新颖OMNI-59、61、67、76、79、80、81和82CRISPR核酸酶制造技术

本发明专利技术提供一种非天然存在的组合物，其包含包括与选自由SEQ ID NO:1

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】新颖OMNI
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59、61、67、76、79、80、81和82CRISPR核酸酶
[0001]在整个本申请中，引用了各种公开案，包含括号中引用的公开案。本申请中所提及的所有公开案的公开内容特此以引用的方式整体并入本申请中，以便提供对本专利技术所涉及的领域和可与本专利技术一起使用的领域中的特征的额外描述。
[0002]序列表引用
[0003]本申请以引用的方式并入有核苷酸序列，所述序列存在于被命名为“210604_91412
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A
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PCT_SequenceListing_AWG.txt”的文件中，所述文件的大小是245千字节并且在与MS
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Windows具有操作系统兼容性的IBM
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PC机格式下创建于2021年6月2日，含于2021年6月4日提交的文本文件中作为本申请的一部分。


[0004]本专利技术尤其涉及用于基因组编辑的组合物和方法。

技术介绍

[0005]细菌和古细菌适应性免疫的规律间隔成簇短回文重复序列(CRISPR)系统展本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种非天然存在的组合物，其包含包括与选自由SEQ ID NO：5、1
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4或6
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8组成的群组的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列的CRISPR核酸酶，或包括编码所述CRISPR核酸酶的序列的核酸分子。2.根据权利要求1所述的组合物，其进一步包含一或多种RNA分子或编码所述一或多种RNA分子中的任一者的DNA多核苷酸，其中所述一或多种RNA分子和所述CRISPR核酸酶不一起天然存在，并且所述一或多种RNA分子被配置成与所述CRISPR核酸酶形成复合物和/或将所述复合物靶向靶位点。3.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子包含选自由SEQ ID NO：63
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90组成的群组的序列。4.根据权利要求3所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子是包含引导序列部分和选自由SEQ ID NO：63、64、71
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73和81
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83组成的群组的序列的CRISPR RNA(crRNA)分子。5.根据权利要求4所述的组合物，其进一步包含包括由SEQ ID NO：65
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69、74
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79和84
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89组成的群组中所阐述的序列的反式激活CRISPR RNA(tracrRNA)分子。6.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子是包含引导序列部分和选自由SEQ ID NO：63
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90组成的群组的序列的单引导RNA(sgRNA)分子。7.根据权利要求3至6中任一权利要求所述的组合物，其中所述引导序列部分的长度为25或26个核苷酸。8.根据权利要求3至7中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：5的D8、E502、H735或D738处的氨基酸取代形成的切口酶。9.根据权利要求3至7中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：5的D586、H587或N610处的氨基酸取代形成的切口酶。10.根据权利要求3至7中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：5的D8、E502、H735或D738处的氨基酸取代和在SEQ ID NO：5的D586、H587或N610处的氨基酸取代形成的非催化活性核酸酶。11.根据权利要求3至10中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且所述CRISPR核酸酶包含结构域A，其包含与和SEQ ID NO：5的氨基酸1到40具有至少90％序列一致性的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列。12.根据权利要求3至11中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且所述CRISPR核酸酶包含结构域B，其包含与和SEQ ID NO：5的氨基酸41到76具有至少90％序列一致性的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列。13.根据权利要求3至12中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与
SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且所述CRISPR核酸酶包含结构域C，其包含与和SEQ ID NO：5的氨基酸77到228具有至少90％序列一致性的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列。14.根据权利要求3至13中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且所述CRISPR核酸酶包含结构域D，其包含与和SEQ ID NO：5的氨基酸229到446具有至少90％序列一致性的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列。15.根据权利要求3至14中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且所述CRISPR核酸酶包含结构域E，其包含与和SEQ ID NO：5的氨基酸447到507具有至少90％序列一致性的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列。16.根据权利要求3至15中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且所述CRISPR核酸酶包含结构域F，其包含与和SEQ ID NO：5的氨基酸539到648具有至少90％序列一致性的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列。17.根据权利要求3至16中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且所述CRISPR核酸酶包含结构域G，其包含与和SEQ ID NO：5的氨基酸655到822具有至少90％序列一致性的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列。18.根据权利要求3至17中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且所述CRISPR核酸酶包含结构域H，其包含与和SEQ ID NO：5的氨基酸823到921具有至少90％序列一致性的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列。19.根据权利要求3至18中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：5的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且所述CRISPR核酸酶包含结构域I，其包含与和SEQ ID NO：5的氨基酸922到1062具有至少90％序列一致性的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列。20.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：1中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子包含选自由SEQ ID NO：25
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29组成的群组的序列。21.根据权利要求20所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：1中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子是包含引导序列部分和SEQ ID NO：25中所阐述的序列的CRISPR RNA(crRNA)分子。22.根据权利要求21所述的组合物，其进一步包含包括由SEQ ID NO：26
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28组成的群组中所阐述的序列的反式激活CRISPR RNA(tracrRNA)分子。23.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：1中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子是包含引导序列部分和选自由SEQ ID NO：25
