经由分离的病毒基因递送载体样品的测量属性制造技术

本公开描述了经由分离的病毒基因递送载体样品的测量属性的装置、方法和系统。在一个实施例中，该方法、系统和计算机程序产品包括：执行在一组分析仪器上分析病毒基因递送载体样品的一组逻辑操作，其中该组包括至少一个分离仪器、至少一个静态光散射仪器和至少两个浓度检测器，从而得到样品的衣壳蛋白质量m

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】经由分离的病毒基因递送载体样品的测量属性
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2020年8月11日提交的美国专利申请序列号16/991,016的优先权。


技术介绍

[0003]本公开涉及样品，并且更具体地，涉及经由分离的病毒基因递送载体样品的测量属性。

技术实现思路

[0004]本公开描述了经由分离的病毒基因递送载体(VGDV)样品的测量属性的计算机实现的方法、系统和计算机程序产品。在一个示例性实施例中，计算机实现的方法、系统和计算机程序产品包括：(1)由计算机系统执行在一组分析仪器上分析病毒基因递送载体(VGDV)样品的一组逻辑操作，其中该组包括至少一台分离仪器、至少一台静态光散射仪器和至少两台浓度检测器，从而得到样品的衣壳蛋白质量m
A
、样品的改性剂质量m
B
以及样品的改性剂摩尔质量M
B
，(2)从衣壳蛋白摩尔质量数据源接收样品的衣壳蛋白摩尔质量M
A
，(3)从注射体积数据源接收样品的注射体积v，以及(4)由计算机系统执行经由下式来计算样品的总VGDV颗粒浓度C
A
的一组逻辑操作：
[0005]C
A
＝(m
A
x N)/(M
A
x v)，
[0006]其中N是阿伏加德罗氏数(Avogrado数)。在一个实施例中，样品是慢病毒载体(Lenti viral vector)样品。在一个实施例中，样品是腺病毒载体样品。在一个实施例中，样品是腺相关病毒(AAV)样品。在一个实施例中，样品的改性剂质量m
B
是样品的核酸质量。在一个实施例中，样品的改性剂摩尔质量M
B
是样品的核酸摩尔质量。
附图说明
[0007]图1A描绘了根据一个示例性实施例的流程图。
[0008]图1B描绘了根据一个示例性实施例的框图。
[0009]图1C描绘了根据一个示例性实施例的流程图。
[0010]图1D描绘了根据一个示例性实施例的流程图。
[0011]图1E描绘了根据一个示例性实施例的流程图。
[0012]图1F描绘了根据一个示例性实施例的流程图。
[0013]图1G描绘了根据一个示例性实施例的流程图。
[0014]图2A描绘了根据一个实施例的流程图。
[0015]图2B描绘了根据一个实施例的流程图。
[0016]图3A描绘了根据一个实施例的装置。
[0017]图3B描绘了根据一个实施例的装置。
[0018]图3C描绘了根据一个实施例的装置。
[0019]图3D描绘了根据一个实施例的装置。
[0020]图4A描绘了根据一个实施例的图表。
[0021]图4B描绘了根据一个实施例的图表。
[0022]图4C描绘了根据一个实施例的图表。
[0023]图5描绘了根据一个实施例的图表。
[0024]图6A描绘了根据一个实施例的图表。
[0025]图6B描绘了根据一个实施例的图表。
[0026]图6C描绘了根据一个实施例的图表。
[0027]图7A描绘了根据一个实施例的图表。
[0028]图7B描绘了根据一个实施例的图表。
[0029]图7C描绘了根据一个实施例的图表。
[0030]图8描绘了根据示例性实施例的计算机系统。
具体实施方式
[0031]本公开描述了经由分离的病毒基因递送载体(VGDV)样品的测量属性的计算机实现的方法、系统和计算机程序产品。在一个示例性实施例中，计算机实现的方法、系统和计算机程序产品包括：(1)由计算机系统执行在一组分析仪器上分析病毒基因递送载体(VGDV)样品的一组逻辑操作，其中该组分析仪器包括至少一台分离仪器、至少一台静态光散射仪器和至少两台浓度检测器，从而得到样品的衣壳蛋白质量m
