一种完整N-糖肽定量分析方法和系统技术方案

本发明专利技术属于蛋白组学技术领域，具体涉及一种完整N

【技术实现步骤摘要】
一种完整N
‑
糖肽定量分析方法和系统


[0001]本专利技术属于蛋白组学
，具体涉及一种完整N
‑
糖肽定量分析方法和系统。

技术介绍

[0002]糖蛋白质组学是蛋白质组学的重要分支学科，是以糖蛋白质组为研究对象，研究细胞、组织或生物体糖蛋白质组成及其变化规律的科学。以往研究表明蛋白质糖基化广泛参与各种生理与病理调控，糖蛋白或糖基化修饰的异常改变往往与各种疾病的发生发展密切相关。在糖蛋白水平，FDA批准的肿瘤标志物超过三分之一都是糖蛋白，例如乳腺癌标志物Her2/neu，肝癌标志物AFP，胰腺癌标志物CA19
‑
9，前列腺癌标志物PSA，卵巢癌标志物OVA1和CA125；在糖型和糖基化位点水平，人们也发现疾病发生发展进程中，大量糖链和糖基化修饰位点也会发生异常改变。因此，糖蛋白质组的研究目前主要是分析完整糖肽，可同时得到糖蛋白、糖修饰位点以及糖链三维信息，这对于疾病的诊断、分型、预后、治疗以及分子机制研究具有重要意义。
[0003]基于质谱的完整糖肽分析策略主要是Bottom u本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种完整N
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糖肽定量分析方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤1，进行糖蛋白质样本前处理，进行质谱检测得到N
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糖肽质谱数据；步骤2，采用搜库软件进行完整N
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糖肽定性分析；步骤3，采用PANDA软件进行完整N
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糖肽定量分析，其中，PANDA软件参数设置如下：(1)所述同位素峰检测个数根据母离子信号强度设置；(2)在构建糖基化肽段XIC时，XIC的截断时间为1
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3分钟。2.按照权利要求1所述的完整N
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糖肽定量分析方法，其特征在于，步骤1中，所述糖蛋白质样本前处理的步骤包括：蛋白质提取、变性、还原、烷基化、蛋白酶切以及完整N
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糖肽富集。3.按照权利要求1所述的完整N
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糖肽定量分析方法，其特征在于：步骤1中，采用基于EThcD
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sceHCD碎裂模式的质谱检测方法采集得到所述N
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糖肽质谱数据。4.按照权利要求1所述的完整N
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糖肽定量分析方法，其特征在于：步骤2中，所述搜库软件选自Byonic或pGlyco。5.按照权利要求1所述的完整N
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糖肽定量分析方法，其特征在于：所述PANDA软件参数设置如下：(1)当母离子强度小于等于1
×
e8时检测3
‑
4个同位素峰，当母离子强度大于1
×
e8时检测6个同位素峰；(2)在构建糖基化肽段XIC时，XIC的截断时间为2分钟。6.一种完整N
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糖肽定量分析系统，其...

【专利技术属性】
技术研发人员：张勇，杨浩，
申请(专利权)人：四川大学华西医院，
类型：发明
国别省市：