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29组成的群组的序列的单引导RNA(sgRNA)分子。24.根据权利要求20至23中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含
与SEQ ID NO：1的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：1的D24、E557、H785或D788处的氨基酸取代形成的切口酶。25.根据权利要求20至23中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：1的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：1的E644、H645或N668处的氨基酸取代形成的切口酶。26.根据权利要求20至23中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：1的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：1的D24、E557、H785或D788处的氨基酸取代和在SEQ ID NO：1的E644、H645或N668处的氨基酸取代形成的非催化活性核酸酶。27.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：2中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子包含选自由SEQ ID NO：30
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39组成的群组的序列。28.根据权利要求27所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：2中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子是包含引导序列部分和选自由SEQ ID NO：30
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32组成的群组的序列的CRISPR RNA(crRNA)分子。29.根据权利要求28所述的组合物，其进一步包含包括由SEQ ID NO：33
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38组成的群组中所阐述的序列的反式激活CRISPR RNA(tracrRNA)分子。30.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：2中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子是包含引导序列部分和选自由SEQ ID NO：30
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39组成的群组的序列的单引导RNA(sgRNA)分子。31.根据权利要求27至30中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：2的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：2的D19、E528、H750或D753处的氨基酸取代形成的切口酶。32.根据权利要求27至30中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：2的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：2的D609、H610或N633处的氨基酸取代形成的切口酶。33.根据权利要求27至30中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：2的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：2的D19、E528、H750或D753处的氨基酸取代和在SEQ ID NO：2的D609、H610或N633处的氨基酸取代形成的非催化活性核酸酶。34.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：3中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子包含选自由SEQ ID NO：40
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52组成的群组的序列。35.根据权利要求34所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：3中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子是包含引导序列部分和选自由SEQ ID NO：40
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43组成的群组的序列的CRISPR RNA(crRNA)分子。36.根据权利要求35所述的组合物，其进一步包含包括由SEQ ID NO：44
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51组成的群组中所阐述的序列的反式激活CRISPR RNA(tracrRNA)分子。37.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：3中所阐
述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子是包含引导序列部分和选自由SEQ ID NO：40
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52组成的群组的序列的单引导RNA(sgRNA)分子。38.根据权利要求34至37中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：3的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：3的D8、E503、H729或D732处的氨基酸取代形成的切口酶。39.根据权利要求34至37中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：3的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：3的E584、H585或N607处的氨基酸取代形成的切口酶。40.根据权利要求34至37中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：3的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：1的D8、E503、H729或D732处的氨基酸取代和在SEQ ID NO：3的E584、H585或N607处的氨基酸取代形成的非催化活性核酸酶。41.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：4中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子包含选自由SEQ ID NO：53
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62组成的群组的序列。42.根据权利要求41所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：4中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子是包含引导序列部分和选自由SEQ ID NO：53
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55组成的群组的序列的CRISPR RNA(crRNA)分子。43.根据权利要求42所述的组合物，其进一步包含包括由SEQ ID NO：56
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61组成的群组中所阐述的序列的反式激活CRISPR RNA(tracrRNA)分子。44.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：4中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子是包含引导序列部分和选自由SEQ ID NO：53
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62组成的群组的序列的单引导RNA(sgRNA)分子。45.根据权利要求41至44中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：4的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：4的D12、E543、H770或D773处的氨基酸取代形成的切口酶。46.根据权利要求41至44中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：4的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：4的E630、H631或N654处的氨基酸取代形成的切口酶。47.根据权利要求41至44中任一权利要求所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：4的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且其中所述CRISPR核酸酶是通过在SEQ ID NO：4的D12、E543、H770或D773处的氨基酸取代和在SEQ ID NO：4的E630、H631或N654处的氨基酸取代形成的非催化活性核酸酶。48.根据权利要求2所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：6中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子包含选自由SEQ ID NO：91
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98组成的群组的序列。49.根据权利要求48所述的组合物，其中所述CRISPR核酸酶包含与SEQ ID NO：6中所阐述的氨基酸序列具有至少90％一致性的序列，并且至少一种RNA分子是包含引导序列部分和选自由SEQ ID NO：91和92组成的群组的序列的CRISPR RNA(crRNA)分子。
50.根据权利要求49所述的组合物，其...

【专利技术属性】
技术研发人员：L，
申请(专利权)人：埃门多生物公司，
类型：发明
国别省市：