A
、样品的改性剂质量m
B
以及样品的改性剂摩尔质量M
B
，(2)从衣壳蛋白摩尔质量数据源接收样品的衣壳蛋白摩尔质量M
A
，(3)从注射体积数据源接收样品的注射体积v，以及(4)由计算机系统执行一组逻辑操作，其通过下式计算样品的总VGDV颗粒浓度C
A
：
[0032]C
A
＝(m
A
xB/(M
A
x v)，
[0033]其中N是阿伏加德罗氏数(Avogrado数)。在一个实施例中，样品是慢病毒载体(Lenti viral vector)样品。在一个实施例中，样品是腺病毒载体样品。在一个实施例中，样品是腺相关病毒(AAV)样品。在一个实施例中，样品的改性剂质量m
B
是样品的核酸质量。在一个实施例中，样品的改性剂摩尔质量M
B
是样品的核酸摩尔质量。
[0034]定义
[0035]颗粒
[0036]颗粒可以是液体样品等分试样的成分。这样的颗粒可以是不同类型和大小的分子、纳米颗粒、病毒样颗粒、脂质体、乳剂、细菌和胶体。这些颗粒的大小范围可以在纳米到微米的数量级。
[0037]溶液中大分子或颗粒种类的分析
[0038]可以通过在适当的溶剂中制备样品，然后将其等分试样注入分离系统(诸如液相色谱(LC)柱或场流分馏(FFF)通道)来实现对溶液中大分子或颗粒种类的分析，其中样品中包含的不同的颗粒种类被分成不同的成分。一旦通常基于大小、质量或柱亲和力分离，样品可以通过光散射、折射率、紫外吸收、电泳迁移率和粘度计响应的方式进行分析。
[0039]光散射
[0040]光散射(LS)是一种用于表征溶液中的大分子和各种颗粒的非侵入性技术。常用于表征大分子的两种类型的光散射检测是静态光散射和动态光散射。
[0041]动态光散射
[0042]动态光散射也称为准弹性光散射(QELS)和光子相关光谱(PCS)。在DLS实验中，使用快速光电探测器测量散射光信号中随时间变化的波动。DLS测量确定分子或颗粒的扩散系数，这进而可以用于计算它们的流体动力学半径。
[0043]静态光散射
[0044]静态光散射(SLS)包括多种技术，诸如单角度光散射(SALS)、双角度光散射(DALS)、小角度光散射(LALS)和多角度光散射(MALS)。SLS实验通常涉及测量从被细光束照射的溶液中样品散射的光的绝对强度。这种测量通常用于适当类别的颗粒/分子，以确定样品分子或颗粒的大小和结构，并且当结合样品浓度的知识时，确定重均摩尔质量。此外，作为样品浓度函数的散射光强度的非线性可以用于测量颗粒间的相互作用和缔合。
[0045]多角度光散射
[0046]多角度光散射(MALS)是一种用于测量被样品散射到多个角度的光的SLS技术。它用于通过检测溶液中的分子如何散射光来确定溶液中的分子的绝对摩尔质量和平均大小。...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种计算机实现的方法，其包括：由计算机系统执行在一组分析仪器上分析病毒基因递送载体(VGDV)样品的一组逻辑操作，其中所述组包括至少一个分离仪器、至少一个静态光散射仪器和至少两个浓度检测器，得到所述样品的衣壳蛋白质量m
A
、所述样品的改性剂质量m
B
和所述样品的改性剂摩尔质量M
B
；从衣壳蛋白摩尔质量数据源接收所述样品的衣壳蛋白摩尔质量M
A
；从注射体积数据源接收所述样品的注射体积v；和由所述计算机系统执行经由下式来计算所述样品的总VGDV颗粒浓度C
A
的一组逻辑操作：C
A
＝(m
A
x N)/(M
A
x v)，其中N是Avogrado数。2.根据权利要求1所述的方法，还包括：由所述计算机系统执行在所述组上分析所述样品的一组逻辑操作，得到所述样品的所述衣壳蛋白摩尔质量；和将所述样品的所述衣壳蛋白摩尔质量M
A
