为90％，而转移性OSCC患者的5生存率仅为40％左右。因此，开发口腔癌特异性的治疗靶点已经成为该领域研究的热点。越来越多的文献报道揭示了一些基因的突变、结构变异及异常表达与口腔癌的发生发展密切相关。但是，因为口腔癌是一个多因素、多阶段、多机制的复杂病变过程，目前，尚无特异性的针对口腔癌的相关诊疗靶点。
[0003]脂质在信号转导、维持细胞膜的完整性、调节能量代谢等方面起着至关重要的作用。脂质代谢是代谢重编程的一部分，是许多癌症的标志。癌症发展的早期会增加脂质的从头合成和摄取。脂质参与各种癌症恶性转化，如甘油磷脂(GPL)已被证明可调节各种功能，如粘附、迁移、细胞凋亡和信号转导；胆固醇是脂筏的组成部分，并且还在细胞信号转导、控制致癌、耐药性和转移的途径中发挥关键作用。脂质代谢的重编程为肿瘤细胞提供能量和细胞结构分子，以满足肿瘤细胞快速增殖和转移的需求。研究表明，OSCC中脂肪生成增加与细胞侵袭性增加有关。目前，OSCC进展中脂质代谢的调节尚不明确。
[0004]因此，对OSCC的脂质谱开展系统性的研究，探索OSCC脂质代谢调控的分子机制，是本领域技术人员亟待解决的技术问题。

技术实现思路

[0005]为了解决上述问题，本专利技术提供一种与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法，其特征在于，包括：
[0006]步骤一、对口腔癌患者进行非靶向脂质组学检测，得到口腔癌患者和健康人之间的差异脂质代谢物；
[0007]步骤二、结合生物信息学手段，从所述差异脂质代谢物中筛选与口腔癌发病机制和预后相关的脂质代谢基因；
[0008]步骤三、采用Western Blot手段验证所述脂质代谢基因在口腔癌细胞系中的表达。
[0009]在某些实施方式中，所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，所述脂质代谢基因为DGKG基因。
[0010]在某些实施方式中，所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，所述步骤一还包括：
[0011]获取训练病例集，所述训练病例集中的受试者包括患病受试者和健康受试者；
[0012]采集所述受试者的血清样本，利用多元统计分析所述受试者的多个差异脂质代谢物。
[0013]在某些实施方式中，所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，所述步骤二还包括：
[0014]在HMDB数据库检索到与多个所述差异脂质代谢物相关的多个第一基因；
[0015]在TCGA数据库中分析头颈部鳞癌和健康人之间的差异表达的多个第二基因；
[0016]将多个所述第一基因和多个所述第二基因中多个相同基因作为候选的第三基因；
[0017]对所述第三基因进行单因素cox回归分析、多因素cox回归分析和T检验，确定脂质代谢基因。
[0018]在某些实施方式中，所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，所述步骤三具体为：
[0019]培养人口腔鳞状细胞癌细胞系SCC9、SCC25、Cal27和人永生化口腔角质形成细胞HaCat，通过Western blot从蛋白质水平进一步验证DGKG在OSCC细胞系和正常细胞系之间的表达差异。
[0020]本专利技术另一方面还提供一种辅助诊断口腔癌的方法，其包括应用上述发现方法中发现的基因。
[0021]有益效果：
[0022]本专利技术所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法，通过脂质组学发现和口腔癌发生发展相关的脂质代谢物，接着通过生物信息学技术找到脂质代谢物相关的基因及口腔癌发生发展相关且和生存相关的差异基因，两者取交集后得到和口腔癌脂质代谢相关且和生存相关的基因
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DGKG，其次通过Western Blot技术证实了DGKG基因在口腔癌细胞系中的表达。对OSCC的脂质谱开展系统性的研究，探索OSCC脂质代谢调控的分子机制，通过有效调节脂质代谢辅助诊断OSCC，为今后提高OSCC的临床诊疗模式提供坚实的理论基础。
附图说明
[0023]图1是本专利技术所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，脂质组学发现的70个差异脂质代谢物的热图分析。
[0024]图2是本专利技术所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，口腔癌脂质代谢相关基因和口腔癌差异表达基因的交集即为口腔癌发生发展相关的脂质代谢基因。
[0025]图3是本专利技术所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，口腔癌发生发展相关的脂质代谢基因的单因素COX回归分析。
[0026]图4是本专利技术所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，口腔癌发生发展相关的脂质代谢基因的多因素COX回归分析。
[0027]图5是本专利技术所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，根据TCGA数据库中502例HNSC组织和44例配对组织中DGKG和CLC mRNA表达水平绘制的表达柱形图。
[0028]图6是本专利技术所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，根据TCGA数据库中口腔癌样本的生存信息绘制的KM生存曲线。
[0029]图7是本专利技术所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，人类蛋白质图谱
HPA数据库中口腔癌组织和健康对照组织中DGKG的表达。
[0030]图8是本专利技术所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，Western Blot实验验证人口腔鳞状细胞癌细胞系SCC9、SCC25、Cal27和人永生化口腔角质形成细胞HaCat中DGKG的表达情况的条带图。
[0031]图9是本专利技术所述生物与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法中，Western Blot实验验证人口腔鳞状细胞癌细胞系SCC9、SCC25、Cal27和人永生化口腔角质形成细胞HaCat中DGKG的表达情况的柱状图。
具体实施方式
[0032]现详细说明本专利技术的多种示例性实施方式，该详细说明不应认为是对本专利技术的限制，而应理解为是对本专利技术的某些方面、特性和实施方案的更详细的描述。
[0033]应理解本专利技术中所述的术语仅仅是为描述特别的实施方式，并非用于限制本专利技术。另外，对于本专利技术中的数值范围，应理解为具体公开了该范围的上限和下限以及它们之间的每个中间值。在任何陈述值或陈述范围内的中间值以及任何其他陈述值或在所述范围内的中间值之间的每个较小的范围也包括在本专利技术内。这些较小范围的上限和下限可独立地包括或排除在范围内。
[0034]除非另有说明，否则本文使用的所有技术和科学术语具有本专利技术所述领本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法，其特征在于，包括：步骤一、对口腔癌患者进行非靶向脂质组学检测，得到口腔癌患者和健康人之间的差异脂质代谢物；步骤二、结合生物信息学手段，从所述差异脂质代谢物中筛选与口腔癌发病机制和预后相关的脂质代谢基因；步骤三、采用Western Blot手段验证所述脂质代谢基因在口腔癌细胞系中的表达。2.根据所述权利要求1所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法，其特征在于，所述脂质代谢基因为DGKG基因。3.根据所述权利要求1所述的与口腔癌脂质代谢相关基因的发现方法，其特征在于，所述步骤一还包括：获取训练病例集，所述训练病例集中的受试者包括患病受试者和健康受试者；采集所述受试者的血清样本，利用多元统计分析所述受试者的多个差异脂质代谢物。4.根据所述权利要求3所述的与口腔癌脂质代谢...

【专利技术属性】
技术研发人员：李希博，左莉华，岳二丽，郭晓萌，刘畅，马河心，赵红宇，孙建礼，
申请(专利权)人：郑州大学第一附属医院，
类型：发明
国别省市：