【技术实现步骤摘要】
生物芯片微阵列图像检测方法及装置
[0001]本专利技术涉及图像处理
,特别涉及一种生物芯片微阵列图像检测方法及装置。
技术介绍
[0002]斑点是自然场景下非常重要的形状。日常照片中的斑点通常指与周围有着颜色和灰度区别的区域。举个例子,一辆汽车可以是一个斑点,车身的轮胎也可以是一个斑点,轮胎上的一个螺丝钉也可以是一个斑点。只要这个区域与周围的区域有着颜色或者灰度的区别,就认为其在某个观察维度下就是一个斑点,检测该区域位置和灰度就会有实用价值。
[0003]现有微阵列生物芯片的结果检测方法,多采用图像识别的方式,通过识别图像上的微阵列斑点来进行检测结果判读。例如采用SimpleBlobDetector(Python提供的组件)从微阵列生物芯片的图像中提取blobs,以定位图像中斑点的位置,其中,blob是指图像中具有某些共同属性(如灰度值、圆度等)的一组连通像素。但由于在进行生物芯片检测实验时经常存在杂质沉积、芯片烘干过程产生水渍等问题,且图像采集时也可能有噪点的出现,进而导致结果检测时在微阵列图像中出现除探针 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种生物芯片微阵列图像检测方法,其特征在于,包括:接收微阵列图像;根据斑点矩阵的预设信息,对所述微阵列图像进行标注,得到所述微阵列图像中斑点矩阵的每个边缘的分析范围;在每个边缘的分析范围内,以第一颗粒度进行区域图像扫描,得到斑点矩阵的范围;在斑点矩阵的范围内,以第二颗粒度进行区域图像扫描,确定斑点矩阵中的杂交斑点信息;基于所述杂交斑点信息和所述斑点矩阵的预设信息,确定未产生杂交反应的斑点信息;结合所述杂交斑点信息和所述未产生杂交反应的斑点信息,得到微阵列图像检测结果。2.根据权利要求1所述的生物芯片微阵列图像检测方法,其特征在于,在每个边缘的分析范围内,以第一颗粒度进行区域图像扫描,得到斑点矩阵的范围,包括:在每个边缘的分析范围内,按照每个边缘的第一预设扫描方向,以第一颗粒度进行区域图像扫描,得到每个边缘的分析范围内的多组灰度统计数据;确定所述多组灰度统计数据中每组灰度统计数据的波动性;根据每组灰度统计数据的波动性,确定斑点矩阵的每个边缘的位置;基于斑点矩阵的每个边缘的位置,得到斑点矩阵的范围。3.根据权利要求2所述的生物芯片微阵列图像检测方法,其特征在于,所述每组灰度统计数据至少包括:每组灰度均值和每组灰度方差;确定所述多组灰度统计数据中每组灰度统计数据的波动性,包括:若该组灰度方差小于或等于该组灰度均值,确定该组灰度统计数据为平滑数据;若该组灰度方差大于该组灰度均值,确定该组灰度统计数据为波动数据。4.根据权利要求2所述的生物芯片微阵列图像检测方法,其特征在于,所述每组灰度统计数据至少包括:每组灰度均值、每组灰度方差和每组灰度极差;确定所述多组灰度统计数据中每组灰度统计数据的波动性,包括:若该组灰度方差小于或等于该组灰度均值,且该组灰度极差小于该组灰度方差的两倍,确定该组灰度统计数据为平滑数据;若该组灰度方差大于该组灰度均值,确定该组灰度统计数据为波动数据。5.根据权利要求1所述的生物芯片微阵列图像检测方法,其特征在于,在斑点矩阵的范围内,以第二颗粒度进行区域图像扫描,确定斑点矩阵中的杂交斑点信息,包括:在斑点矩阵的范围内,按照第二预设扫描方向,以第二颗粒度进行区域图像扫描,确定行连续平滑区域;在斑点矩阵的范围内,按照第三预设扫描方向,以第二颗粒度进行区域图像扫描,确定列连续平滑区域;在斑点矩阵的范围内,剔除所述行连续平滑区域和所述列连续平滑区域,确定所述杂交斑点信息。6.根据权利要求5所述的生物芯片微阵列图像检测方法,其特征在于,所述杂交斑点信息至少包括:杂交斑点的位置信息和杂交斑点的尺寸信息;
基于所述杂交斑点信息和所述斑点矩阵的预设信息,确定未产生杂交反应的斑点信息,包括:根据杂交斑点的尺寸信息,得到杂交斑点的尺寸均值;在所述行连续平滑区域和所述列连续平滑区域中,基于所述尺寸均值和所述斑点矩阵的预设信息,确定未产生杂交反应的斑点的位置信息和未产生杂交反应的斑点的尺寸信息。7.根据权利要求1所述的生物芯片微阵列图像检测方法,其特征在于,结合所述杂交斑点信息和所述未产生杂交反应的斑点信息,得到微阵列图像检测结果,包括:基于所述杂交斑点信息和所述未产生杂交反应的斑点信息,计算斑点矩阵中每个斑点的灰度值;根据所述杂交斑点信息和所述未产生杂交反应的斑点信息,得到每个斑点的尺寸信息;将每个斑点的灰度值和每个斑点的尺寸信息,作为微阵列图像检测结果。8.一种生物芯片微阵列图像检测装置,其特征在于,包括:图像接收模块,用于接收微阵列图像;边缘分析范围确定模块,用于根据斑点矩阵的预设信息,对所述微阵列图像进行标注,得到所述微阵列图像中斑点矩阵的每个边缘的分析范围;矩阵范围确定模块,用于在每个边缘的分析...
【专利技术属性】
技术研发人员:徐青雷,胡立教,
申请(专利权)人:北京百奥纳芯生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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