存储在所述衣壳蛋白摩尔质量数据源中。3.根据权利要求1所述的方法，其中所述分析包括经由分析技术在所述组上分析所述样品，其中所述分析技术是病毒载体分析、蛋白质缀合物分析和共聚物组成分析中的一种。4.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少一个分离仪器包括尺寸排阻色谱单元、场流分馏单元和离子交换色谱单元中的至少一个。5.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少一个静态光散射仪器包括多角度光散射仪器。6.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少两个浓度检测器包括第一波长λ1处的第一紫外吸光度检测器和第二波长λ2处的第二紫外吸光度检测器。7.根据权利要求6所述的方法，其中所述第一波长λ1为260nm，并且其中所述第二波长λ2为280nm。8.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少两个浓度检测器包括波长λ处的紫外吸光度检测器和差分折射率检测器。9.根据权利要求8所述的方法，其中所述波长λ是260nm和280nm之一。10.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少两个浓度检测器包括波长λ处的紫外吸光度检测器和荧光检测器。11.根据权利要求10所述的方法，其中所述波长λ是260nm和280nm之一。12.根据权利要求1所述的方法，其中所述至少两个浓度检测器包括差分折射率检测器和荧光检测器。13.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品的所述改性剂质量m
B
是所述样品的核酸质量。
14.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品的所述改性剂摩尔质量M
B
是所述样品的核酸摩尔质量。15.根据权利要求1所述的方法，还包括：由所述计算机系统从全改性剂摩尔质量数据源接收全VGDV样品内的全改性剂的摩尔质量M
Full
；由所述计算机系统执行经由下式来计算所述全VGDV样品的全VGDV浓度C
Full
的一组逻辑操作：C
Full
＝(m
B
x N)/(M
Full
x v)；并且由所述计算机系统执行经由下式来计算所述全VGDV样品的空VGDV浓度C
Empty
的一组逻辑操作：C
Empty
＝C
A
‑
C
Full
。16.根据权利要求15所述的方法，还包括由所述计算机系统执行在所述组上分析所述全VGDV样品的一组逻辑操作，得到所述全VGDV样品内的所述全改性剂的所述摩尔质量M
Full
；并且将所述全VGDV样品内的所述全改性剂的所述摩尔质量M
Full
存储在所述全改性剂摩尔质量数据源中。17.根据权利要求15所述的方法，其中所述改性剂是核酸。18.根据权利要求1所述的方法，还包括：由所述计算机系统执行在所述组上分析所述样品的整个VGDV信号区域并且在所述组上分析所述样品的聚集峰值区域的一组逻辑操作，得到与所述样品的所述整个VGDV信号区域对应的所述样品的VGDV整个峰值蛋白质质量m
A,ent
、与所述样品的所述整个VGDV信号区域对应的所述样品的VGDV整个峰值改性剂质量m
B,ent
、与所述样品的所述整个VGDV信号区域对应的所述样品的VGDV整个峰值蛋白质摩尔质量M
A,ent
、与所述样品的所述整个VGDV信号区域对应的所述样品的VGDV整个峰值改性剂摩尔质量M
B,ent
、与所述样品的所述聚集峰值区域对应的所述样品的VGDV聚集峰值蛋白质质量m
A,agg
、与所述样品的所述聚集峰值区域对应的所述样品的VGDV聚集峰值改性剂质量m
B,agg
、与所述样品的所述聚集峰值区域对应的所述样品的VGDV聚集峰值蛋白质摩尔质量M
A,agg
、与所述样品的所述聚集峰值区域对应的所述样品的VGDV聚集峰值改性剂摩尔质量M
B,agg
；和由所述计算机系统执行经由下式来计算与所述样品的所述整个VGDV信号区域对应的所述样品的总VGDV整个峰值颗粒浓度C
A,ent
的一组逻辑操作：C
A，ent
＝(m
A，ent
x N)/(M
A，ent
x v)；由所述计算机系统执行经由下式来计算与所述样品的所述聚集峰值区域对应的所述样品的总VGDV聚集峰值颗粒浓度C
A,agg
的一组逻辑操作：C
A，agg
＝(m
A，agg
x N)/(M
A，agg
xv)。19.根据权利要求18所述的方法，进一步包括：由所述计算机系统执行在所述组上分析全病毒基因递送载体样品的整个VGDV信号区域并且在所述组上分析所述全样品的聚集峰值区域的一组逻辑操作，得到与所述全样品的所述整个VGDV信号区域对应的所述全样品内的全改性剂的VGDV整个峰值摩尔质量M
Full,ent
以及与所述全样品的所述聚集峰值区域对应的所述全样品内的
所述全改性剂的VGDV聚集峰值摩尔质量M
Full,agg
；由所述计算机系统执行经由下式来计算与所述VGDV样品的所述整个VGDV信号区域对应的所述全样品的VGDV整个峰值全VGDV浓度C
Full,ent
的一组逻辑操作：C
Full，ent
＝(m
B，ent
x N)/(M
Full，ent
x v)；由所述计算机系统执行经由下式来计算与所述全样品的所述聚集峰值区域对应的所述全样品的VGDV聚集峰值全VGDV浓度C
Full,agg
的一组逻辑操作：C
Full，agg
＝(m
B，agg
x N)/(M
Full，agg
x v)；由所述计算机系统执行经由下式来计算与所述全样品的所述整个VGDV信号区域对应的所述全样品的VGDV整个峰值空VGDV浓度C
Empty,ent
的一组逻辑操作：C
Empty，ent
＝C
A，ent
‑
C
Full，ent
；由所述计算机系统执行经由下式来计算与所述全样品的所述聚集峰值区域对应的所述全样品的VGDV聚集峰值空VGDV浓度C
Empty,agg
的一组逻辑操作：C
Empty，agg
＝C
A，agg
‑
C
Full，agg
。20.一种计算机实现的方法，包括：由计算机系统执行在一组分析仪器上分析病毒基因递送载体(VGDV)样品的一组逻辑操作，其中所述组包括至少一个分离仪器、至少一个静态光散射仪器和至少一个浓度检测器，得到所述样品的改性剂质量m
B
、所述样品的改性剂摩尔质量M
B
和所述样品的至少一个UV消光系数；由所述计算机系统执行相对于来自所述至少一个浓度检测器的至少一个折射率增量值计算所述样品的衣壳蛋白质量m
A
和所述样品的衣壳蛋白摩尔质量M
A
的一组逻辑操作；从注射体积数据源接收所述样品的注射体积v；以及由所述计算机系统执行经由下式来计算所述样品的总VGDV颗粒浓度CA的一组逻辑操作：C
A
＝(m
A
x N)/(M
A
x v)其中N是Avogrado数。21.一种计算机实现的方法，包括：(UV
‑
UV)由计算机系统执行在一组分析仪器上分析病毒基因递送载体(VGDV)样品的一组逻辑操作，其中所述组包括至少一个分离仪器、至少一个静态光散射仪器和至少两个浓度检测器；由所述计算机系统执行相对于以下参数来计算所述样品中蛋白质的质量分数X
A
的一组逻辑操作：在第一波长λ1下从所述样品收集的紫外吸光度值A
λ1
、在第二波长λ2处从所述样品收集的紫外吸光度值A
λ2
、在所述第一波长λ1处的蛋白质的消光系数ε
Aλ1
、在所述第二波长λ2处的蛋白质的消光系数ε
Aλ2
、在所述第一波长λ1处所述样品中的改性剂的消光系数ε
Bλ1
和在所述第二波长λ2处所述样品中的改性剂的消光系数ε
Bλ2
；由所述计算机系统执行相对于以下参数来计算在所述第一波长处所述样品的消光系数ε
VGDVλ1
的一组逻辑操作：所述样品中的所述蛋白质的所述质量分数X
A
、在所述第一波长处
的所述蛋白质的所述消光系数ε
Aλ1
以及在所述第一波长处的所述样品中所述改性剂的所述消光系数ε
Bλ1
；由计算机系统执行相对于以下参数来计算在所述第二波长处所述样品的消光系数ε
VGDVλ2
的一组逻辑操作：所述样品中所述蛋白质的所述质量分数X
A
、在所述第二波长处的所述蛋白质的所述消光系数ε
Aλ2
和在所述第二波长处的所述样品中的...

【专利技术属性】
技术研发人员：M，
申请(专利权)人：怀亚特技术公司，
类型：发明
国别省市：